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Schistosoma mansoni
cluster # 10020 cluster # 10020       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10020#0 length = 929 sequences # 13  

consensusID : consensus_10020#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 929
fasta sequence
                              [GTTTCCAAACGTGTGTGAGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC-CCGATCACTGTGATACACCA-AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCTATCCAGGGTTTCCATATAGTTAGCTATACTCTAGCAATATACTTATTGAGTTTATTCATATCA-TTTATTTCCCCAAAAGTAGATCCTGCTGCTGCAGATTATTCAGATGAAATCCCTACACTCCCACGAACTGTAGGTGAAGAGTTCAGACCTTTTATACCAAGATTACTTGAGTCGAAATTCTGGCTCTCCACCGTCCGTGCTGTTTCGATCAGTATATTTTGCACATATCTTCCCTTCTTGGATATTCCAGTATTTTGGCCGATACTAGTAATGTATTT-TATAATGTTGTTTGCTATTATGATGAAGAAGCAAATCAAGCATATGATTAAATATCGCTACGTTCCATTTACTTATGGGAAACCGAGACCTATGGGATCAAACAATAAGGAACAACCATCTCCTGTGATTAATTCATGATTTATAATTACAAAGAAGTTGTCTGCTTCATCTTTTGTTCATTTTAGGTATTTGTACATAGTTGTTTTGATCTTATCTTTGCTCTGTATATTTAATTTTGATTGTATTTTTATGCTTCAAAAGAGAATGTCGATTATTGG-AAATAGAAATGTCTNTG-TNTACATCACATAGNTTGTATATTTCTTTNTATCNGTG-AAAATCTCTTGGTC-TTTTCTAT-ATAAAGTT]

[+] EMBL CD145026             [GTTTCCAAACGTGTGTGAGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACACCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCTATCCGGGGTTTCCATATAGTTAGCTATACTCTAGCAATATACTTATTGAGTTTATTCATATCA TTTATTTCCCCAAAAGTAGATCCTGCTGCTGCAGATTATTCAGATGAAATCCCTACACTCCCACGAACTGTAGGTGAAGAGTTCAGACCTTNTATACCAAGATTACTTGAGTCGAAATTCTGGCTCTCCACCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD189050             [    CCAAACGTGTGTGAGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACATCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD139785             [                 AGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAGGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACACCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCTATCCAGGGTTTCCATATAGTTAGCTATACTCTAGCAATATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD139841             [                 AGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACACCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCTATCCA GGTTTCCATATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD139570             [                 AGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACACCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCTATCCAGGGTTTCCATATAGTTAGCTATACTCTAGCAATATACTTATTGAGTTTATTCATATCA TTTATTTCCCCAAAAGTAGATCCTGCTGCTGCAGATTATTCAGATGAAATCCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD139635             [                 AGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACACCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCTATCCAGGGTTTCCATATAGTTAGCTATACTCTAGCAATATACTTATTGAGTTTATTCATATCATTTTATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD080564             [                     GTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACATCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCCATCCAGGGTTTCCATATAGTTAGCTATACTCTAGCAATATACTTATTGAGTTTATTCATATCA TTTATTTCCCCAAAAGTAGATCCTGCTGCTGCAGATTATTCAGATGAAATCCCTACACTCCCACGAACTGTAGGTGAAGAGTTCAGACCTTTTATACCAAGATTACTTGAGTCGAAATTCTGGCTCTCCACCGTCCGTGCTGTTTCGATCAGTATATTTTGCACATATCTTCCCTTCTTGGATATTCCAGTATTTTGGCCGATACTAGTAATGTATTT TATAATGTTGTTTGCTATTATGATGAAGAAGCANATCAAGCATATGATTAAATATCGCTACGTTTCATTTACTTATGGGAAACCGAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD195090             [                                      TGGTGGGCTTGTTGACTAAAGTCGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGTTGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGC CCGATCACTGTGATACATCA AACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTTTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCCATCCAGGGTTTCCATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD082128             [                                                                                                                                            accTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGCTCTGATCACTGTGATACATCACAACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGTTTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCCATCCAGGGTTTCCATATAGTTAGCTATACTCTAGCAATATACTTATTGAGTTTATTCATATCA TTTATTTCCCCAAAAGTAGATCCTGCTGCTGCAGATTATTCAGATGAAATCCCTACACTCCCACGAACTGTAGGTGAAGAGTTCAGACCTTTTATACCAAGATTACTTGAGTCGAAATTCTGGCTCTCCACCGTCCGTGCTGTTTCGATCAGTATATTTTGCACATATCTTCCCTTCTTGGATATTCCAGTATTTTGGCCGATACTAGTAATGTATTT TATAATGTTGTTTGCTATTATGATGAAGAAGCAAATCAAGCATATGATTAAATATCGCTACGTTCCATTTACTTATGGGAAACCGAGACCTATGGGATCAAACAATAAGGAACAACCATCTCCTGTGATTAATTCATGATTTATAATTACAAAGAAGTTGTCTGCTTCATCTTTTGTTCATTNTAGGTATTTGTACATAGTTGNTNTGATCTTATCTTTGCTCTGTATATTTAATTNTGATTGTATTTTTATGCTTC AAAGAGAATGTCGATTATTGG AAATAGAAATGTCTNTG TNTACATCACATAGNTTGTATATTTCTTTNTATCNGTG AAAATCTCTTGGTC TTTTCTAT ATAA    ]
[-] EMBL CD075743             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAGTAGATCCTGCTGCTGCAGATTATTCAGATGAAATCCCTACACTCCCACGAACTGTAGGTGAAGAGTTCAGACCTTTTATACCAAGATTACTTGAGTCGAAATTCTGGCTCTCCACCGTCCGTGCTGTTTCGATCAGTATATTTTGCACATATCTTCCCTTCTTGGATATTCCAGTATTTTGGCCGATACTAGTAATGTATTT TATAATGTTGTTTGCTATTATGATGAAGAAGCAAATCAAGCATATGATTAAATATCGCTACGTTCCATTTACTTATGGGAAACCGAGACCTATGGGATCAAACAATAAGGAACAACCATCTCCTGTGATTAATTCATGATTTATAATTACAAAGAAGTTGTCTGCTTCATCTTTTGTTCATTTTAGGTATTTGTACATAGTTGTTTTGATCTTATCTTTGCTCTGTATATTTAATTTTGATTGTATTTTTATGCTTCAAAAGAGAATGTCGATTATTGGAAAATAG AATGTCTTTGTTTTACATCACATAGTTTGTATATTTCTTTTTATCGTTGAAAAATCTCTTGGTCTTTTTCTATAATAAAGTT]
[-] EMBL CD139600             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aATCAGTATATTTTGCACATATCTTCCCTTCTTGGATATTCCAGTATTTTGGCCGATACTAGTAATGTATTT TATAATGTTGTTTGCTATTATGATGAAGAAGCAAATCCAGCATATGATTAAATATCGCTACGTTCCATTTACTTATGGGAAACCGAGACCTATGGGATCAAACAATAAGGAACAACCATCTCCTGTGATTAATTCATGATTTATAATTACAAAGAAGTTGTCTGCTTCATCTTTTGTTCATTTTAGGTATTTGTACATAGTTGTTTTGATCTTATCTTTGCTCTGTATATTTAATTTTGATTGTATTTTTATGCTTCAAAAGAGAA                                                                                                       ]
[-] EMBL CD139611             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATTTATA AATGTTGTTTGCTATTATGATGAGAAAGCAAATCAAGCATATGATTAAATATCGCTACGTCCCATTTACTTATGGGAAACCGAGACCTATGGGATCAAACAATAAGGAACAACCATCTCCTGTGATTAATTCATGATTTATAATTACAAAGAAGTCGTCTGCTTCATCTTTTGTTCATTTTAGGTATTTGTACATAGTTGTTTTGATCTTATCTTTGCTCTGTATATTTAATTCTGATTGTATTTTTATGCTTCAAAAGAGAA                                                                                                       ]
[-] EMBL CD139851             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCGAGACCTATGGGATCAAACAATAAGGAACAACCATCTCCTGTGATTAATTCATGATTTATAATTACAAAGAAGTTGTCTGCTTCATCTTTTGTTCATTTTAGGTATTTGTACATAGTTGTTTTGATCTTATCTTTGCTCCGTATATTTAATTTTGATTGTATTTTTATGCTTCAAAAGAGAA                                                                                                       ]


>consensus_10020#0 GTTTCCAAACGTGTGTGAGTTGTTAAAGTGACAGCAGTTGGTGGGCTTGTTGACTAAAGT CGCTGTTGGATGGTCTTTACCACCATTATCGGAAACAGTTCTAAATCTTTATTATGAAGT TGGATCAGACAAGTGATGAGTCGTCTAATACGTTACTGTCGAAGGTTTGTCGCCCGATCA CTGTGATACACCAAACCATAATTGATAAGCTCTATCCGTATAGGATAACTAGATGGCTGT TTGCATTGTTGTTATTTGCCATTTATGTGCTCCGGATAGCATCTATCCAGGGTTTCCATA TAGTTAGCTATACTCTAGCAATATACTTATTGAGTTTATTCATATCATTTATTTCCCCAA AAGTAGATCCTGCTGCTGCAGATTATTCAGATGAAATCCCTACACTCCCACGAACTGTAG GTGAAGAGTTCAGACCTTTTATACCAAGATTACTTGAGTCGAAATTCTGGCTCTCCACCG TCCGTGCTGTTTCGATCAGTATATTTTGCACATATCTTCCCTTCTTGGATATTCCAGTAT TTTGGCCGATACTAGTAATGTATTTTATAATGTTGTTTGCTATTATGATGAAGAAGCAAA TCAAGCATATGATTAAATATCGCTACGTTCCATTTACTTATGGGAAACCGAGACCTATGG GATCAAACAATAAGGAACAACCATCTCCTGTGATTAATTCATGATTTATAATTACAAAGA AGTTGTCTGCTTCATCTTTTGTTCATTTTAGGTATTTGTACATAGTTGTTTTGATCTTAT CTTTGCTCTGTATATTTAATTTTGATTGTATTTTTATGCTTCAAAAGAGAATGTCGATTA TTGGAAATAGAAATGTCTNTGTNTACATCACATAGNTTGTATATTTCTTTNTATCNGTGA AAATCTCTTGGTCTTTTCTATATAAAGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)