These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9623#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 3540 fasta sequence [GCCGCCTCCCCCCGCTTCGCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCTCTCGCGCGCCGCCGCCGGCGAGCACGTCACCGGAGGCACGGCGCAGACGAGCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCCCCGATTCCTCCCTGCTCCCGCCCCCCGCCCTCCGTCTCGGTTCTATTCGAATCGAATCGAAGGTAAACTCATCCTCCCCTCTCTCTCCCTCTTCCTCCCATATGAGCAGATGTGGGAGATTCATCAGGACATGGATTTGGATTGGTTTTTTTTTAGTACTGAAACCCCCATTTACCCCCAGCACCACCACGTGACGCCCCCTAGTTCAGATGTGTCGCCGTTTGCGCCTAAGATGGCAGTGGCAGAGTGCAGCAAAGAGTTGAGAGATGTTAGTTCGCCATATCGTCAATTAGGATGCTCCACGGAGCTCTCGTCTTGATGTTAGTACAAATTTAGTCGAAAGCCATTCTAATGTGGCGGTGCCCCTGGGCTATTTATTGGGAGCAAGGGGGATTTGCTCCATTTTGTTACCTCTGTACGGTGTCTTTACCAGGAATTTTTAGCCGAAAGGAATCCCGCGCCGCCGATTTTAAGCGCTTTGAATAGATTTTTGGTTATAGCCTCGAATCGCTAGTAATATTCCCTGCGCATCTTCGACTTATGATTCATCACCTGCGGAAACATGTGTAGGTCTGATTTTGTGTTGCAAGAGAGTGTGGAAAGGTAGGTCGGCTAATTCAGTTTGTTTCAGCCGTCCTGTGTATTATATTGTGGTGGTTGGTTTTATTCGGACCTGATTTCCAATGACTACCCTGGTTAATATGGTTATGCTGTATAGCAGTATTTTACTACCTATGTGTATTCTTAACACTTCAGAATGAATAAAATCAATCTATGAATGTGTAAGCCAAAACTTAAATTCTACACTACAGCTGTATAGCTGTAGTAGCAACTGTGGTATTGCTAAAGAAGTCTGTATGTTGGATCGGAAAATGTGAAACCAGAATAATACAGTCCAGTAGTCCATATGTTTTCTTTCTGCCTTTTCTTATAAGGAGTAAGGTTATCAGCCAGATTGTAAGTTTATTTCTGTGAACATGGAACTTGAATAGGCATATGATCTTTCACAGGATTGGGAATTTAGGATATACCCTAATGAACTACAACCTCTAAGCAGCACTGCCTTCTTGTGTGACTAATTAAGCAACTATTAGTTTGATTCTTACTTTCATATGATTTATCTTAAATGGCCATGACTGTTCAATATGTGTCTTACCAGGAATTAGTAGGCAGGGATTCATATGACTGCCTCATTTGTTTTTTTGTTACCTTTGTTTGCTGTTCAATATGTGTCTTACCAGGAATTAGTAGGCAGGGATTCATATGACTGCCTCATATGTTTTTTTGTTACCTTTGTTTGCTGTTCAATATGTGTCTTACCAGGAATTAGTAGGCAGGGATTCCATTCAGATTTTGAGTGCTTTGAATAGACTGGTGATTAGCTTCAATTCTCTAGTAAGATTCCCTGAGCATGCGCAACTTATGGTTCGTCACCCATGGAACCATGTGTAGGCCGATTTTTGTCTTGGCGAAAGTGTACAAGTTTCCTAGGTAGGACAGCTAATTGAATCTGTTTCAGTCGTTCCTATCAATTGTATCATGGTGGTTTTTTTTTTACCTTGAATCCTTGTTCTTATTTCAAATAACCGTGCGTTGCTTATATAGTTATTTTGTACAGTTACTATTTTACTACCTATGGTTTGTGCTGACATCGGAATGAACAAAATCAATATATGAATGGGTAAGTCAAAACATAGAAATCCTACACGGCACTTGCTTGATGGGGTATTACCAAAGAATTCTGTTTATGAAAACAGAATACAGTCCAGTTGTCCATATTTTGCTGCTTTTGCTTATAAAGAGCAAGGTTGCCAGCCAGATTTTCCCTGCGAATTCGGAAATTGAATAGAAGTAGAATCTTTCACAGGATTGGGAATTTAGGATGTACTCCCATATAATTTAATCATTTTAACTTCCGTACCTGTGGAAGCATGAAGATCGGTACTCTGACTATTGTGTCATCTTTTATTTCTTATGAAGAACTACCTATCTCTAATAATGCAACAGGAATGTGGAAGAGTTCTAGATGGAACCATTATACATGGGTAACAGGGGATTAATAGGCATCACTCTTCGTCTGTCTTCTGTAGTTCATATATACCTTCACTTTGCGCTGCATATTAGGCTCTACTCATGGTCTTAGGAATGGTATTTCCGAGCATATTTTGTTACATGGTTCAACAATCTCACTTAATAAGTTCAATGGACGAATTTGAATATACATGATGATGGAGATTTTTTTTCTAATGGAGTACATCTGAATGTGATCTTTGACTTTTGTTGTCTTTTCGTGTGACTAATAATCAACTACTACTTCGATCCCTACTTTCATATTATTTATCTTAAATGGTCATTTGACTGTCTTTTTCTTCTTCATATTATACCATCCTACCTTCTTTTGTATGATTGGGTGGTTCTCGCATGTTTTGCTTAACATTGGAGAACTTATGCTCATTTATGACTGGGTGGTACATTTATGCTCATGCAACATTTGTGTGGCAGAACTTGTTCAGCATCACTCCTTAATTGGCTTGACATCCACCGTAATGTGAACATTCATTATGATGATATCAAAGGTCATGCATTTGTTACC---TTTTTTTTTTTGC-TTTTTTCCGAGGATTCTTCTTATTACTGACCATTATCTCCTAATCTAGTTGTTATGTAGTGTATTTTTAGGAACTGGATATTTCTTCCATGGTTAATGTCCAGAACCATGATAATAGATATTTACTAGTTACATTTCTTTTCGTGTATAGTGTAAGAAGAATTGTTCAG-CATAAAAACTTGTAGCC-TTTTCTGACATCCTTGCATTTTTTTAATTCCTTTTGAATAGGTTGTAAGGATGAAGAAGGGACTGCAT-CCT-CAGATGCAGTGGATTTCATATGTGACACAAAGCGGCAGGTTGATCAATATCATGATGACCAAGGTCAACCATACTGGCAAAGTGTATCATATGAGAGCAAAGCGTCAAATGGCTCAAAGCCTGGGCCAGATTGCAAAGTTCAACCGCCGATACCAGCAGGAATCTGAGGAAAACAAAGAAAAGTAGGCTGCTGTCAGCAAGGAGCTACATATGCTCTAA-GGCAGATTAGTGTGGTGCTATGTTTATCGTCCA-GGAACATTGCTCATGGATCTTT-GTTTTGGATGTCATCCTCTTCCATGTAGCCATCTGATCATTGT-GGTTTATCCCTGTA-GTTTCAGTTCTACCATTCACGAATTTTTC-TGGAGCTATTTTT-GTTGCTCAATTCTGCCCGATATCTCTAGAGAATACAGCATGCTACTTTATGTTTTGTTGATTTTAGATTGAAGCTCCCTGAATTCCTGTAAGATGGCATCGTTTGGCTTGTCATGCTACGTCTCTTTTAGCTTATATAAATTATGTTTATTGTTAGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] 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TTTTTTTTTTTGC TTTTTTCCGAGGATTCTTCTTATTACTGACCATTATCTCCTAATCTAGTTGTTATGTAGTGTATTTTTAGGAACTGGATATTTCTTCCATGGTTAATGTCCAGAACCATGATAATAGATATTTACTAGTTACATTTCTTTTCGTGTATAGTGTAAGAAGAATTGTTCAG CATAAAAACTTGTAGCC TTTTCTGACATCCTTGCATTTTTTTAATTCCTTTTGAATAGGTTGTAAGGATGAAGAAGGGACTGCAT CCT CAGATGCAGTGGATTTCATATGTGACACAAAGCGGCAGGTTGATCAATATCATGATGACCAAGGTCAACCATACTGGCAAAGTGTATCATATGAGAGCAAAGCGTCAAATGGCTCAAAGCCTGGGCCAGATTGCAAAGTTCAACCGCCGATACCAGCAGGAATCTGAGGAAAACAAAGAAAAGTAGGCTGCTGTCAGCAAGGAGCTACATATGCTCTAA GGCAGATTAGTGTGGTGCTATGTTTATCGTCCA GGAACATTGCTCATGGATCTTT GTTTCGGATGTCATCCTCTTCCATGTAGCCATCTGATCATTGT GGTTTATCCCTGTA GTTTCAGTTCTACCATTCACGA ] [+] EMBL AK072109 [ 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CATAAAAACTTGTAGCC TTTTCTGACATCCTTGCATTTTTTTAATTCCTTTTGAATAGGTTGTAAGGATGAAGAAGGGACTGCAT CCT CAGATGCAGTGGATTTCATATGTGACACAAAGCGGCAGGTTGATCAATATCATGATGACCAAGGTCAACCATACTGGCAAAGTGTATCATATGAGAGCAAAGCGTCAAATGGCTCAAAGCCTGGGCCAGATTGCAAAGTTCAACCGCCGATACCAGCAGGAATCTGAGGAAAACAAAGAAAAGTAGGCTGCTGTCAGCAAGGAGCTACATATGCTCTAA GGCAGATTAGTGTGGTGCTATGTTTATCGTCCA GGAACATTGCTCATGGATCTTT GTTTTGGATGTCATCCTCTTCCATGTAGCCATCTGATCATTGT GGTTTATCCCTGTA GTTTCAGTTCTACCATTCACGAATTTTTC TGGAGCTATTTTT GTTGCTCAATTCTGCCCGATATCTCTAGAGAATACAGCATGCTACTTTATGTTTTGTTGATTTTAGATTGAAGCTCCCTGAATTCCTGTAAGATGGCATCGTTTGGCTTGTCATGCTACGTCTCTTTTAGCTTATATAAATTATGTTTATTGTTAGTACATAA ] [+] EMBL C98272 [ nTAAG AGAATTGTTCAGCCNTAAAAACTTGTAGCCTTTTTCTGACANCCTTGCATTTTTTTAATNCCTTTTGAATAGGTTGTAAGGATGAAGAAGGGACTGCATCCCTCCAGATGCAGTGGATTTCATATGTGACACAAAGCGGCAGGTTGATCAATATCATGATGACCAAGGTCAACCATACTGGCAAAGTGTATCATATGAGAGCAAAGCGTCAAATGGCTCAAAGCCTGGGCCAGATTGCAAAGTTCAACCGCCGATACCAGCAGGAATCTGAGGAAAACAAAGAAAAGTAGGCTGCTGTCAGCAAGGAGCTACATATGCTCTAA 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Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||