|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10039#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 796 fasta sequence
[TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAATGATGGTTTGCAAAGTGACGTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATTCAATAGGTTACTAAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGATCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGG-TCATTGAAAAAACCTAGCTTTATGTGGTTAATTACAAGAATCACATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACATCCTATTTGCATAAATAAACATTTGTTTGAAACTTTCTTAACATATACTGGCTTAATATCAAGTCATAAACTGGATGTAATTGTCTTAAATA]
[+] EMBL CD091083 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAACATATTGTAAAGGCTCACAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCCTTATAAATGATGGTTTGC ]
[+] EMBL CD091110 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGGATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTCTATAAATGATGGT ]
[+] EMBL CD091091 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAGGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAATGATG ]
[+] EMBL CD091079 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAAT ]
[+] EMBL CD091118 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAAC ]
[+] EMBL CD091108 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATCAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAGAATATTGTCAAGGCTCAAAGTG ]
[+] EMBL CD091103 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTACAGGCTC ]
[+] EMBL CD091087 [TTATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCT ]
[+] EMBL CD091082 [tcATACTTTATTTGGCAATATTAACCAAATGATCATTTACATGTAAGATTAACGGGAACTAATGTTTAGCACTCATTGAAGAATATTCAAGTAAGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGAGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTCAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAA ]
[+] EMBL CD091105 [ CACTCATTGAAGAATATTCCCGTAGGCGTTGGGAATTTTCATAACACAAAGGAACTAATGTTGATAAGCAGAAGGGTCCTTAAAATGTTATCACTAGTCAAAAGTGCAACGAATGTAATTCACCTGTGGAAGATTTTGGAAAATATATGGATAAAGTGAAGAATTTTAAGTTCCTTAACTTTAGGAATTGGGGTTTACAACTAATGACACAAGACTTAAGGCGGGAGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGCTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAAAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAAC ]
[-] EMBL CD164551 [ AGTTATCCGGAAATACTATTGAACGTGGTTGTTGAGGCTACATCACGAATGTTACTATGAAATGAACTAGTGAGATTGAGCTTCTCATGAGTGAAACGAAAAATATTGTAGAGGCTCAAAGTGAGGTCAAGCAACACAAACTCTTTATAAATGATGGTTTGCAAAGTGACGTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATCCAATAGGTTACTAAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGATCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGGTTCATTGAAAAAACCTAGTTTTATGTGGTTAATTACAAGAATCTCATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACA ]
[-] EMBL CD091123 [ ACAAACTCTTTATAAATGATGGTTTGCAAAGTGACGTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATTCAATAGGTTACTAAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGATCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGG TCATTGAAAAAACCTAGCTTTGTGTGGTTAATTACAAGAATCACATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACATCCTATTTGCATAAATAAACATTTGTTTGAAACTTTCTTAACATATACTGGCTTAATATCAAGTCATAAACTGGATGTAATTGTCTTAAATA]
[-] EMBL CD091116 [ GTTAACAGAAGCTAATAATATCGTGCTTATTCAATAGGTTACTGAAAATATATCGTTTTTAGCTAGAGCTAACGAATAAATTCCTTTAGGTAGAGCTAGTTAGAGAAACATTGAATGACAATAGGTATATTATAGGGATCAACCTGATCTATCGTTCGG TCATTGAAAAAACCTAGCTTTATGTGGTTAATTACAAGAATCACATAAATAGATCTTATTTAATCTGTCACTTTCGACACATCCTATTTGCATAAATAAACATTTGTTTGAAACTTTCTTAACATATACTGGCTTAATATCAAGTCATAAACTGGATGTAATTGTCTTAAGTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||