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Oryza sativa
cluster # 9232 cluster # 9232       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9232#0 length = 816 sequences # 6  
consensusID : consensus_9232#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 816
fasta sequence 
                              [GAGTAGAAAATACATCTCGATCAGCTGCGACTGCGAGCAGCTAATTACAGAGTAAGGGAAGTTGGTACTATACCTGTCTTGGCCGTTTCCTTTGCTGGTTGTGTTTTGTGCTTGCATTCATGGCGACCTTCACCGAACGTACCCGTCTCCTCGCGGCGCTGCTTGTCGTCGTCTCCGCGGTGATCATCGGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCACGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTGCTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCGGCCCCCG-CCATGTTGTGTGCAACGACGGG-CCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTCCCTA-CCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTC-AGACGCCGCCGGCGCCACCGTCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGACTGTTCATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAGTACGTG-CGTGTGATAAAAACGTACGCACACCAGAGATTACATACGCATATTGTACGTGCGGCGAACGGCCGGGCGCTAGCTCTCTTGAGCGGGGTACAACGCTAGCTACAGCACACTATTGTGTTATTACTAATTAAAAACGAATAATGCCCGTCCCGTGTGCTTGTGTTTCATTAGCTGGAATAGAACAGGTGTGAGCGTGTAACTATGCGGTCTAAAAAGGAAATAAAAGACTGGTGTTGTCAATGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCG]

[+] EMBL CF334273             [GAGTAGAAAATACATCTCGATCAGCTGCGACTGCGAGCAGCTAATTACAGAGTAAGGGAAGTTGGTACTATACCTGTCTTGGCCGTTTCCTTTGCTGGTTGTGTTTTGTGCTTGCATTCATGGCGACCTTCACCGAACGTACCCGTCTCCTCGCGGCGCTGCTTGTCGTCGTCTCCGCGGTGATCATCGGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCGCGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTGCTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCGGCCCCCG CCATGTTGTGTGCAACGACGGG CCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTCCCTA CCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTC AGACGCCGCCGGCGCCACCGTCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGACTGTTCATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAGTACGTG CGTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AK061129             [                   ATCAGCTGCGACTGCGAGCAGCTAATTACAGAGTAAGGGAAGTTGGTACTATACCTGTCTTGGCCGTTTCCTTTGCTGGTTGTGTTTTGTGCTTGCATTCATGGCGACCTTCACCGAACGTACCCGTCTCCTCGCGGCGCTGCTTGTCGTCGTCTCCGCGGTGATCATCGGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCACGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTGCTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCGGCCCCCG CCATGTTGTGTGCAACGACGGG CCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTCCCTA CCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTC AGACGCCGCCGGCGCCACCGTCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGACTGTTCATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAGTACGTG CGTGTGATAAAAACGTACGCACACCAGAGATTACATACGCATATTGTACGTGCGGCGAACGGCCGGGCGCTAGCTCTCTTGAGCGGGGTACAACGCTAGCTACAGCACACTATTGTGTTATTACTAATTAAAAACGAATAATGCCCGTCCCGTGTGCTTGTGTTTCATTAGCTGGAATAGAACAGGTGTGAGCGTGTAACTATGCGGTCTAAAAAGGAAATAAAAGAC                                          ]
[+] EMBL CF338002             [                   ATCAGCTGCGACTGCGAGCAGCTAATTACAGAGTAAGGGAAGTTGGTACTATACCTGTCTTGGCCGTTTCCTTTGCTGGTTGTGTTTTGTGCTTGCATTCATGGCGACCTTCACCGAACGTACCCGTCTCCTCGCGGCGCTGCTTGTCGTCGTCTCCGCGGTGATCATCGGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCACGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTGCTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCGGCCCCCG CCATGTTGTGTGCAACGACGGG CCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTCCCTA CCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTCAAGNC CCGCCGGCGCCACCGTCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGGCTGTTCATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAGTACGTGCCGTGTGATAAAAACGTACGCACACCAGAGATTACATACGCATATTGTACGTGCGGCGAACGGCCGGGCGCT                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CA755501             [                                          AATTACAGAGTAAGGGAAGTTGGTACTATACCTGTCTTGGCCGTTTCCTTTGCTGGTTGTGTTTTGTGCTTGCATTCATGGCGACCTTCACCGAACGTACCCGTCTCCTCGCGGCGCTGCTTGTCGTCGTCTCCGCGGTGATCATCGGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCACGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTGCTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCGGCCCCCG CCATGTTGTGTGCAACGACGGG CCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTCCCTA CCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTC AGACGCCGCCGGCGCCACCGTCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGACTGTTCATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAGTACGTG CGTGTGATAAAAACGTACGCACACCAGAGATTACATACGCATATTGTACGTGCGGCGAACGGCCGGGCGCTAGCTCTCTTGAGCGGGGTACAACGCTAGCTACAGCACACTATTGTGTTATTACTAATTAAAAACGAATAATGCCCGTCCCGTGTGCTTGTGTTTCATTAGCTGGAATAGAACAGGTGTGAGCGTGTAACTATGCGGTCTAAAAAGGAAATAAAAGACTGGTGTTGTCAATGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCG]
[+] EMBL CA755663             [                                          AATTACAGAGTAAGGGAAGTTGGTACTATACCTGTCTTGGCCGTTTCCTTTGCTGGTTGTGTTTTGTGCTTGCATTCATGGCGACCTTCACCGAACGTACCCGTCTCCTCGCGGCGCTGCTTGTCGTCGTCTCCGCGGTGATCATCGGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCACGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTGCTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCGGCCCCCG CCATGTTGTGTGCAACGACGGG CCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTCCCTA CCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTC AGACGCCGCCGGCGCCACCGTCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGACTGTTCATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAGTACGTG CGTGTGATAAAAACGTACGCACACCAGAGATTACATACGCATATTGTACGTGCGGCGAACGGCCGGGCGCTAGCTCTCTTGAGCGGGGTACAACGCTAGCTACAGCACACTATTGTGTTATTACTAATTAAAAACGAATAATGCCCGTCCCGTGTGCTTGTGTTTCATTAGCTGGAATAGAACAGGTGTGAGCGTGTAACTATGCGGTCTAAAAAGGAAATAAAAGACTGGTGTTGTCAATGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCG]
[-] EMBL CF338003             [                                                                                                                                                                                            GGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCACGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTGCTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCGGCCCCCGNCCATGTTGTGTGCAACGACGGGCCCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTCCCTACCCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTC AGACGCCGCCGGCGCCACCGTCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGGCTGTTCATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAGTACGTG CGTGTGATAAAAACGTACGCACACCAGAGATTACATACGCATATTGTACGTGCGGCGAACGGCCGGGCGCTAGCTCTCTTGAGCGGGGTACAACGCTAGCTACAGCACACTATTGTGTTATTACTAATTAAAAACGAATAATGCCCGTCCCGTGTGCTTGTGTTTCATTAGCTGGAATAGAACAGGTGTGAGCGTGTAACTATGCGGTCTAAAAAGGAAATAAAAGACTGGTGTTGTCAATGCTAAAAAAAAAA                ]




>consensus_9232#0
GAGTAGAAAATACATCTCGATCAGCTGCGACTGCGAGCAGCTAATTACAGAGTAAGGGAA
GTTGGTACTATACCTGTCTTGGCCGTTTCCTTTGCTGGTTGTGTTTTGTGCTTGCATTCA
TGGCGACCTTCACCGAACGTACCCGTCTCCTCGCGGCGCTGCTTGTCGTCGTCTCCGCGG
TGATCATCGGCTGCTCCGTCCACGTCTGCCACGGCGCCCAAGAGGCTGACCTGCAGGCTG
CTGGCTACTACCGACGCGGCGGCAGCATGGATGATCCCGACTTCGATTTTCCCTTTCCCG
GCCCCCGCCATGTTGTGTGCAACGACGGGCCTTGCCGCACCGGCCCAGGCCGATTACGTC
CCTACCCCTTTCCGCGACCTTTGCCGTACCGTCAGACGCCGCCGGCGCCACCGTCGCCGC
CGCTGCCGCCACCGCAGAACAAACAGATCCCGCCTCCGTGATGAATTGATGATGACTGTT
CATGCCGGCCGGCCGGCCGTCATGATGCCACTTAATTATATATGCATATGGCTAATTAAG
TACGTGCGTGTGATAAAAACGTACGCACACCAGAGATTACATACGCATATTGTACGTGCG
GCGAACGGCCGGGCGCTAGCTCTCTTGAGCGGGGTACAACGCTAGCTACAGCACACTATT
GTGTTATTACTAATTAAAAACGAATAATGCCCGTCCCGTGTGCTTGTGTTTCATTAGCTG
GAATAGAACAGGTGTGAGCGTGTAACTATGCGGTCTAAAAAGGAAATAAAAGACTGGTGT
TGTCAATGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)