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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10005#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 1048 fasta sequence
[TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCAGAATTGCTCTCAAGCACTTTATTGGTTCTTTTGCATTCCCTGATCATCTGAGGCAATCATTATTTCCTAGATGAACTTTTTTTGATGCTTTTTTTATTGTTTAGGGATTTAGCGCAAGTAGGACAAAACCATCGACCTTTCGGTGCAACGGTTAGGTTCACGCAAGCGTAGTGAAACCATTCGAAGGGGCAGTCTGGGGCGTCGCATGCTATCATGTCACCATAACTCACATCTCGGCATATGCAGTAACGCTTGTAATCTTCATCATCATCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGTTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGGTTTTAGCATCCAGTGACATGTCTGGTAGCAAGC-ATGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG-AGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATTTAGTATTTTCCAAAAACGGCGCCGAATA]
[+] EMBL AI395454 [TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCAGAATTGCTCTCAAGCACTTTATTGGTTCTTTTGCATTCCCTGATCATCTGAGGCAATCATTATTTCCTAGATGAACTTTTTTTGATGCTTTTTTTATTGTTTAGGGATTTAGCGCAAGTAGGACAAAACCATCGACCTTTCGGTGCAACGGTTAGGTTCACGCAAGCGTAGTGAAACCATTCGAAGGGGCAGTCTGGGGCGTCGCATGCTATCATGTCACCATAACTCACATCTCGGCATATGCAGTAACGCTTGTAATCTTCATCATCATCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGGTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAAGATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCCGACT ]
[+] EMBL CD128626 [ TATCATGTCACCATAACTCACATCTCGGCATATGCAGTAACGCTTGTAATCTTCATCATCATCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGTTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGT ]
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[-] EMBL CD132894 [ tCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGG ]
[+] EMBL CD189978 [ ctgtcCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGGTTTTAGCATCCAGTGACATGTCTGGTAGCAA ]
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[+] EMBL CD132418 [ TGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGA CATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGGNAG TATTTGAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATT ]
[-] EMBL CD132383 [ GGGTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG AGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATTTAGTATTTTCCAGACACG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||