Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10023 cluster # 10023       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10023#0 length = 731 sequences # 13  

consensusID : consensus_10023#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 731
fasta sequence
                              [ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT-CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA-TTTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG-TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATTTGTAAAAAAATAACAATGTAAAAAAAAAAAAN]

[+] EMBL CD185705             [ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGTCTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCGACTGCAGTTTTATT CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTATTTTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTTATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACA                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD157577             [ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD185725             [ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATTAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATA CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTACTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD183215             [  TCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA  TTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGGATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCNCACAA                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI977308             [                                                             TCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGTCCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AA952766             [                                                                                                                                                                                                       TATTGCATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD200916             [                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGGTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTAAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCC TTTTTTTACCCCAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACCTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTGTGTACACATGCGCGCACACACACACATACATACGTGCCCACTCATGTGCGCGCACACAC                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL AI976790             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  taaACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGTCCAGTGTTATTTATTTTCCTTTAACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATTTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTGGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAATTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATT                                      ]
[-] EMBL AI395297             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cctTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACGTTAGTTTTG TATACATATTGATTAGTAGTTGAGGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGATTGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAACTTTGTAAAAAAATAACAATGTAAAA         ]
[-] EMBL AI067071             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAGTAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCA                                                         ]
[-] EMBL AI395562             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacaACATA TGGTTAGTAGTGGAAGTA TGGTTAATCTAATAAACAGGAATG ATGA TTCACGTT CCCTTTTTTTTACCCCAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATCCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATTTGT AATCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAN]
[-] EMBL AA999323             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTATGTCTAG TTTGTATCCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATTTATAATTGGACGTCTGTACACATGGGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGGGCGCACACACAGTCACGCCCACAACTACATTTCCCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATT                                ]
[+] EMBL CD168956             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTCTAGCTTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACAAACta                                                                                                                                                                               ]


>consensus_10023#0 ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCA TTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATAT GATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGA ATTCTATCAACTGCAGTTTTATTCATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGG AAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTATTTTTTTT TCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGAT TAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTT TTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAGTTTGTATTC CACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCAC ACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTAC ATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAG AAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATTTGTAAAAAAATAACAATGTAA AAAAAAAAAAN



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)