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Oryza sativa
cluster # 9449 cluster # 9449       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9449#0 length = 746 sequences # 6  

consensusID : consensus_9449#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 746
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA-TGT-AAAAGATCATGAG-AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGTTGCTGATGGCAACCAAGAAGTCAACCTTGAATTGGTTCACCCGTCGGTTC]

[+] EMBL CA762745             [TTTTTTTTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCTAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA TGT AAAAGATCATGAG AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGT                                                  ]
[-] EMBL BI805035             [   TTTTTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTC TTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCAGTGTCAAAAGATCATGAGCAAGGTTCACCG GCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGGTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTga                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AU067874             [      TTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA TGT AAAAGATCATGAG AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGNATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAATGCCGNTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGAATTCTGAC CTGGTGAAGC                                                              ]
[+] EMBL CB666636             [                      TGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGGGTTACAATGTGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAAACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGGGTGGTATTTCCTTCAAAAATTCA TGT AAAAGATCATGAA AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAAACAATGTTGAGCTAAAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAAATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGTTGCTGATGGCAACCAAGAAGTCAACCTTGAATTGGTTCACCCGTCGGTTC]
[-] EMBL CA766903             [                      TGTTATCGATGATATTCAATTCNCAAGGTGTTACAATGTGCAGTAGCANCAAAGCATGTCCTCTANCATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCAATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAATTTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGTTCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATTGATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCA TGT AAAAGATCATGAG AAGGTTCACCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGTTGCTGATGGCAACCAAGAAGTCAACCTTGAATTGGTTCACCCGTCGGTT ]
[+] EMBL CB666635             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCTGTTCCTCCAGTGATTGGGCGGGATTTCCTTCCGAATTTCG TGT GAAAAATCATGAC AAGGTTCCCCGCGCGGGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGCATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAAACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAAATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCAACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCTTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGAACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCACCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGTCGAGATTTCTGACGCTGGTGAGG                                                               ]


>consensus_9449#0 TTTTTTTTTTTTTAATAAGCCCTGTTATCGATGATATTCAATTCACAAGGTGTTACAATG TGCAGTAGCAACAAAGCATGTCCTCCAACATTCAAACATGGCTTGACATTTGACAATGCA ATTACATAATGGTGTAACATCTACATATGATTTTATTATATACTAACTAGTTAGACCAAT TTGGTCAAACTGTTCCATATGAAAAATAAAAGCATGCCTCCTATATTGCAATTCTTTTGT TCTACTTTCTATTGAGCTCGATTGATATTGTCTCCTCATCAATTGATCTCTTCCTCCATT GATTGTGTGGTATTTCCTTCAGAAATTCATGTAAAAGATCATGAGAAGGTTCACCGCGCG GGTGCTTGATTTCCACTGACTTCAAACTGCTGCACGCGGAAGACAATGTTGAGCTAGAGC ATTTTGAAGTTTTCTCCTTCGACTGGGTTTGCCCAGCCTTCCTCCTCGATTTACCTACAA ACTTGCAATTGTGTAGTCTAAGCTGCTCCAGATTTGGGGCGTTCTGAAGGATGCTCCTCA ACACGTGGTACTTGTATCCAATGTCACACTCGTTGAGGAGCAAGGTTGTCAAGTAGGGGA ACATCGGGAATTCCTGGGATTTATTATCCAGCAGTGCCGTTGCATTGAGCCCAGTCAGGT CGAGATTTCTGACGCTGGTGAGGCGGCCAAGCAGGTTGCTGATGGCAACCAAGAAGTCAA CCTTGAATTGGTTCACCCGTCGGTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)