These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9449#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 746 fasta sequence [TTTTTTTTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA-TGT-AAAAGATCATGAG-AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGTTGCTGATGGCAACCAAGAAGTCAACCTTGAATTGGTTCACCCGTCGGTTC] [+] EMBL CA762745 [TTTTTTTTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCTAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA TGT AAAAGATCATGAG AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGT ] [-] EMBL BI805035 [ TTTTTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTC TTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCAGTGTCAAAAGATCATGAGCAAGGTTCACCG GCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGGTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTga ] [-] EMBL AU067874 [ TTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA TGT AAAAGATCATGAG AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGNATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAATGCCGNTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGAATTCTGAC CTGGTGAAGC ] [+] EMBL CB666636 [ TGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGGGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAAACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGGGTGGTATTTCCTTCAAAAATTCA TGT AAAAGATCATGAA AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAAACAATGTTGAGCTAAAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAAATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGTTGCTGATGGCAACCAAGAAGTCAACCTTGAATTGGTTCACCCGTCGGTTC] [-] EMBL CA766903 [ TGTTATCGATGATATTCAATTCNCAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCANCAAAGCATGTCCTCTANCATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA TGT AAAAGATCATGAG AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGTTGCTGATGGCAACCAAGAAGTCAACCTTGAATTGGTTCACCCGTCGGTT ] [+] EMBL CB666635 [ TCTGTTCCTCCAGTGATTGGGCGGGATTTCCTTCCGAATTTCG TGT GAAAAATCATGAC AAGGTTCCCCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAAATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCTTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCACCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||