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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9183#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1161 fasta sequence
[TGAAGGAGTAGAAAAACAGTAGTGAAGCATTTGCAGGGGTTACAGCTGGTGCTCCATTTTCTGTTGAATCTGGAGTTAGGCTGGTGCCGCATAGAACAGTGGTTGCTGTGCCTGCTGGCATCAGTCATCCTCCTTCAATGTCTTCTAGTGGAGTTGGTATTATCTACCCACTGTTTGCCAGAATTCAACAAAGAGCATACACTAACGCTCAAGTTGCCCATAGTGCTAATCAGATACCGAATCCACAGACATCTCAGTATCATGAAGCAGGTACCCTAGGATCTCCTGTTGATATCAATGCGGAAAACGGCACTCAGACTTCCCCTGGGGAGCAGAATGGCCAGGGGCCTTTTTCTCAGTTGATGGATAGTATCCCTTGGATTGCATCACTCCTTTCTGGGGAAAA-TCTCGAGTAAATGGCACAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGATGGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGAGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCC--TTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC----TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTATGATTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CF328624 [TGAAGGAGTAGAAAAACAGTAGTGAAGCATTTGCAGGGGTTACAGCTGGTGCTCCATTTTCTGTTGAATCTGGAGTTAGGCTGGTGCCGCATAGAACAGTGGTTGCTGTGCCTGCTGGCATCAGTCATCCTCCTTCAATGTCTTCTAGTGGAGTTGGTATTATCTACCCACTGTTTGCCAGAATTCAACAAAGAGCATACACTAACGCTCAAGTTGCCCATAGTGCTAATCAGATACCGAATCCACAGACATCTCAGTATCATGAAGCAGGTACCCTAGGATCTCCTGTTGATATCAATGCGGAAAACGGCACTCAGACTTCCCCTGGGGAGCAGAATGGCCAGGGGCCTTTTTCTCAGTTGATGGATAGTATCCCTTGGATTGCATCACTCCTTTCTGGGGAAAA TCTCGAGTAAATGGCACAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGATGGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGAGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCC TTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACAT ]
[+] EMBL AK062297 [ ATTGCATCACTCTTTTCTGGGGAAAATTCTCGAGTAAATGGCACAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGATGGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGTGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCC TTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATCTT TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTA ]
[-] EMBL CF328625 [ GGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGAGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCCCTTTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTTTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATG TTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATCTTCTTTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTATGATTTGTAAAAAAAAAAA ]
[-] EMBL CF331720 [ ATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTTTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAAAAAaaaaaaaa ]
[+] EMBL CF331719 [ ATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAAAAAaa ]
[+] EMBL CF327008 [ CAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC TTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGGGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTATGATTTGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||