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Schistosoma mansoni
cluster # 10007 cluster # 10007       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10007#0 length = 2413 sequences # 13  

consensusID : consensus_10007#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 2413
fasta sequence
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[+] EMBL CD068638             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCAGAACGC GAGGAAATCGTGGA TGTTGTTGTCTAGCGATGTAGATCATCGTGGACCAACTTTGAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCAGTTCATAAAAATTGGAAAGATGTCGATGCATATGATGAAGATGATTTACGTGATACACCACAAACTGTAGAGGTACCAGGACAACCAACTACCAAGAAACCCCAACCTGTTGGGCCTGGAGTTAAGAAGAGACCATTCTCTAAAAAGAATGAATTTGTACCTCCATATGAAATTGTACCATGTATGCGCCCTGTTGTATTTGTTGGTCCAGCTTTGAAAGGTTATGAAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD169418             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTAGAACGCGGAGGAAATCGTGGATTGTTGTTGTCTAGCGATGTAGATCATCGTGGACCAACTTTGAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCGGTTCATAAAAATTGGAAAGATGTCGATGCATATGATGAAGATGATTTACGTGATACACCACAAACTGTAGAGGTACCAGGACAACCAACTACCAAGAAACCCCAACCTGTTGGGCCTGGAGTTAAGAAGAGACCATTCTCTAAAAAGAATGAATTTGTACCTCCATATGAAATTGTACCATGTATGCGCCCTGTTGTATTTGTTGGTCCAGCTTTGAAAGGTTATGAAGTGACAGATATGATGCAGAAAGCAATATTTGATGCAATGAAGAAACATTTTGATGGAAGAATTATTGTTAGTCGTGTCAGTACAAATATATCATTGGCTAAACGTGTTGGAGAATTATTACATTTGGATAAAAAGAATATTTTAGAAAAAGGACGTAGTCGACAGCTTGTTTCCTTAATTGAAGTTCAACAAGATTTAGAAAGAATATTTCATTTGGGTAGTAAAATGCAATTACTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD169401             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTAGAACGCGGAGGAAATCGTGGATTGTTGTTGTCTGGCGATGTAGATCATCGTGGACCAACTTTGAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCAGTTCATAAAAATTGGAAAGATGTCGATGCATATGATGAAGATGATTTACGTGATACACCACAAACTGTAGAGGTACCAGGACAACCAACTACCAAGAAACCTCAACCTGTTGGGCCTGGAGTTAAAAAAAGACCATTCTCTAAAAAGAATGAATTTGTACCTCCATATGAAATTGTACCATGTATGCGCCCTGTTGTATTTGTTGGCCCAGCTTTGAAAGGTTATGAAGTGACAGATATGATGCAGAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD169175             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTAGAACGCGGAGGAAATCGTGGATTGTTGTTGTCTAGCGATGTAGATCATCGTGGACCAACTTTGAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCAGTTCATAAAAATTGGAAAGATGTCGATGCATATGATGAAGATGATTTACGTGATACACCACAAACTGTAGAGGTACCAGGACAACCAACTACCAAGAAACCCCAACCTGTTGGGCCTGGAGTTAAGAAGAGACCATTCTCTAAAAAGAATGAATTTGTACCTCCATATGAAATTGTACCATGTATGCGCCCTGTTGTATTTGTTGGTCCAGCTTTGAAAGGTTATGAAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD169141             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTAGAACGCGG GGAAATCGTGGATTGTTGTTGTCTAGCGATGTA ATCATCGTGGACCAACTTTGAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCA TT ATAAA   T GAAAGAgcatgc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD169157             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAGAACGCGAAGGAAATCGTGGATTGTTGTTGTCTACCGATGTAGATCATCGTGGACCAACTTTGAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCAGTTCATAAAAATTGGAAAGATGTCGATGCATATGATGAAGATGATTTACGTGATACACCACAAACTGTAGAGGTACCAGGACAACCAACTACCAAGAAACCCCAACCTGTTGGGCCTGGAGTTAAGAAGAGACCATTCTCTAAAAAGAATGAATTTGTACCTCCATATGAAATTGTACCATGTATGCGCCCTGTTGTATTTGTTGGTCCAGCTTTGAAAGGTTATGAAGTGACAGATATGATGCAGAAAGCAATATTTGATGCAATGAAGAAACATTTTGATGGAAGAATTATTGTTAGTCGTGTCAGTACAAATATATCATTGGCTAAACGTGTTGGAGAATTATTACATTTGGATAAAAAGAATATTTTAGAAAAAGGACGTAGTCGACAGCTTGTTTCCTTAATTGAAGTTCAACAAGATTTAGAAAGAATATTTCATTTGGGTAGTAAAATGCAATTACTTTTATTAGATTGTGATACAATTAATCATCCAAATCAAATTACTAAAACATGCTTAGCACCTATTGTAATTTATATCAAAATTACTAGTATACGTGTATTAAATCGTTTAATTAAAAATCGTGGTAAATTACAAAAAAAGAATGCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD168876             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAGAACGCGGAGGAAATCGTGGATTGTTGTTGTCTAGCGATGTAGATCATCGTGGACCAACTTTGAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCAGTTCATAAAAATTGGAAAGATGTCGATGCATATGATGAAGATGATTTACGTGATACACCACAAACTGTAGAGGTACCAGGACAACCAACTACCAAGAAACCCCAACCTGTTGGGCCTGGAGTTAAGAAGAGACCATTCTCTAAAAAGAATGAATTTGTACCTCCATATGAAATTGTACCATGTATGCGCCCTGTTGTATTTGTTGGTCCAGCTTTGAAAGGTTATGAAGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD202977             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGTGGTAAATTACAAAAAAAGAATGCTGGTGTACAAACTGCCGCCGCTGAAAAACTATTACAATGTTCACCAGAATCATTCGATTACGTAATAGATCAAAATAATTTATCCACTGCAACAGAAGCACTAAGTCATTTCTTAGAAGGCTATTGGGCAGCAACACATCCTCCTTTAATAGTTAGTAAAGCTGAACGTCTTCTTGGCTCTTTTTCTGCTCCAGTGCCTGAAACAAAAGAAGTTGACTCAGATCGTCCACTTGTACCTATGACACCTGGTCATCCAGGGTTGAGTGTAGTTACCAAATCTGCATTAAGTGCAGGATTTACTAGTCAAGAAATTAGTGAATTAACCGGAGCAAGAGCAACTGGTTGGTTAACAGAAAATGGTGGACCAGTTGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_10007#0 CCGCGAATTCCCCTTGGCCATGGGTTCAAGACGTTCCAGTGAAAGTACTAGTTCAGTTGA TAGTGAAGTAATTTTAGAAGCTGAACGTTTAGAATTAGAACGTTTAGCTTTAAAAGAACT TGAATTAGCAGTTTCTAAACCTGTAGCTTTTTCAGTTAGAACTAATATAAGTTTTGATGG AGCCTTATATGGTTTGGATGCACCATCACCGACTAGAGTTGTTAGTTTTGGAATAAAAGA TTTCCTACATATTAAAAAACGTTTCAATCAAGATTGGTGGATTGGTCGTGTAGTTCGAAT AGGTAGTCCAATTGGTTTTATACCTAGTCCATCTAAACTTGAAGTAATCAATAATATTAT TTTATCGGCCATTACCACTGCTGCTAATACTAATGTGGTACACTTTGCCAATGAAATTCA AAATCCGACAACTAAACCAGCTCCTGTTGGTGGATTCGGATCTGCAGACACAACGTTAGA ACGCGGAGGAAATCGTGGATTGTTGTTGTCTAGCGATGTAGATCATCGTGGACCAACTTT GAGTGCTAATCGTCAAAGGCAATCGGAATCACCTCCAGTTCATAAAAATTGGAAAGATGT CGATGCATATGATGAAGATGATTTACGTGATACACCACAAACTGTAGAGGTACCAGGACA ACCAACTACCAAGAAACCCCAACCTGTTGGGCCTGGAGTTAAGAAGAGACCATTCTCTAA AAAGAATGAATTTGTACCTCCATATGAAATTGTACCATGTATGCGCCCTGTTGTATTTGT TGGTCCAGCTTTGAAAGGTTATGAAGTGACAGATATGATGCAGAAAGCAATATTTGATGC AATGAAGAAACATTTTGATGGAAGAATTATTGTTAGTCGTGTCAGTACAAATATATCATT GGCTAAACGTGTTGGAGAATTATTACATTTGGATAAAAAGAATATTTTAGAAAAAGGACG TAGTCGACAGCTTGTTTCCTTAATTGAAGTTCAACAAGATTTAGAAAGAATATTTCATTT GGGTAGTAAAATGCAATTACTTTTATTAGATTGTGATACAATTAATCATCCAAATCAAAT TACTAAAACATGCTTAGCACCTATTGTAATTTATATCAAAATTACTAGTATACGTGTATT AAATCGTTTAATTAAAAATCGTGGTAAATTACAAAAAAAGAATGCTGGTGTACAAACTGC CGCCGCTGAAAAACTATTACAATGTTCACCAGAATCATTCGATTACGTAATAGATCAAAA TAATTTATCCACTGCAACAGAAGCACTAAGTCATTTCTTAGAAGGTTATTGGGCAGCAAC ACATCCTCCTTTAATAGTTAGTAAAGCTGAACGTCTTCTTGGCTCTTTTTCTGCTCCAGT GCCTGAAACAAAAGAAGTTGACTCAGATCGTCCACTTGTACCTATGACACCTGGTCATCC AGGGTTGAGTGTAGTTACCAAATCTGCATTAAGTGCAGGATTTACTAGTCAAGAAATTAG TGAATTAACCGGAGCAAGAGCAACTGGTTGGTTAACAGAAAATGGTGGACAAGTAGAAAA TGAACTTGGACTTACTGGTGTACATCATGCTGGTAGCGTTGGTAGTGAATTTCATAATAC ACATTTTGGCGGAAGAAAACTTAAAACTGATCATAATAATAGTCCTGATGGTCTTAACAC AACACATTATTCAGATGATGAAAATGAAGGTTCACGTCCAAATTATCCTCGTAATGGTCG ATTACATATGGGTGCTGCAAGTGCAGCGGCAATTGCTGCTGTTGCCGCTGGACTTACACC TAAAGTTCACTCGTTACATCCATCATTATTTCAAGGTGAAAATAAACGAAATGGTTCAGT AATTCGTGATATAAATGGCAATACTACACATGAATCACCTGGTTTAACTATGGGTTTAGG ATTGGGTATAGCAAATGGGGTTGCAGCCACTATCAGTGCTGCTCTGTTTCCCAGCCATAA TAGTACTAATCATCATCAGCATCATTCAGCAGAGAACTATCATCAACCAACATCAAGAAT ACCACCTCCAACAATTGCTGCCGCAGCTGTAGCGTCTGTAGTTTCACCACCGTTAAAAGA CTTGGGTATTCATCAAGTGGAAGGAAGTGATGGAACACAAGTCTATCAAAGTAGATCAGC TCGTCAAGCAAAGCAACGTGAAGAACAATTAGCACGAGTAAAACAAGAAGTTGAAGCTAA AGCTTTAGCATTACAAGCTACTGCAGGTGGTAGACGAAGACGTCGAGATAAAGAAAGAAG ACAAAGAAATCCTGACGGTTATTGGGATTCACATGATGAACGTTATCATGCTCATGGAAC AAATGATTTATCACAACATTCTCATCAATGGAATGGACCACCTGTTCGATCTATGGCAAG AGCATGTCCACCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)