These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10023#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 731 fasta sequence [ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT-CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA-TTTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG-TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATTTGTAAAAAAATAACAATGTAAAAAAAAAAAAN] [+] EMBL CD185705 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CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTACTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACG ] [+] EMBL CD183215 [ TCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGGATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCNCACAA ] [+] EMBL AI977308 [ TCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGTCCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGA ] [+] EMBL AA952766 [ TATTGCATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TT ] [-] EMBL CD200916 [ AAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGGTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTAAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCC TTTTTTTACCCCAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACCTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTGTGTACACATGCGCGCACACACACACATACATACGTGCCCACTCATGTGCGCGCACACAC ] [-] EMBL AI976790 [ taaACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGTCCAGTGTTATTTATTTTCCTTTAACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATTTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTGGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG 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multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||