These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9183#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1161 fasta sequence [TGAAGGAGTAGAAAAACAGTAGTGAAGCATTTGCAGGGGTTACAGCTGGTGCTCCATTTTCTGTTGAATCTGGAGTTAGGCTGGTGCCGCATAGAACAGTGGTTGCTGTGCCTGCTGGCATCAGTCATCCTCCTTCAATGTCTTCTAGTGGAGTTGGTATTATCTACCCACTGTTTGCCAGAATTCAACAAAGAGCATACACTAACGCTCAAGTTGCCCATAGTGCTAATCAGATACCGAATCCACAGACATCTCAGTATCATGAAGCAGGTACCCTAGGATCTCCTGTTGATATCAATGCGGAAAACGGCACTCAGACTTCCCCTGGGGAGCAGAATGGCCAGGGGCCTTTTTCTCAGTTGATGGATAGTATCCCTTGGATTGCATCACTCCTTTCTGGGGAAAA-TCTCGAGTAAATGGCACAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGATGGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGAGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCC--TTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC----TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTATGATTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CF328624 [TGAAGGAGTAGAAAAACAGTAGTGAAGCATTTGCAGGGGTTACAGCTGGTGCTCCATTTTCTGTTGAATCTGGAGTTAGGCTGGTGCCGCATAGAACAGTGGTTGCTGTGCCTGCTGGCATCAGTCATCCTCCTTCAATGTCTTCTAGTGGAGTTGGTATTATCTACCCACTGTTTGCCAGAATTCAACAAAGAGCATACACTAACGCTCAAGTTGCCCATAGTGCTAATCAGATACCGAATCCACAGACATCTCAGTATCATGAAGCAGGTACCCTAGGATCTCCTGTTGATATCAATGCGGAAAACGGCACTCAGACTTCCCCTGGGGAGCAGAATGGCCAGGGGCCTTTTTCTCAGTTGATGGATAGTATCCCTTGGATTGCATCACTCCTTTCTGGGGAAAA TCTCGAGTAAATGGCACAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGATGGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGAGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCC TTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACAT ] [+] EMBL AK062297 [ ATTGCATCACTCTTTTCTGGGGAAAATTCTCGAGTAAATGGCACAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGATGGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGTGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCC TTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATCTT TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTA ] [-] EMBL CF328625 [ GGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGAGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCCCTTTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTTTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATG TTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATCTTCTTTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTATGATTTGTAAAAAAAAAAA ] [-] EMBL CF331720 [ ATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTTTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAAAAAaaaaaaaa ] [+] EMBL CF331719 [ ATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGATAAAGATCTTCATGTCCTCCGGGGTCACCGTTTTGCAAGATAAGCCGAGAATTTTGCCGATTCTCACTGCGAGGATGGACTGTCATGAATGTCTTGACAGAGTTGAGGGCAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC TTTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGAGAATTTTTGCCACTTAAAAAaa ] [+] EMBL CF327008 [ CAGTGGATTATTATTATTTGGCAGTGTATAGTTGGCATCCGGTTCATTAGTCAAGGCACCATC TTTTTTTTTGCCCATTTCCTGCGGATCGGTTGTAATGTTATTTTACTATCCTATCTGTAGAAATTCGATTCAATTGGGGTTAAATTATGCCTGCAATTAACCAAAAGCTTCGTTTGGTAGTAATTGCTGTAGCATGTGGGGAATTTTTGCCACTTAATAATACCCTCTATGATTTGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||