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Oryza sativa
cluster # 93 cluster # 93       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_93#0 length = 3040 sequences # 2  

consensusID : consensus_93#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3040
fasta sequence
                              [CGAATATTTCCCCGTCCGCTGTGCGTCGACTCCGACTGCTCGTGTGTTCGCCCGCCGCCGCCGATTCCTATCCATCTCGCGAGCGAGCAGGGGCGCCGTCGTTCGTCCTGCTGCTTCCGCCGCATCCATCCTGTGCTAAAGTTTGTACCTTGCCTTGGAACATTAGTCATGGAGAGTCAGAGAATGACCTGGCTCTACGATCGTCACCACTCCTTGAAACATAATAAAGCTGAAAGACAAGCCATTCTATCAACTTATAGATTAGCAAAACGTCCAAATCTCTCTTCAGAAGGTATGATTGGCGAAAGTTGCATTGTGAGGACAAATTGTTTCAGTGTTCATCTGGAGTCTTTGGATGATCAGACTATCTATGAATATGATGTATGTGTCACTCCTGAGGTTGGAATCAATCGTGCTGTTATTAGAGAGTTGGTAAAACAGCAGAAAGATTCTGGTTTGGGTGGCCGTCTTCCTGCCTATGATGGAAGGAAGAGGCTATACACATCTGGTCCATTGCCATTTGATTCACATAGATTTCTTGTTCTGCTGGATAGTATTGAAGACAGTCCTGAAGAGTCAAGGCACTTGAGAGTGAGAGATTTTGTGGTCACTTTAAAATTTGCTGCAAAAATTTCCTTATGGACTTTACGCAAGTTCCGTGGTGGGAAGCCAAACCGAGAAAGTCGAGCGGCCCTGCGAGCACTTGACGTTGTTCTAAAGGAATTACCCACTGCAAGGTATACCCAATTTGCTGGTTCATTTTACTCACCTAACTTAGGAGAATGCCGACAATTGTGTAAGGTCTTGGAAAGCTGGCGTGGTTTTCACCAAAGAATACAAGCTACTCAGATGGGACTTCAACTGAATATCGACGTGTCATCATCAGTGTTCATCAAGCCTGTACCTGTGGTTGACTATGTTGCACAGCTTCTTAACGAGGACATCTTATTAGACAGACCATTATGTAGCACTGAGTTCTTGAAGATTAAGGAGGCTCTAGAAGGTCTGAAGGTTCAGATTAATGGCATTTTGTTCAACACATATCATGTACAAGACCTTGTCCATCAAGCAGCAAGTTTTCCAGTTAACTTTAGTATTCAGTACCCATCTTTGCCTTGCTTGAAAGTGGCTCATTTTGGGGAGACAATATTTCTGCCATTGGAGGTCTGTAAAATTGCTGAGGGACAATGTCACCAGAAACAGCTCAATGCAAAACATATGGCTGCTCTTCTTCAGGTAGCTCGACAGCCCCCTAATGAGCGTGACTACAACATTCTGCAGACTGTGCATCAGAACAAATACCAGGAGGACCCACATGCTAAAGAGTTTGGCATTAAAATTGAGGAAAAACTTGTATCAATTAAATCTCGCATCCTACCTGCTCCTTGGCTTAAATTCCATGACAGTGGCGAGACGACAGAATTCTTGCCACAACTTGGCATATGGAATATGATGCATAAGAAAATGATCAATGGTGGGAGAGTGAAAAGCTGGGCATGTGTTAACTTTTGCTGGAGTGTACGGGAGTATGCTGCTAGGAATTTCTGTTATGACCTTGGCTTTATGTGCCGAGAATCTGGGATGGTCTTTTCAGTTAAACCTGTGCTTCCTCTAGTGATTGCTAAACCTGGATGTGTAGAATCTGCACTCAGGACACTTCATGACGATGTCATGGACATACTTAGACCACAGGGCAGAAAACTTGACCTGCTGATTGTAATATTGCCTAACAACAATGGATCTCTTTATGGTGATGTCAAAAGAATATGTGAGACAGATATTGGACTGATCTCTCAATGTTGTCTTGCAAAACATGTTCTTAAGATGAACAAGTGGTATCTTGCAAGCGTTGCCCTTAAAATCAATGCTAAGATGGGCGGAAGAAATACTGTACTGGTTGATGCTTTAGAAATGAGACTCCCCCATGTTAGGGATACACCAACTATTGTATTTGGTGCTCATGTCACCCATCCACATCCAGGAAAAGCTAATAGTTCTTCCATTGCTGCTGTTGTTGCTTCTCAAGACTGGCCCGAGGTTACCAAGTATGCTGGTTTAATCAGTGTGCAAGCGTGCCACCAGGAGTCAATACAAGGTCTTTTTAAAGTCCAGGATGATCCGGAAAGAGGAACCACAACTAGCGGAATGATCAAAGAGCATCTCATGTCTTTCTATCGAGCCACTAAACGGAAGCCCGGAAGGATTATATTTTACAGGGATGGTGTGAGCAAAGGACAGCTCCCTCAGGCTTTGATGCACGAACTTGGTGCCATCAAAATGGCGTGTGCATCTATGGGACCCGATTATAATCCATTAGTTACATACGTGGTGCTCCAGAAGTGTCGCCATACACGTCTGTTTGCTGACTACTATAATGCGAATACTCATGATTCAACTGCAAACATACGGGCTGGTACTGTGGTTGATTCAAATATTTGCCAACCAAATCAGTTTGATTTCTACTTGTGTAGCCACCGCAGCACGCAGGGAACTAAGCGGCCCAGGTATTATCATGTTCTGTGGGACGAGAACGACTTCTTGGCTGGTTCTTTCCAAGAGCTCACAAACTACCTCTGCTACACCTCCGCAACTTGCACCCAATCCATATCAGTTGTGGCCCCTGTGCACTACGCTCGTCTTCTGTCATCACGAGCTCGATGTTACATTAAACCACGCTCGATTGGCGATTCAACGAGCCACACCTCCTTGCCTTCTGAAGAAGATAGCAGCGCAGCCTCAGAGACTGGCAGTCTTCTTCCTATAAAGGATAATTTGAAAGGGGCCATGTTTTTCTGCTAGAACTGCTGCCAGCAAGATCTGCTGTCATTTTGTACGTGGTCTGTACAGTCCCACAGTTCTTGGTAGATTTGACTGAGCAGTCAAAACTCATTATCGTTCAGCGAGATTCAGGTGTAGCAGCTGTAGGATTACTGATAAACATTGTTCCTGTACCGATACTTTAGAAGAAATGAATTAATTATATCTTAGAACAGCATGGGTATGTTACAGATTAGTGGTTTCACATTTAACAAAAAAAAGA]

[+] EMBL AK106247             [CGAATATTTCCCCGTCCGCTGTGCGTCGACTCCGACTGCTCGTGTGTTCGCCCGCCGCCGCCGATTCCTATCCATCTCGCGAGCGAGCAGGGGCGCCGTCGTTCGTCCTGCTGCTTCCGCCGCATCCATCCTGTGCTAAAGTTTGTACCTTGCCTTGGAACATTAGTCATGGAGAGTCAGAGAATGACCTGGCTCTACGATCGTCACCACTCCTTGAAACATAATAAAGCTGAAAGACAAGCCATTCTATCAACTTATAGATTAGCAAAACGTCCAAATCTCTCTTCAGAAGGTATGATTGGCGAAAGTTGCATTGTGAGGACAAATTGTTTCAGTGTTCATCTGGAGTCTTTGGATGATCAGACTATCTATGAATATGATGTATGTGTCACTCCTGAGGTTGGAATCAATCGTGCTGTTATTAGAGAGTTGGTAAAACAGCAGAAAGATTCTGGTTTGGGTGGCCGTCTTCCTGCCTATGATGGAAGGAAGAGGCTATACACATCTGGTCCATTGCCATTTGATTCACATAGATTTCTTGTTCTGCTGGATAGTATTGAAGACAGTCCTGAAGAGTCAAGGCACTTGAGAGTGAGAGATTTTGTGGTCACTTTAAAATTTGCTGCAAAAATTTCCTTATGGACTTTACGCAAGTTCCGTGGTGGGAAGCCAAACCGAGAAAGTCGAGCGGCCCTGCGAGCACTTGACGTTGTTCTAAAGGAATTACCCACTGCAAGGTATACCCAATTTGCTGGTTCATTTTACTCACCTAACTTAGGAGAATGCCGACAATTGTGTAAGGTCTTGGAAAGCTGGCGTGGTTTTCACCAAAGAATACAAGCTACTCAGATGGGACTTCAACTGAATATCGACGTGTCATCATCAGTGTTCATCAAGCCTGTACCTGTGGTTGACTATGTTGCACAGCTTCTTAACGAGGACATCTTATTAGACAGACCATTATGTAGCACTGAGTTCTTGAAGATTAAGGAGGCTCTAGAAGGTCTGAAGGTTCAGATTAATGGCATTTTGTTCAACACATATCATGTACAAGACCTTGTCCATCAAGCAGCAAGTTTTCCAGTTAACTTTAGTATTCAGTACCCATCTTTGCCTTGCTTGAAAGTGGCTCATTTTGGGGAGACAATATTTCTGCCATTGGAGGTCTGTAAAATTGCTGAGGGACAATGTCACCAGAAACAGCTCAATGCAAAACATATGGCTGCTCTTCTTCAGGTAGCTCGACAGCCCCCTAATGAGCGTGACTACAACATTCTGCAGACTGTGCATCAGAACAAATACCAGGAGGACCCACATGCTAAAGAGTTTGGCATTAAAATTGAGGAAAAACTTGTATCAATTAAATCTCGCATCCTACCTGCTCCTTGGCTTAAATTCCATGACAGTGGCGAGACGACAGAATTCTTGCCACAACTTGGCATATGGAATATGATGCATAAGAAAATGATCAATGGTGGGAGAGTGAAAAGCTGGGCATGTGTTAACTTTTGCTGGAGTGTACGGGAGTATGCTGCTAGGAATTTCTGTTATGACCTTGGCTTTATGTGCCGAGAATCTGGGATGGTCTTTTCAGTTAAACCTGTGCTTCCTCTAGTGATTGCTAAACCTGGATGTGTAGAATCTGCACTCAGGACACTTCATGACGATGTCATGGACATACTTAGACCACAGGGCAGAAAACTTGACCTGCTGATTGTAATATTGCCTAACAACAATGGATCTCTTTATGGTGATGTCAAAAGAATATGTGAGACAGATATTGGACTGATCTCTCAATGTTGTCTTGCAAAACATGTTCTTAAGATGAACAAGTGGTATCTTGCAAGCGTTGCCCTTAAAATCAATGCTAAGATGGGCGGAAGAAATACTGTACTGGTTGATGCTTTAGAAATGAGACTCCCCCATGTTAGGGATACACCAACTATTGTATTTGGTGCTCATGTCACCCATCCACATCCAGGAAAAGCTAATAGTTCTTCCATTGCTGCTGTTGTTGCTTCTCAAGACTGGCCCGAGGTTACCAAGTATGCTGGTTTAATCAGTGTGCAAGCGTGCCACCAGGAGTCAATACAAGGTCTTTTTAAAGTCCAGGATGATCCGGAAAGAGGAACCACAACTAGCGGAATGATCAAAGAGCATCTCATGTCTTTCTATCGAGCCACTAAACGGAAGCCCGGAAGGATTATATTTTACAGGGATGGTGTGAGCAAAGGACAGCTCCCTCAGGCTTTGATGCACGAACTTGGTGCCATCAAAATGGCGTGTGCATCTATGGGACCCGATTATAATCCATTAGTTACATACGTGGTGCTCCAGAAGTGTCGCCATACACGTCTGTTTGCTGACTACTATAATGCGAATACTCATGATTCAACTGCAAACATACGGGCTGGTACTGTGGTTGATTCAAATATTTGCCAACCAAATCAGTTTGATTTCTACTTGTGTAGCCACCGCAGCACGCAGGGAACTAAGCGGCCCAGGTATTATCATGTTCTGTGGGACGAGAACGACTTCTTGGCTGGTTCTTTCCAAGAGCTCACAAACTACCTCTGCTACACCTCCGCAACTTGCACCCAATCCATATCAGTTGTGGCCCCTGTGCACTACGCTCGTCTTCTGTCATCACGAGCTCGATGTTACATTAAACCACGCTCGATTGGCGATTCAACGAGCCACACCTCCTTGCCTTCTGAAGAAGATAGCAGCGCAGCCTCAGAGACTGGCAGTCTTCTTCCTATAAAGGATAATTTGAAAGGGGCCATGTTTTTCTGCTAGAACTGCTGCCAGCAAGATCTGCTGTCATTTTGTACGTGGTCTGTACAGTCCCACAGTTCTTGGTAGATTTGACTGAGCAGTCAAAACTCATTATCGTTCAGCGAGATTCAGGTGTAGCAGCTGTAGGATTACTGATAAACATTGTTCCTGTACCGATACTTTAGAAGAAATGAATTAATTATATC                                                        ]
[-] EMBL CB671414             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AACTTGGTGCCATCAAAATGGCGTGTGCATCTATGGGACCCGATTATAATCCATTAGTTACATACGTGGTGCTCCAGAAGTGTCGCCATACACGTCTGTTTGCTGACTACTATAATGCGAATACTCATGATTCAACTGCAAACATACGGGCTGGTACTGTGGTTGATTCAAATATTTGCCAACCAAATCAGTTTGATTTCTACTTGTGTAGCCACCGCAGCACGCAGGGAACTAAGCGGCCCAGGTATTATCATGTTCTGTGGGACGAGAACGACTTCTTGGCTGGTTCTTTCCAAGAGCTCACAAACTACCTCTGCTACACCTCCGCAACTTGCACCCAATCCATATCAGTTGTGGCCCCTGTGCACTACGCTCGTCTTCTGTCATCACGAGCTCGATGTTACATTAAACCACGCTCGATTGGCGATTCAACGAGCCACACCTCCTTGCCTTCTGAAGAAGATAGCAGCGCAGCCTCAGAGACTGGCAGTCTTCTTCCTATAAAGGATAATTTGAAAGGGGCCATGTTTTTCTGCTAGAACTGCTGCCAGCAAGATCTGCTGTCATTTTGTACGTGGTCTGTACAGTCCCACAGTTCTTGGTAGATTTGACTGAGCAGTCAAAACTCATTATCGTTCAGCGAGATTCAGGTGTAGCAGCTGTAGGATTACTGATAAACATTGTTCCTGTACCGATACTTTAGAAGAAATGAATTAATTATATCTTAGAACAGCATGGGTATGTTACAGATTAGTGGTTTCACATTTAACAAAAAAAAGA]


>consensus_93#0 CGAATATTTCCCCGTCCGCTGTGCGTCGACTCCGACTGCTCGTGTGTTCGCCCGCCGCCG CCGATTCCTATCCATCTCGCGAGCGAGCAGGGGCGCCGTCGTTCGTCCTGCTGCTTCCGC CGCATCCATCCTGTGCTAAAGTTTGTACCTTGCCTTGGAACATTAGTCATGGAGAGTCAG AGAATGACCTGGCTCTACGATCGTCACCACTCCTTGAAACATAATAAAGCTGAAAGACAA GCCATTCTATCAACTTATAGATTAGCAAAACGTCCAAATCTCTCTTCAGAAGGTATGATT GGCGAAAGTTGCATTGTGAGGACAAATTGTTTCAGTGTTCATCTGGAGTCTTTGGATGAT CAGACTATCTATGAATATGATGTATGTGTCACTCCTGAGGTTGGAATCAATCGTGCTGTT ATTAGAGAGTTGGTAAAACAGCAGAAAGATTCTGGTTTGGGTGGCCGTCTTCCTGCCTAT GATGGAAGGAAGAGGCTATACACATCTGGTCCATTGCCATTTGATTCACATAGATTTCTT GTTCTGCTGGATAGTATTGAAGACAGTCCTGAAGAGTCAAGGCACTTGAGAGTGAGAGAT TTTGTGGTCACTTTAAAATTTGCTGCAAAAATTTCCTTATGGACTTTACGCAAGTTCCGT GGTGGGAAGCCAAACCGAGAAAGTCGAGCGGCCCTGCGAGCACTTGACGTTGTTCTAAAG GAATTACCCACTGCAAGGTATACCCAATTTGCTGGTTCATTTTACTCACCTAACTTAGGA GAATGCCGACAATTGTGTAAGGTCTTGGAAAGCTGGCGTGGTTTTCACCAAAGAATACAA GCTACTCAGATGGGACTTCAACTGAATATCGACGTGTCATCATCAGTGTTCATCAAGCCT GTACCTGTGGTTGACTATGTTGCACAGCTTCTTAACGAGGACATCTTATTAGACAGACCA TTATGTAGCACTGAGTTCTTGAAGATTAAGGAGGCTCTAGAAGGTCTGAAGGTTCAGATT AATGGCATTTTGTTCAACACATATCATGTACAAGACCTTGTCCATCAAGCAGCAAGTTTT CCAGTTAACTTTAGTATTCAGTACCCATCTTTGCCTTGCTTGAAAGTGGCTCATTTTGGG GAGACAATATTTCTGCCATTGGAGGTCTGTAAAATTGCTGAGGGACAATGTCACCAGAAA CAGCTCAATGCAAAACATATGGCTGCTCTTCTTCAGGTAGCTCGACAGCCCCCTAATGAG CGTGACTACAACATTCTGCAGACTGTGCATCAGAACAAATACCAGGAGGACCCACATGCT AAAGAGTTTGGCATTAAAATTGAGGAAAAACTTGTATCAATTAAATCTCGCATCCTACCT GCTCCTTGGCTTAAATTCCATGACAGTGGCGAGACGACAGAATTCTTGCCACAACTTGGC ATATGGAATATGATGCATAAGAAAATGATCAATGGTGGGAGAGTGAAAAGCTGGGCATGT GTTAACTTTTGCTGGAGTGTACGGGAGTATGCTGCTAGGAATTTCTGTTATGACCTTGGC TTTATGTGCCGAGAATCTGGGATGGTCTTTTCAGTTAAACCTGTGCTTCCTCTAGTGATT GCTAAACCTGGATGTGTAGAATCTGCACTCAGGACACTTCATGACGATGTCATGGACATA CTTAGACCACAGGGCAGAAAACTTGACCTGCTGATTGTAATATTGCCTAACAACAATGGA TCTCTTTATGGTGATGTCAAAAGAATATGTGAGACAGATATTGGACTGATCTCTCAATGT TGTCTTGCAAAACATGTTCTTAAGATGAACAAGTGGTATCTTGCAAGCGTTGCCCTTAAA ATCAATGCTAAGATGGGCGGAAGAAATACTGTACTGGTTGATGCTTTAGAAATGAGACTC CCCCATGTTAGGGATACACCAACTATTGTATTTGGTGCTCATGTCACCCATCCACATCCA GGAAAAGCTAATAGTTCTTCCATTGCTGCTGTTGTTGCTTCTCAAGACTGGCCCGAGGTT ACCAAGTATGCTGGTTTAATCAGTGTGCAAGCGTGCCACCAGGAGTCAATACAAGGTCTT TTTAAAGTCCAGGATGATCCGGAAAGAGGAACCACAACTAGCGGAATGATCAAAGAGCAT CTCATGTCTTTCTATCGAGCCACTAAACGGAAGCCCGGAAGGATTATATTTTACAGGGAT GGTGTGAGCAAAGGACAGCTCCCTCAGGCTTTGATGCACGAACTTGGTGCCATCAAAATG GCGTGTGCATCTATGGGACCCGATTATAATCCATTAGTTACATACGTGGTGCTCCAGAAG TGTCGCCATACACGTCTGTTTGCTGACTACTATAATGCGAATACTCATGATTCAACTGCA AACATACGGGCTGGTACTGTGGTTGATTCAAATATTTGCCAACCAAATCAGTTTGATTTC TACTTGTGTAGCCACCGCAGCACGCAGGGAACTAAGCGGCCCAGGTATTATCATGTTCTG TGGGACGAGAACGACTTCTTGGCTGGTTCTTTCCAAGAGCTCACAAACTACCTCTGCTAC ACCTCCGCAACTTGCACCCAATCCATATCAGTTGTGGCCCCTGTGCACTACGCTCGTCTT CTGTCATCACGAGCTCGATGTTACATTAAACCACGCTCGATTGGCGATTCAACGAGCCAC ACCTCCTTGCCTTCTGAAGAAGATAGCAGCGCAGCCTCAGAGACTGGCAGTCTTCTTCCT ATAAAGGATAATTTGAAAGGGGCCATGTTTTTCTGCTAGAACTGCTGCCAGCAAGATCTG CTGTCATTTTGTACGTGGTCTGTACAGTCCCACAGTTCTTGGTAGATTTGACTGAGCAGT CAAAACTCATTATCGTTCAGCGAGATTCAGGTGTAGCAGCTGTAGGATTACTGATAAACA TTGTTCCTGTACCGATACTTTAGAAGAAATGAATTAATTATATCTTAGAACAGCATGGGT ATGTTACAGATTAGTGGTTTCACATTTAACAAAAAAAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)