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Oryza sativa
cluster # 9967 cluster # 9967       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9967#0 length = 2115 sequences # 7  

consensusID : consensus_9967#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 2115
fasta sequence
                              [TGTGGACCTTATTAAGCCTACAGTGAAAGTGAATGGAGTTTGGAAAAATGTAGAATATACAAAGGCTACACTGAAAGCGAATGGAGTTGGGAAAAATGCAGAAAATACAAAGGTTCCAACTATTCCTAGCACCCAAAAGTCTAGGAGAAGTACCAGCCAAGCTCATAAAAAGTACATTCAAGGCACTTTTCCTGTTGACGATGGTGATGATGATACTAGGCCA-TCTATTCGACAATCTGGTTCACCAGTTTCAAGATGGAGCAGTTCTGGTAAAGCAGTTGACACTGCCAATCACAGTTATCAAGACACAAAACAAAATCAGCTACCACTATTGTCTTATTCACACCGTGTGCATGGTGCTCACTCCGCTGGAAGAGAGAATTCAAGTAGTGAGAAAGTTGACAGTAGTGCAATCCCATCAACAAATCTGTACATTGAGGATGACAAAAGGTTCAAGGCAGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAAAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTCAAGTACACTTCATTTTTCCACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTGATGATCTTTTGAAGATTGTGATAATGAATGACCATCTAGCTTGTGATCCAGAAGATGGTGGTTGTGGAAAACCAAACCATATTCATCACATTCTTTCTAGCCCCCCTCATGTTTTTACAGTTGTTTTGGGGTGGCAGAACAACAAAGAAAGTGTGGATGACATATCTGGAACTTTGGCTGGTATTTCAACTGAGATAGACATCAGTACTTTCTACCGTGGTCTAGACCAAGGAAGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCA-CGGTGCTTACATTGAAATGTTACAGAATTTCCATAATCCTGGCAAGGTTAAAATGAATGGTCGCCATGTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK062304             [TGTGGACCTTATTAAGCCTACAGTGAAAGTGAATGGAGTTTGGAAAAATGTAGAATATACAAAGGCTACACTGAAAGCGAATGGAGTTGGGAAAAATGCAGAAAATACAAAGGTTCCAACTATTCCTAGCACCCAAAAGTCTAGGAGAAGTACCAGCCAAGCTCATAAAAAGTACATTCAAGGCACTTTTCCTGTTGACGATGGTGATGATGATACTAGGCCA TCTATTCGACAATCTGGTTCACCAGTTTCAAGATGGAGCAGTTCTGGTAAAGCAGTTGACACTGCCAATCACAGTTATCAAGACACAAAACAAAATCAGCTACCACTATTGTCTTATTCACACCGTGTGCATGGTGCTCACTCCGCTGGAAGAGAGAATTCAAGTAGTGAGAAAGTTGACAGTAGTGCAATCCCATCAACAAATCTGTACATTGAGGATGACAAAAGGTTCAAGGCAGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAGAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTCAAGTACACTTCATTTTTCCACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTGATGATCTTTTGAAGATTGTGATAATGAATGACCATCTAGCTTGTGATCCAGAAGATGGTGGTTGTGGAAAACCAAACCATATTCATCACATTCTTTCTAGCCCCCCTCATGTTTTTACAGTTGTTTTGGGGTGGCAGAACAACAAAGAAAGTGTGGATGACATATCTGGAACTTTGGCTGGTATTTCAACTGAGATAGACATCAGTACTTTCTACCGTGGTCTAGACCAAGGAAGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTCTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCA CGGTGCTTACATTGAAATGTTACA                                                                             ]
[+] EMBL CB631939             [                                                                                                                                                                                                                          GGCCACTCTATTCGACAATCTGGTTCACCAGTTTCAAGATGGAGCAGTTCTGGTAAAGCA         GCCAATCACAGTTATCAAGACACAAAACAAAATCAGCTACCACTATTGTCTTATTCACACCGTGTGCATGGTGCTCACTCCGCTGGAAGAGAGAATTCAAGTAGTGAGAAAGTTGACAGTAGTGCAATCCCATCAACAAATCTGTACATTGAGGATGACAAAAGGTTCAAAGCAGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAAAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTNCAGTACACTTCATTTTT CACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB671816             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAAAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTCAAGTACACTTCATTTTTCCACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTGATGATCTTTTGAAGATTGTGATAATGAATGACCATCTAGCTTGTGATCCAGAAGATGGTGGTTGTGGAAAACCAAACCATATTCATCACATTCTTTCTAGCCCCCCTCATGTTTTTACAGTTGTTTTGGGGTGGCAGAACAACAAAGAAAGTGTGGATGACATATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CB671817             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTGGATGACATATCTGGACCTTTGGCTGGTATTTCAACTGAGATAGACATCAGTACTTTCTACCGTGGTCTAGACCAAGGAAGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGAGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCACCGGTGCTTAACTTAAAAaga                                                                                 ]
[-] EMBL CB631940             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATAGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCGTTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAAGGATATGTTTTTGGGAGCA CGGTGCTTACATTGAAATGTTACAGAATTTCCATAATCCTGGCAAGGTTAAAATGAATGGTCGCC                                    ]
[+] EMBL AU057332             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCA                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AU057333             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGATTTTGNCATAGGAGTGGGAGGGTGNCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCA CGGTGCTTACATTGAAATGTTACAGAATTTCCATAATCCTGGCAATGTTAAAATGAATGGTCGCCATGTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_9967#0 TGTGGACCTTATTAAGCCTACAGTGAAAGTGAATGGAGTTTGGAAAAATGTAGAATATAC AAAGGCTACACTGAAAGCGAATGGAGTTGGGAAAAATGCAGAAAATACAAAGGTTCCAAC TATTCCTAGCACCCAAAAGTCTAGGAGAAGTACCAGCCAAGCTCATAAAAAGTACATTCA AGGCACTTTTCCTGTTGACGATGGTGATGATGATACTAGGCCATCTATTCGACAATCTGG TTCACCAGTTTCAAGATGGAGCAGTTCTGGTAAAGCAGTTGACACTGCCAATCACAGTTA TCAAGACACAAAACAAAATCAGCTACCACTATTGTCTTATTCACACCGTGTGCATGGTGC TCACTCCGCTGGAAGAGAGAATTCAAGTAGTGAGAAAGTTGACAGTAGTGCAATCCCATC AACAAATCTGTACATTGAGGATGACAAAAGGTTCAAGGCAGACCTTGAGAGAGCTGTGCT TCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGC TGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTT TCGTGATGGATTTCTTAAAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGT CTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGC TGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTT TCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCA TAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGG TTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCT TGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTCAAGTACACTTCATT TTTCCACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTC ATTTGATGATCTTTTGAAGATTGTGATAATGAATGACCATCTAGCTTGTGATCCAGAAGA TGGTGGTTGTGGAAAACCAAACCATATTCATCACATTCTTTCTAGCCCCCCTCATGTTTT TACAGTTGTTTTGGGGTGGCAGAACAACAAAGAAAGTGTGGATGACATATCTGGAACTTT GGCTGGTATTTCAACTGAGATAGACATCAGTACTTTCTACCGTGGTCTAGACCAAGGAAG CAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTT TGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGA TGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGC TGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATT GATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTG CACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAG AAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGAT CCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTG CCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAG CTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGT GGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGG AAAATGTTGGGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCACGGTGCTTACATTGAAATGTTACAGA ATTTCCATAATCCTGGCAAGGTTAAAATGAATGGTCGCCATGTTCTTTAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)