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Oryza sativa
cluster # 9722 cluster # 9722       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9722#0 length = 1024 sequences # 6  
consensusID : consensus_9722#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1024
fasta sequence 
                              [TACCCATCTCTGTCTCCGTGAGCCCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCCTTTCCGCCGCCGCCACCGCGCGCTCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCTCGCCCACCACCGCGCGCCCTTTCCTCCTCCGCTCCACTCCCACCCGTCGCCGCCACCGCGTGCCCTTCCTCCTGCACTCCGCTCCCACCCGCCACCACCGCGCGCCGTCGACACTCGGCGACCACGACGACGACGCCGGCCGAGAGAGCGGATCCACCGCCAACTCAGGATCCGGAGGCTCCTCCCCTCCCTCTGTACCCTCTCCTTCTCCCAGATCTAGCTGGAAGGGAGTGGTTGGCGCAGAGGAGGTGATGACGCGGTGGAGGAAGAGGATGAAGGGGAGGCGCGGTGGAGGAAAGGGTGGGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTACACGAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGTCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA-GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA-CTGTGAGG-CCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATCTGAATCGGTTTGAATTTGAGTTTTAAAAA]

[+] EMBL AK099457             [TACCCATCTCTGTCTCCGTGAGCCCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCCTTTCCGCCGCCGCCACCGCGCGCTCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCTCGCCCACCACCGCGCGCCCTTTCCTCCTCCGCTCCACTCCCACCCGTCGCCGCCACCGCGTGCCCTTCCTCCTGCACTCCGCTCCCACCCGCCACCACCGCGCGCCGTCGACACTCGGCGACCACGACGACGACGCCGGCCGAGAGAGCGGATCCACCGCCAACTCAGGATCCGGAGGCTCCTCCCCTCCCTCTGTACCCTCTCCTTCTCCCAGATCTAGCTGGAAGGGAGTGGTTGGCGCAGAGGAGGTGATGACGCGGTGGAGGAAGAGGATGAAGGGGAGGCGCGGTGGAGGAAAGGGTGGGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTACACGAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGCCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA CTGTGAGG CCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATCTGAATCGGTTTG                 ]
[+] EMBL AK061871             [                                                    CGCCGCCACCGCGCGCTCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCTCGCCCACCACCGCGCGCCCTTTCCTCCTCCGCTCCACTCCCACCCGTCGCCGCCACCGCGTGCCCTTCCTCCTGCACTCCGCTCCCACCCGCCACCACCGCGCGCCGTCGACACTCGGCGACCACGACGACGACGCCGGCCGAGAGAGCGGATCCACCGCCAACTCAGGATCCGGAGGCTCCTCCCCTCCCTCTGTACCCTCTCCTTCTCCCAGATCTAGCTGGAAGGGAGTGGTTGGCGCAGAGGAGGTGATGACGCGGTGGAGGAAGAGGATGAAGGGGAGGCGCGGTGGAGGAAAGGGTGGGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTACACGAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGTCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA CTGTGAGG CCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATCTG                           ]
[+] EMBL CA763895             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGAGGAAAGGGTGAGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTACACAAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGTCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACA TTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA CTGTGAGG CCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATCTGAATCGGTT                   ]
[+] EMBL CA764110             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGTCAGCGGTGGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGA GCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGATGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI803418             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtCTCGCCAGT CAC GGTTTCA CCGTGTTC GCCGTGCAC GGCGGAGAGACGTGCGA GCAGCAGAGCTC GTT CGGGAGGCAGAT GCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCA CTGTGAGG CCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCACATCTGAATCGGTTTGAATTTGAGTTTTAAAAA]
[+] EMBL BI800775             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tccaccGTGTTC GCCGTGCAC GGCGGAGAGACGTGCGACGCAGCAGAGCTC GTTCCGGGAGGCAGATGCCGGATCC GCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCCATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCCGTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCATCGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGGTGAGGCCATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACAGCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCACCTGTGAGGCCCAACATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAGAAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATC                             ]




>consensus_9722#0
TACCCATCTCTGTCTCCGTGAGCCCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCCTTTCCGCCGCCGCCA
CCGCGCGCTCTTCCTCCTCCGCTCCTCTCTCGCCCACCACCGCGCGCCCTTTCCTCCTCC
GCTCCACTCCCACCCGTCGCCGCCACCGCGTGCCCTTCCTCCTGCACTCCGCTCCCACCC
GCCACCACCGCGCGCCGTCGACACTCGGCGACCACGACGACGACGCCGGCCGAGAGAGCG
GATCCACCGCCAACTCAGGATCCGGAGGCTCCTCCCCTCCCTCTGTACCCTCTCCTTCTC
CCAGATCTAGCTGGAAGGGAGTGGTTGGCGCAGAGGAGGTGATGACGCGGTGGAGGAAGA
GGATGAAGGGGAGGCGCGGTGGAGGAAAGGGTGGGGTGTGCCGATCAGCGACGGGGGTAC
ACGAGAGCTCTGGATCTGTCGGGCGGCGGCGGTGCTCGGCAGTGCACGGGTGTCAGCGGT
GGTCGGCGGTGCACGGGCGGAGAGACGTGCGAGCAGCAGAGCTCGGTTGCGGGAGGCAGA
TGGCGGATCCGGCGGCGACTCGTTCAAGTCCTGCATTGGCAAGTTCTCCATCGGCAAGCC
ATTAGGCAATCCGGCAGCCCCAAGTCCTCGGATCGACGACGGCGTGGAGCTCCTTCCTCC
GTGACGAGCTGCCGCCGTGGAGCTCCGTCCTCCACCGCCGTGGAGCTCCTTCCTTCGCAT
CGAGCCGCTGCCGGGAGCTCGGAGCCTTGGGTTCAGCAACCGCTGCTGTTCTTCTCGTGG
TGAGGCAATGGGTGATGCATGCTGGGATTGAAACATTTTTTTTGTTCCGCAGGATCGACA
GCATGGTTGGCAAAATTAATTTTGATTTTTGTGATGGTGAAATTGCACTGTGAGGCCAAC
ATATTTGAATCGATGCTTGAATTTGTGATTGTGGACTTGTATTTGTGATTTGGTGAGAAG
AAGAGGATGCTTGAATTTGTAATTGAGGGCATATCTGAATCGGTTTGAATTTGAGTTTTA
AAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)