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Oryza sativa
cluster # 9435 cluster # 9435       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9435#0 length = 1501 sequences # 6  

consensusID : consensus_9435#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1501
fasta sequence
                              [ACTTTAATGAACCATTGTCTTCTCTTCAAAAGTGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCCAATTTACTGGATCGTGCATATGAATATGGTTCAAGGGGAAACGGGCTGATGAGAATTCTTTATGTTGCTGCATTTGCTGTCTCTGGATATGCTTCCACGGATTCTCGCCCCTGCAAACCTTTCAATCCATTGTTGGGGGAAACATACGAAGCTGATTATCCTGAAAAAGGGATCCGTTTCTTCTCTGAAAAGGTTAGTCATCATCCGATGGTCATGGCATGCCATTGTGAAGGGAAAGGTTGGAAATTTTGGGGTGACAGCAATCTAAAGAGCAAATTTTGGGGGCAGTCCATTCAACTCGACCTAGCGGTGTGCTAACTCTACAGTTTGATGATGGAGAAACTTTCCAGTGGAGTAAGGTTACGACAACAATTAATAACCTTATCATTGGCCGAGTCTATTGCCATCACCATGGCACGATGAACATAAGTGGAAACAGGCAATATTCATGTAAGCTGACTTTCAAAGAGCAATCCTTCCTCGATCGTAATCCTCGCCAGGTTCAAGGACTTGTTACGGATGCTAATGGGACCAAAGTTGCATTCTTGATGGGAAAGTGGGACGAGAGCATGTCTTGCATCATTGGTGATGATGCTTCTAAAGTGAACTCCCGTAATGCAAATCAGAGTACGGGTGCCACTTTATTGTGGGAGAAAAATGTGCCTCCAGCCAATCCCACTCGATATAACCTGTCATCATTTGCAATCACTTTGAACGAGTTGACACCAGGTCTTAAGGAGAAGCTTCCACCAACGGATTCAAGACTCAGGCCAGATCAGCGGCATCTAGAGAATGGGGAGTACGAAAAGGCTAACTCTGAAAAATTGCGCCTGGAGACGAGGCAGAGGATGGCAAGGAAGATGCAGGAGAGTGGTTGGAAGCCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA-GGTTACTGGGAGGCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTTGGTTGC-AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA-CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTGACCTCTGTGCCAAGCCAGGCGAGTAATCTTGTCCTGTATAGAAATGCCAAATTAATATATTCAATTTCCTGTTAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK071048             [ACTTTAATGAACCATTGTCTTCTCTTCAAAAGTGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCCAATTTACTGGATCGTGCATATGAATATGGTTCAAGGGGAAACGGGCTGATGAGAATTCTTTATGTTGCTGCATTTGCTGTCTCTGGATATGCTTCCACGGATTCTCGCCCCTGCAAACCTTTCAATCCATTGTTGGGGGAAACATACGAAGCTGATTATCCTGAAAAAGGGATCCGTTTCTTCTCTGAAAAGGTTAGTCATCATCCGATGGTCATGGCATGCCATTGTGAAGGGAAAGGTTGGAAATTTTGGGGTGACAGCAATCTAAAGAGCAAATTTTGGGGGCAGTCCATTCAACTCGACCTAGCGGTGTGCTAACTCTACAGTTTGATGATGGAGAAACTTTCCAGTGGAGTAAGGTTACGACAACAATTAATAACCTTATCATTGGCCGAGTCTATTGCCATCACCATGGCACGATGAACATAAGTGGAAACAGGCAATATTCATGTAAGCTGACTTTCAAAGAGCAATCCTTCCTCGATCGTAATCCTCGCCAGGTTCAAGGACTTGTTACGGATGCTAATGGGACCAAAGTTGCATTCTTGATGGGAAAGTGGGACGAGAGCATGTCTTGCATCATTGGTGATGATGCTTCTAAAGTGAACTCCCGTAATGCAAATCAGAGTACGGGTGCCACTTTATTGTGGGAGAAAAATGTGCCTCCAGCCAATCCCACTCGATATAACCTGTCATCATTTGCAATCACTTTGAACGAGTTGACACCAGGTCTTAAGGAGAAGCTTCCACCAACGGATTCAAGACTCAGGCCAGATCAGCGGCATCTAGAGAATGGGGAGTACGAAAAGGCTAACTCTGAAAAATTGCGCCTGGAGACGAGGCAGAGGATGGCAAGGAAGATGCAGGAGAGTGGTTGGAAGCCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA GGTTACTGGGAGGCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTTGGTTGC AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTGACCTCTGTGCCAAGCCAGGCGAGTAATCTTGTCCTGTATAGAAATGCCAAATTAATATATTCA                    ]
[+] EMBL CA765121             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAAGATGCAGGAGAGTGGTTGGAAGCCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA GGTTACTGGGAGGCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTTGGTTGC AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTC                                                                                          ]
[+] EMBL BI804892             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATCCA GAGA TTGTT GAAACCAAGATGGTTCCAAAGGGACACAGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA G  TACT GGA GCAA GGA CAGAGGAAAT GGTTGGTTGC AATGACATATTC GCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACACCTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTGACCTCTGTGCCAAGCCAGGCGAGTAATCTTGTCCTGTATAGAAATGCCAAATTAATATATTCAATTTCCTGTTAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI807265             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGA GGTTACTGGGA GCAAGGGAGCAGAGGAAATGGGTT GTT C AATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCC TTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTaaaaaa                                                                              ]
[-] EMBL AU063435             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCGGAGGGTTACTGGGAGGCAAGGNAGCAGAGGAAAT GGNTGGTTGCAAATGACATATTCGGCAATAATGTGTCNACTCTTTGCACCAGCGCAAGTATATAGAGANACTTCTGTTTAGTAGTCG TGACACCCCATTAATTATTGAANACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTaaaaanacg                                                                            ]
[-] EMBL C97667               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               nTGG TGC  ATGACATATTCGGCAATAATGTGCCNACTC TTGGACCAGCGCAAGTATATAGAGAAACTTCTG TTAGTAGTCG TGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATAGTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTCATATAGAAACA CTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAGCTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCACAGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCTCATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTT                                                                                       ]


>consensus_9435#0 ACTTTAATGAACCATTGTCTTCTCTTCAAAAGTGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCCAATT TACTGGATCGTGCATATGAATATGGTTCAAGGGGAAACGGGCTGATGAGAATTCTTTATG TTGCTGCATTTGCTGTCTCTGGATATGCTTCCACGGATTCTCGCCCCTGCAAACCTTTCA ATCCATTGTTGGGGGAAACATACGAAGCTGATTATCCTGAAAAAGGGATCCGTTTCTTCT CTGAAAAGGTTAGTCATCATCCGATGGTCATGGCATGCCATTGTGAAGGGAAAGGTTGGA AATTTTGGGGTGACAGCAATCTAAAGAGCAAATTTTGGGGGCAGTCCATTCAACTCGACC TAGCGGTGTGCTAACTCTACAGTTTGATGATGGAGAAACTTTCCAGTGGAGTAAGGTTAC GACAACAATTAATAACCTTATCATTGGCCGAGTCTATTGCCATCACCATGGCACGATGAA CATAAGTGGAAACAGGCAATATTCATGTAAGCTGACTTTCAAAGAGCAATCCTTCCTCGA TCGTAATCCTCGCCAGGTTCAAGGACTTGTTACGGATGCTAATGGGACCAAAGTTGCATT CTTGATGGGAAAGTGGGACGAGAGCATGTCTTGCATCATTGGTGATGATGCTTCTAAAGT GAACTCCCGTAATGCAAATCAGAGTACGGGTGCCACTTTATTGTGGGAGAAAAATGTGCC TCCAGCCAATCCCACTCGATATAACCTGTCATCATTTGCAATCACTTTGAACGAGTTGAC ACCAGGTCTTAAGGAGAAGCTTCCACCAACGGATTCAAGACTCAGGCCAGATCAGCGGCA TCTAGAGAATGGGGAGTACGAAAAGGCTAACTCTGAAAAATTGCGCCTGGAGACGAGGCA GAGGATGGCAAGGAAGATGCAGGAGAGTGGTTGGAAGCCAAGATGGTTCCAAAGGGACAC AGAGGATGGAACATTCCGTTATGTCGGAGGTTACTGGGAGGCAAGGGAGCAGAGGAAATG GGTTGGTTGCAATGACATATTCGGCAATAATGTGTCCACTCTTTGCACCAGCGCAAGTAT ATAGAGAAACTTCTGTTTAGTAGTCGTTGACACCCCATTAATTATTGAAGACGGTACATA GTTGATCGGCTGCTCCCGTTGCTACCATGCAAACAAGAGCTAACATGCTCTCCTCTTGTC ATATAGAAACACTGGGACATTTATGTGGATACTGGGATACTTAACTGTGAGGCCTGCTAG CTAACAATGTTGTTATTACTCTCAGTGATATCCATTTTTTCAATCTTTGTACTGTTCCAC AGAGATACTGAGTTATATACTTGGTTCCTAATTGTAATTGATCATGTAAGCTTCTATGCT CATGGTCATGGATAATGGACGTTCATCTTTCTTTTTTGACCTCTGTGCCAAGCCAGGCGA GTAATCTTGTCCTGTATAGAAATGCCAAATTAATATATTCAATTTCCTGTTAAAAAAAAA A



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)