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Oryza sativa
cluster # 9167 cluster # 9167       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9167#0 length = 967 sequences # 6  
consensusID : consensus_9167#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 967
fasta sequence 
                              [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGGCATTGCGATTTGCGAATCTATCGACGCCACCGATCGACCTACGCCTGCAAATTAAATTCCGCAGCTAGCTAGCAACAACAACTCCCGACCGGCCGCGGCCACGACGCGCGCACGGACGGACGGACGACGACATGCCTCGCGCACTGATCGCCCTCGCGTCGGCTGTCCTGCTGCTGGTGGCCGCGGTGGCGCCGCCGCTCGCCGCCGCGGACGACGGCGGCGCCGGAGTCCCGGGGGAAGGGAAGCTGGAGAGCGCGGGGTCCGCGATTAAGTCGGCGGCCGCCAACGCGTTCGGGGTCGGCTCCGACATCGGCGGCGTCCCGGTCAACCCGTCGCCGGGTGGCGCCAACGCTTAATATATTTACAGTATTACAGTGGCTGTTTCCTTGTGACTTTAATTTGTCAGAGTTTTTGGAGGCCATTTCATTCCATATATACCTAATTAATTACTACCTAAATACTAGTATATGTAATTAATCACGCTTGCTTGTGT]

[+] EMBL AU173269             [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AU184182             [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AU184195             [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AU033244             [                                                                 nCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CF325323             [                                                                                                                         TTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AK109565             [                                                                                                                                            TGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGGCATTGCGATTTGCGAATCTATCGACGCCACCGATCGACCTACGCCTGCAAATTAAATTCCGCAGCTAGCTAGCAACAACAACTCCCGACCGGCCGCGGCCACGACGCGCGCACGGACGGACGGACGACGACATGCCTCGCGCACTGATCGCCCTCGCGTCGGCTGTCCTGCTGCTGGTGGCCGCGGTGGCGCCGCCGCTCGCCGCCGCGGACGACGGCGGCGCCGGAGTCCCGGGGGAAGGGAAGCTGGAGAGCGCGGGGTCCGCGATTAAGTCGGCGGCCGCCAACGCGTTCGGGGTCGGCTCCGACATCGGCGGCGTCCCGGTCAACCCGTCGCCGGGTGGCGCCAACGCTTAATATATTTACAGTATTACAGTGGCTGTTTCCTTGTGACTTTAATTTGTCAGAGTTTTTGGAGGCCATTTCATTCCATATATACCTAATTAATTACTACCTAAATACTAGTATATGTAATTAATCACGCTTGCTTGTGT]




>consensus_9167#0
TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTG
TTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGT
TTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGG
GCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTT
TTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAG
TGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTA
AACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTG
GTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGGCATTGC
GATTTGCGAATCTATCGACGCCACCGATCGACCTACGCCTGCAAATTAAATTCCGCAGCT
AGCTAGCAACAACAACTCCCGACCGGCCGCGGCCACGACGCGCGCACGGACGGACGGACG
ACGACATGCCTCGCGCACTGATCGCCCTCGCGTCGGCTGTCCTGCTGCTGGTGGCCGCGG
TGGCGCCGCCGCTCGCCGCCGCGGACGACGGCGGCGCCGGAGTCCCGGGGGAAGGGAAGC
TGGAGAGCGCGGGGTCCGCGATTAAGTCGGCGGCCGCCAACGCGTTCGGGGTCGGCTCCG
ACATCGGCGGCGTCCCGGTCAACCCGTCGCCGGGTGGCGCCAACGCTTAATATATTTACA
GTATTACAGTGGCTGTTTCCTTGTGACTTTAATTTGTCAGAGTTTTTGGAGGCCATTTCA
TTCCATATATACCTAATTAATTACTACCTAAATACTAGTATATGTAATTAATCACGCTTG
CTTGTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)