These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9567#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 3745 fasta sequence [TACAAGAATTTGCTTCTGTTTTTGAGGAACCTCAAGGTCTGCCACCACAGCGTGATTTTGATCATTCTATACCACTGTTGCCTGGTGCAAGACCTGTCAATCTTCGTCCTTATCGTTATAATCCAGCACAAAAGGATGAGATTGAGCGTCAAGTGACTGAAATGTTGCGTCAGGGTGTTATCCAACCCAGCTCCAGCCCGTTCTCATCTCCAGTATTGTTGGTCCTCAAGAAGGACTTGACATGGAGGTTCTGTATCGACTATCGCCACCTTAATGCTATAACAGTCAAGAATCGATATCCTCTTCCAGTGATTGATGAGTTACTTGATGATCTGGCAGGAGCAACTATATTCACTAGTTTGGATTTAAGGGCGGGTTATCATAAAATCCGTATGCGACCAGAAGATGAACATAAAACTGCGTTCAAAACGCATCATGGACATTACGAGTTTCGGGTTATGTCTTATGGATTAACTGGTGCACCCGCTACTTTCCAAGGTGTCATGAATACAGTGTTATCCCCTTTGCTCCGGAAGGGAGTGCTTGTTTTCATAGATGACATTCTGATTTACAGTGCAACCTTGACAGAACGTGTGCAATTATTACGTCAGGTTTTCCAATTGTTGACTGAACATCAACTTAAGGTGAAGCGCTCTAAGTGTTCATTTGCTCAATCAAGTTTGATTTACTTGGGCCATGTTATTAGCCATGCTGGTGTCAGTACTGATCCAAAAAATATTCTTGCTGTGCAACGATGGCCAGTTCCAACTAATGTAAAGGAGGTACGGGGATTTCTTGGCCTGGCAGGTTATTATCGCAAATTTGTTCGGCACTTTGGTGTAATCAGTCGTCCGTTGACAGATCTGCTTAAGAAGAATGTTGTTTTTGTCTGGACTATATCTCATCAGCAAGCATTTGAAGCTTTGAAATCAGCCTTAACTTCTGCACCAGTGCTGGCGATTCCTGATTTCAGTAAGCCTTTTGAGATTGAAACTGACGCGTCTGACAAAGGTGTTGGGGCAGTCTTGATGCAGGCAGGCCATCCATTGGCGTTCTTGAGTAAGGCCTTGGGACCTCGCAATCGCGGTTTATCAATATATGAAAAGGAGTGTCTAGCTATTCTTTTGGCAGTGGATCGCTGGCGCTCTTATCTTCAATTTGGGGAGTTTGTCATCCGTACTGATCAGCGTAGTCTGATTCATCTCGGTGATCAAAAGTTGGCTACGCCTTGGCAGCAGAAGGCAATGACGAAATTATTGGGACTGAATTATCGGTTAGTCTACAAGCGTGGGTTAGATAATAGAGCTGCAGATGCTTTGTCTCGTTGCTCAACTGATGATCACATTCAAGCATGTGCTTTGTCAGTATGTATACCTGACTGGTTAACTGAAGTCCAAGAAGGATATCTGTCTGATCCCTACTCTGCTGATTTGTTATCTAAGGTGACTTTACAAGCTTCTGCTGTACCTAATTTTTCCTTGCGGGATGGCATTTTGCATTATAAGAACAAAATTTGGATTGGCAACAATACTACACTGCAACATCGCATTTTATCAGCCTTGCATTCTGGAGCTATTGGTGGTCATTCTGGGGTGCAGGTGACTTATAGCAGAATAAAGAAACTCTTTGCTTGGCAA-GGATTGAAGAAGTCTGTGCTGG-AATTTATT-GATCAATGTTC-AGTCTGTAAGCAGGCCAAAGCTGAAAGAGTTCATTAGCCGGGGTTGTTGCAGCCTCTTCCGGTTCCCAATCATGCTTGGCAAACTGTTTCCCTTGATTTCATAGGACTACCAAAGTCGACGGGGTTTGATTGTGTTTTAGTGGTGGTTGACAAGTTTTCTCGCTATGCTCATTTTGTGGCATTGTCCCACCCTTTCATAGCTTTAGATGTGGCCCTGGCTTATCTCAACAACATATACAAACTGCATGGTATGCCATAGTCAATTATCTCGGATCGTGATCGCATTTTCACCAGTGCCCTTTGGTCTGAGTTATTTCGACTGACAGATACTCAACTCAAGATGAGTTCTGCATACCATCCTCAAACTGATGGCCAAACCGAGCGTGTCAATCAGTGTCTTGAAACTTTTCTTCGCTGCTTTGTCCATGCCTGTCCTACTAAGTGGTACCGATGGTTGGCTCTAGCGGAGTTTTGGTATAATACAGCTTATCACTCTGCTCTTGGCACATCTCCTTTTGAAGTGCTCTATGGTCACACTCCTCGTCACTTTGGTGTATTGGACATTTCTGCTGCTGCTGTTCCTGATCTTGCTGAGTGGTTGAAAGAACGAGCAATGGTTTCAGGTTTGCTGCTTCAACACTTATTGCGTGCTCAGCAGCGTATGAAGGTTCAGGCAGATAAGAAACGTTCTGAGCGAGAGTTTGCGGTGGGAGATTGGGTTTTTCTCAAAGCTCAACCATATGCGCAGACTTCTTTGGCAGTTCGTTCTAATCACAAGTTAGCTTTTCGCTACTTTGGACCGTTTCAAGTAACTGCTCGAGTGGGTGCAGTGGCTTACCGATTGCAATTACCCCCAGGTTGTTCTATTCACCCTGTTATCCATGTATCTCAGCTTCGTCAGGCGCCTCCACCGGATTCTGCGACGGTTGTCAAGTTACCTGCTGCACTGGCTCCGGATTCTTCAGTTCCGATGCAGATATTGGTGCGTCATCTGTACAAGCTTGGAGCTGCCGTGCGTCCTCAATTCAAGGTGCGTTGGTTTGGCCATGGTGTGGATGAGGCGACTTGGGAGGATGCTGAATCTCTTCGGGTCCGTTTTCCTGCTGCACCGGCTTGGGGACAAGCCGAGTCTGAAGGGGGGGAGAATGTTACGCTGCCTGTAGCAGATATCGACAAAGGCAATCCGCTGAGAAGCTATCGGCGTCCTACGCGGGCTAAGAAACCTAACGTCCGTGTGAGTGGGCCAGAATGGGTCACAGTCCAATGATGTTCTGGTATGGTGTATAAATACCAGAGGGCTAAGAGAGAAGAGGGTGTCGAAAGTGTAAACACAAAACACAAAACTATTCCCCAAATCAAACCTTCTTCTCTATTTTGACATTTCCTCCTCTGTTCCTCCCGTTCTTACTCTGTTCTTCCACTTCCTCTAGAATTCGCTGGATAGATCGTAACACGGGCACGGGGACGTGGTGCTCGGAGGTGATTTCAGCTGGGACGAAGACCTCGACAGGCCGCTCCGGCTGAGGCCCGGGTGGGTGGACGTACGACGTGGCGGCGAACCCGATGCTGAAGGGGTGGCTCAAGCCGGAGATCAGGAAGAGGCCGGACAGGTTCTTGTGCAGGCTGAGGGACTTCAAGCTGGACAGCGTCGAGATGGTCGGCGTGGAGCCGA-TCCCCGGC-GTGAC-GCACTGC-GAC-GACAAGGGGGGCATGCTGCCGGTGCTCCCCAGCCACCACTTCGGTTTGCTGCTCACCATCGCCCCCCAAATCCACAAGTGATCGATCAGCTTAAATCTTCACCATGGCTGCTAAAATTCTAGAACTGGAGATCTTAAGAGTTGATGTCGCTGCCGGCTGCTCTAATGTACCTAAAGTTTAGGTATCTCGAGATTCTTGGAATTAGCTTTGTCATGTGTGTGTGTGTCTCCATGTTGATCAATTGTGTCGATTATCTTTACTTGCTTTGTCAAATCTGTTCTTCGATCCGGTGTTGAAGGGTAACTCTTGGTGAAGAACTGAAGATGATAAGGATCTGCCCTGATGGCATGATCAATGCCTTCCAGTTAATTA] [+] EMBL AK058358 [TACAAGAATTTGCTTCTGTTTTTGAGGAACCTCAAGGTCTGCCACCACAGCGTGATTTTGATCATTCTATACCACTGTTGCCTGGTGCAAGACCTGTCAATCTTCGTCCTTATCGTTATAATCCAGCACAAAAGGATGAGATTGAGCGTCAAGTGACTGAAATGTTGCGTCAGGGTGTTATCCAACCCAGCTCCAGCCCGTTCTCATCTCCAGTATTGTTGGTCCTCAAGAAGGACTTGACATGGAGGTTCTGTATCGACTATCGCCACCTTAATGCTATAACAGTCAAGAATCGATATCCTCTTCCAGTGATTGATGAGTTACTTGATGATCTGGCAGGAGCAACTATATTCACTAGTTTGGATTTAAGGGCGGGTTATCATAAAATCCGTATGCGACCAGAAGATGAACATAAAACTGCGTTCAAAACGCATCATGGACATTACGAGTTTCGGGTTATGTCTTATGGATTAACTGGTGCACCCGCTACTTTCCAAGGTGTCATGAATACAGTGTTATCCCCTTTGCTCCGGAAGGGAGTGCTTGTTTTCATAGATGACATTCTGATTTACAGTGCAACCTTGACAGAACGTGTGCAATTATTACGTCAGGTTTTCCAATTGTTGACTGAACATCAACTTAAGGTGAAGCGCTCTAAGTGTTCATTTGCTCAATCAAGTTTGATTTACTTGGGCCATGTTATTAGCCATGCTGGTGTCAGTACTGATCCAAAAAATATTCTTGCTGTGCAACGATGGCCAGTTCCAACTAATGTAAAGGAGGTACGGGGATTTCTTGGCCTGGCAGGTTATTATCGCAAATTTGTTCGGCACTTTGGTGTAATCAGTCGTCCGTTGACAGATCTGCTTAAGAAGAATGTTGTTTTTGTCTGGACTATATCTCATCAGCAAGCATTTGAAGCTTTGAAATCAGCCTTAACTTCTGCACCAGTGCTGGCGATTCCTGATTTCAGTAAGCCTTTTGAGATTGAAACTGACGCGTCTGACAAAGGTGTTGGGGCAGTCTTGATGCAGGCAGGCCATCCATTGGCGTTCTTGAGTAAGGCCTTGGGACCTCGCAATCGCGGTTTATCAATATATGAAAAGGAGTGTCTAGCTATTCTTTTGGCAGTGGATCGCTGGCGCTCTTATCTTCAATTTGGGGAGTTTGTCATCCGTACTGATCAGCGTAGTCTGATTCATCTCGGTGATCAAAAGTTGGCTACGCCTTGGCAGCAGAAGGCAATGACGAAATTATTGGGACTGAATTATCGGTTAGTCTACAAGCGTGGGTTAGATAATAGAGCTGCAGATGCTTTGTCTCGTTGCTCAACTGATGATCACATTCAAGCATGTGCTTTGTCAGTATGTATACCTGACTGGTTAACTGAAGTCCAAGAAGGATATCTGTCTGATCCCTACTCTGCTGATTTGTTATCTAAGGTGACTTTACAAGCTTCTGCTGTACCTAATTTTTCCTTGCGGGATGGCATTTTGCATTATAAGAACAAAATTTGGATTGGCAACAATACTACACTGCAACATCGCATTTTATCAGCCTTGCATTCTGGAGCTATTGGTGGTCATTCTGGGGTGCAGGTGACTTATAGCAGAATAAAGAAACTCTTTGCTTGGCAA GGATTGAAGAAGTCTGTGCTGG AATTTATT GATCAATGTTC AGTCTGTAAGCAGGCCAAAGCTGAAAGAGTTCATTAGCCGGGGTTGTTGCAGCCTCTTCCGGTTCCCAATCATGCTTGGCAAACTGTTTCCCTTGATTTCATAGGACTACCAAAGTCGACGGGGTTTGATTGTGTTTTAGTGGTGGTTGACAAGTTTTCTCGCTATGCTCATTTTGTGGCATTGTCCCACCCTTTCATAGCTTTAGATGTGGCCCTGGCTTATCTCAACAACATATACAAACTGCATGGTATGCCATAGTCAATTATCTCGGATCGTGATCGCATTTTCACCAGTGCCCTTTGGTCTGAGTTATTTCGACTGACAGATACTCAACTCAAGATGAGTTCTGCATACCATCCTCAAACTGATGGCCAAACCGAGCGTGTCAATCAGTGTCTTGAAACTTTTCTTCGCTGCTTTGTCCATGCCTGTCCTACTAAGTGGTACCGATGGTTGGCTCTAGCGGAGTTTTGGTATAATACAGCTTATCACTCTGCTCTTGGCACATCTCCTTTTGAAGTGCTCTATGGTCACACTCCTCGTCACTTTGGTGTATTGGACATTTCTGCTGCTGCTGTTCCTGATCTTGCTGAGTGGTTGAAAGAACGAGCAATGGTTTCAGGTTTGCTGCTTCAACACTTATTGCGTGCTCAGCAGCGTATGAAGGTTCAGGCAGATAAGAAACGTTCTGAGCGAGAGTTTGCGGTGGGAGATTGGGTTTTTCTCAAAGCTCAACCATATGCGCAGACTTCTTTGGCAGTTCGTTCTAATCACAAGTTAGCTTTTCGCTACTTTGGACCGTTTCAAGTAACTGCTCGAGTGGGTGCAGTGGCTTACCGATTGCAATTACCCCCAGGTTGTTCTATTCACCCTGTTATCCATGTATCTCAGCTTCGTCAGGCGCCTCCACCGGATTCTGCGACGGTTGTCAAGTTACCTGCTGCACTGGCTCCGGATTCTTCAGTTCCGATGCAGATATTGGTGCGTCATCTGTACAAGCTTGGAGCTGCCGTGCGTCCTCAATTCAAGGTGCGTTGGTTTGGCCATGGTGTGGATGAGGCGACTTGGGAGGATGCTGAATCTCTTCGGGTCCGTTTTCCTGCTGCACCGGCTTGGGGACAAGCCGAGTCTGAAGGGGGGGAGAATGTTACGCTGCCTGTAGCAGATATCGACAAAGGCAATCCGCTGAGAAGCTATCGGCGTCCTACGCGGGCTAAGAAACCTAACGTCCGTGTGAGTGGGCCAGAATGGGTCACAGTCCAATGATGTTCTGGTATGGTGTATAAATACCAGAGGGCTAAGAGAGAAGAGGGTGTCGAAAGTGTAAACACAAAACACAAAACTATTCCCCAAATCAAACCTTCTTCT ] [+] EMBL D43230 [ TCTGTCTGATCCCTACTCTGCTGATTTGTTATCTAAGGTGACTTTACAAGATTCTGCTGTACCTAATTCTTCCTTGCGGGATGGGATTTTGCATTATAAGGACAAAATTTGGATTGGCAACAATACTACACTGCAACATCGCATTTTATCAGCCTTGCATTCTGGAGCTATTGGTGGTCATTCTGGGGTGCAGGTGACTTATAGCAGAATAAAGGAACTCTTTGCTTGGCAAGGGNTTGAAGAAGTCTGTGCTGGNAATTTATTGGATCAATGTTCAAGTCTGTAAGC ] [+] EMBL CF306549 [ TTTTTCCTTGCGGGATGGCATTTTGCATTATAAGAACAAAATTTGGATTGGCAACAATACTACACTGCAACATCGCATTTTATCAGCCTTGCATTCTGGAGCTATTGGTGGTCATTCTGGGGTGCAGGTGTTTTATAGCAGAATAAAGAAACTCTTTGCTTGGCAA GGATTGAAGAAGTCTGTGCTGG AATTTATT GATCAATGTTC AGTCTGTAAGCAGGCCAAAGCTGAAAGAGTTCATTAGCCGGGGTTGTTGCAGCCTCTTCCGGTTCCCAATCATGCTTGGCAAACTGTTTCCCTTGATTTCATAGGACTACCAAAGTCGAC ] [+] EMBL AK063640 [ GTAAACACAAAACACAAAACTATTCCCCAAATCAAACCTTCTTCTCTATTTTGACATTTCCTCCTCTGTTCCTCCCGTTCTTACTCTGTTCTTCCACTTCCTCTAGAATTCGCTGGATAGATCGTAACACGGGCACGGGGACGTGGTGCTCGGAGGTGATTTCAGCTGGGACGAAGACCTCGACAGGCCGCTCCGGCTGAGGCCCGGGTGGGTGGACGTACGACGTGGCGGCGAACCCGATGCTGAAGGGGTGGCTCAAGCCGGAGATCAGGAAGAGGCCGGACAGGTTCTTGTGCAGGCTGAGGGACTTCAAGCTGGACAGCGTCGAGATGGTCGGCGTGGAGCCGA TCCCCGGC GTGAC GCACTGC GAC GACAAGGGGGGCATGCTGCCGGTGCTCCCCAGCCACCACTTCGGTTTGCTGCTCACCATCGCCCCCCAAATCCACAAGTGATCGATCAGCTTAAATCTTCACCATGGCTGCTAAAATTCTAGAACTGGAGATCTTAAGAGTTGATGTCGCTGCCGGCTGCTCTAATGTACCTAAAGTTTAGGTATCTCGAGATTCTTGGAATTAGCTTTGTCATGTGTGTGTGTGTCTCCATGTTGATCAATTGTGTCGATTATCTTTACTTGCTTTGTCAAATCTGTTCTTCGATCCGGTGTTGAAGGGTAACTCTTGGTGAAGAACTGAAGATGATAAGGATCTGCCCTGATGGCATGATCAATGCCTTCCAGTTAATT ] [+] EMBL OSS14619A [ CAAAACTATTCCCCAAATCAAACCTTCTTCTCTATTTTGACATTTCCTCCTCTGTTCCTCCCGTTCTTACTCTGTTCTTCCACTTCCTCTAGAATTCGCTGGATAGATCGTAACACGGGCACGGGGACGTGGTGCTCGGAGGTGATTTCAGCTGGGACGAAGACCTCGACAGGCCGCTCCGGCTGAGGCCCGGGTGGGTGGACGTACGACGTGGCGGCGAACCCGATGCTGAAGGGGTGGCTCAAGCCGGAGATCAGGAAGAGGCCGGACAGGTTCTTGTGCAGGCTGAGGGACTTCAAGCTGGACAGCGTCGAGATGGTCGGCGTTGAGCCGATTCCCCGGCGGTTACGGAACTTCGGACNGACAAa ] [+] EMBL AU096650 [ GAGGCCCGGGTGGGTGGACGTACGACGTGGCGGCGAACCCGATGCTGAAGGGGTGGCTCAAGCCGGAGATCAGGAAGAGGCCGGACAGGTTCTTGTGCAGGCTGAGGGACTTCAAGCTGGACAGCGTCGAGATGGTCGGCGTGGAGCCGA TCCCCGGC GTGAC GCACTGC GAC GACAAGGGGGGCATGCTGCCGGTGCTCCCCAGCCACCACTTCGGTTTGCTGCTCACCATCGCCCCCCAAATCCACAAGTGATCGATCAGCTTAAATCTTCACCATGGCTGCTAAAATTCTAGAACTGGAGATCTTAAGAGTTGATGTCGCTGCCGGCTGCTCTAATGTACCTAAAGTTTAGGTATCTCGAGATTCTTGGAATTAGCTTTGTCATGTGTGTGTGTGTCTCCATGTTGATCAATTGTGTCGATTATCTTTACTTGCTTTGTCAAATCTGTTCTTCGATCCGGTGTTGAAGGGTAACTCTTGGTGAAGAACTGAAGATGATAAGGATCTGCCCTGATGGCATGATCAATGCCTTCCAGTTAAaaa] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||