|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9841#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1887 fasta sequence
[GGCCTCTCAAATGTTTGCCAAGAAGTAGTAAAGATTAATTTACTATCAGAATACTCTTACAATATTAGAGTACACGGCCATAGAAAACGGCCACATCAACCAATGTACCCATGCCATCGCTGCCGCTATCAGCTCTACATATAGGATTCTCCCCCTCTTTCTGGTGGAGAAATGATCTTTGCTAGGTCGATCCAAAACCATAATAGTCTCGATTCCAAAAAAAACCGGGATTAAAAATGATCTTTAGTCCCGGTTAAAGATCCTACTAAAAATGTCAGATGTATGTCGGGGGCCGAGGATCTTTAGTCCTGGTTGGTGTCACGCCAACTGGGACTAAAGATCACCACTTTAGTCTTGGTTGGTAATACCAACCGGGACTAAAGATCATCTAGACTCTCGGTTGGTATTACCAACCAGAACTAAAATTAAACGCGTAATATATAATCCCTATCACTTATCCTCTCCTCTACAATCGCAACTCACACAGATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA-CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGCAAGACCGGACTTCGCTTCCCTAACCTTTGATTAATAAATTAATTAATTAGTGTCATTAGCATTTAATTAATTAATAGTAATATTTTTTAATAAACATCATTAGTAATTAATTAATCGGTAATTGTCTGTTAATTATCCACTAATCATGATGCCAGTTGCCAGGCCATCTCGCGAGCGGATGAAGCGAGACCGTGACTGGACCTACGGTATCGCGGCAGGATTTGGCGAGACCGCGGCACGGCGTCACGCCATTGTAATTTTCGCTGAATGGATATCGTTTTGATTTCGTACTCCGACAACGGTATATTTGTTATAAAAAATTTAGGGTAATTGTGTTCTTGTTCTTGCTTTACAGTTGAATTGTGATTTTACCC-CTACTTTTTAGGGTTTATGATTTTGTCCTATCTTTTTGAAAGGAAGGAGTGGAGTGCCCC]
[+] EMBL AK061057 [GGCCTCTCAAATGTTTGCCAAGAAGTAGTAAAGATTAATTTACTATCAGAATACTCTTACAATATTAGAGTACACGGCCATAGAAAACGGCCACATCAACCAATGTACCCATGCCATCGCTGCCGCTATCAGCTCTACATATAGGATTCTCCCCCTCTTTCTGGTGGAGAAATGATCTTTGCTAGGTCGATCCAAAACCATAATAGTCTCGATTCCAAAAAAAACCGGGATTAAAAATGATCTTTAGTCCCGGTTAAAGATCCTACTAAAAATGTCAGATGTATGTCGGGGGCCGAGGATCTTTAGTCCTGGTTGGTGTCACGCCAACTGGGACTAAAGATCACCACTTTAGTCTTGGTTGGTAATACCAACCGGGACTAAAGATCATCTAGACTCTCGGTTGGTATTACCAACCAGAACTAAAATTAAACGCGTAATATATAATCCCTATCACTTATCCTCTCCTCTACAATCGCAACTCACACAGATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGA ]
[+] EMBL CB660622 [ CAGATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGATGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCCAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGAC ]
[+] EMBL CB660620 [ ATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTT ]
[+] EMBL CB651330 [ AATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTACGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCC ]
[+] EMBL CB649175 [ GTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGC ]
[-] EMBL CB660621 [ AACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCACCCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGCAAGACCGGACTTCGCTTCCCTAACCTTTGATTAATAAATTAATTAATTAGTGTCATTAGCATTTAATTAATTAATAGTAATATTTTTTAATAAACATCATTAGTAATTAATTAATCGGTAATTGTCTGTTAATTATCCACTAATCATGATGCCAGTTGCCAGGCCATCTCGCGAGCGGATGAAGCGAGACCGTGACTGGACCTACGGTATCGCGGCAGGATTTGGCGAGACCGCGGCACGGCGTCACGCCATTGTAATTTTCGCTGAATGGATATCGTTTTGATTTCGTACTCCGACAACGGTATATTTGTTATAAAAAATTTAGGGTAATTGTGTTCTTGTTCTTGCTTTACAGTTGAATTGTGATTTTACCC CTACTTTTTAGGGTTTATGATTTTGTCCTATCTTTTTGAAAGGAAGGAGTGGAGTGCCCC]
[-] EMBL CB660623 [ GCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGCAAGACCGGACTTCGCTTCCCTAACCTTTGATTAATAAATTAATTAATTAGTGTCATTAGCATTTAATTAATTAATAGTAATATTTTTTAATAAACATCATTAGTAATTAATTAATCGGTAATTGTCTGTTAATTATCCACTAATCATGATGCCAGTTGCCAGGCCATCTCGCGAGCGGATGAAGCGAGACCGTGACTGGACCTACGGTATCGCGGCAGGATTTGGCGAGACCGCGGCACGGCGTCACGCCATTGTAATTTTCGCTGAATGGATATCGTTTTGATTTCGTACTCCGACAACGGTATATTTGTTATAAAAAATTTAGGGTAATTGTGTTCTTGTTCTTGCTTTACAGTTGAATTGTGATTTTACCCAAGGGTTTTTAGGGTTTATGATTTTGTCCTATCTTTctc ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||