cluster # 925

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Oryza sativa
cluster # 925 cluster # 925 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_925#0 length = 639 sequences # 2

consensusID : consensus_925#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 639
fasta sequence

                              [GACGCAGCCTCCATCCCCAGACCCCAGCCGCCGCCGCCCCTCTCCTCTCCGGTGAAGTTGGGTTGCTTCGTCATCGTCCAACCACACCATCCCAAAGCCGCCGCTCGGCTGCCGCCGCCATTACGTCACTACTGGAACTTCCTTCCAGGCAACCCACCACCCGCCACCGCACCTGCCCATAAAACCCGGCCACATCCATCAAGCAGCAACAGCAACTACCAGTTTGGAACTACCATCCCCCGTGACCACCTGCCCGCTTTCCCGCACAAAGTTCACTAGTAGTTACTGCTCCAATATGGAGTAGTACTAATCCTCCGTATACTCGAATCCCAGGATCTCTCCCGGTCGGATGCTCACTCGTCTTCCCCACCACTCGTCGCCCCTTGTCTTCCCCTGCCGCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGACGCTCTCCACCGCCACCGGCAGCAACTCCACCACCGTCAAGATGGCTCGGTCGGCGCTCGACGAGGTCACCG-ACGCCGGCGCCTTCGACCGGTCGCCGTCCACCTTCCGGAGCTCTATCTCCAGGGACAGCTCCGCCCGGTTCCCCGCCGTGCCGGGGAGGTACCACCTCTACG-T-CTACTCGTGCCCTGGGCGTNACGTGCTCGCTAACTNAAG]

[+] EMBL CB637951             [GACGCAGCCTCCATCCCCAGACCCCAGCCGCCGCCGCCCCTCTCCTCTCCGGTGAAGTTGGGTTGCTTCGTCATCGTCCAACCACACCATCCCAAAGCCGCCGCTCGGCTGCCGCCGCCATTACGTCACTACTGGAACTTCCTTCCAGGCAACCCACCACCCGCCACCGCACCTGCCCATAAAACCCGGCCACATCCATCAAGCAGCAACAGCAACTACCAGTTTGGAACTACCATCCCCCGTGACCACCTGCCCGCTTTCCCGCACAAAGTTCACTAGTAGTTACTGCTCCAATATGGAGTAGTACTAATCCTCCGTATACTCGAATCCCAGGATCTCTCCCGGTCGGATGCTCACTCGTCTTCCCCACCACTCGTCGCCCCTTGTCTTCCCCTGCCGCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGACGCTCTCCACCGCCACCGGCAGCAACTCCACCACCGTCAAGATGGCTCGGTCGGCGCTCGACGAGGTCACCG ACGCCGGCGCCTTCGACCGGTCGCCGTCCACCTTCCGGAGCTCTATCTCCAGGGACAGCTCCGCCCGGTTCCCCGCCGTGCCGGGGAGGTACCACCTCTACG T CTACT                                  ]
[+] EMBL C74485               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCCCCACCACTCGTCGCCCCTTGTCTTCCCCTGCCGCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGACGCTCTCCACCGCCACCGG AGCAACTCCACCACCGTCAAGATGGCTCGGTCGGCGCTCGACGAGGTCACCGAACGCCGGCGCCTTCGACCGGTCGCCGTCCACCTTCCGGAGCTCTATC NCAGGG NAGCTCCG CCGGTT CCCGCCGTG CGGGGAGGNA CACCTCTACGNTCCTACGCGTGCCCTGGGCGTNACGTGCTCGCTAACTNAAG]




>consensus_925#0
GACGCAGCCTCCATCCCCAGACCCCAGCCGCCGCCGCCCCTCTCCTCTCCGGTGAAGTTG
GGTTGCTTCGTCATCGTCCAACCACACCATCCCAAAGCCGCCGCTCGGCTGCCGCCGCCA
TTACGTCACTACTGGAACTTCCTTCCAGGCAACCCACCACCCGCCACCGCACCTGCCCAT
AAAACCCGGCCACATCCATCAAGCAGCAACAGCAACTACCAGTTTGGAACTACCATCCCC
CGTGACCACCTGCCCGCTTTCCCGCACAAAGTTCACTAGTAGTTACTGCTCCAATATGGA
GTAGTACTAATCCTCCGTATACTCGAATCCCAGGATCTCTCCCGGTCGGATGCTCACTCG
TCTTCCCCACCACTCGTCGCCCCTTGTCTTCCCCTGCCGCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGC
CCGGACGCTCTCCACCGCCACCGGCAGCAACTCCACCACCGTCAAGATGGCTCGGTCGGC
GCTCGACGAGGTCACCGACGCCGGCGCCTTCGACCGGTCGCCGTCCACCTTCCGGAGCTC
TATCTCCAGGGACAGCTCCGCCCGGTTCCCCGCCGTGCCGGGGAGGTACCACCTCTACGT
CTACTCGTGCCCTGGGCGTNACGTGCTCGCTAACTNAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case