|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10050#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 1350 fasta sequence
[CGACAAAGTCCATCTTTAACAGCTAATCGTATCATACAGGGGTTTCCGTCTACTTTGCCGTCGAATAGCACTGAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCATCCAGGTTGGACAGGGAA-CTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCC-TTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG-TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA-TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC-AGA-ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC-AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT-TTAACTGTAATATCCACTA-CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA-TATACTTTTACATTTTAAAAAAGTTCATCTATAATTATGGTAATGATATATGAAACTTGCACGCTTACTACACCTTCAAAATCAATAATAGTTTGACTAAGTATAA]
[-] EMBL CD183263 [CGACAAAGTCCATCTTTAACAGCTAATCGTATCATACAGGGGTTTCCGTCTACTTTGCCGTCGAATAGCACTGAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCAGATCtc ]
[-] EMBL CD183252 [CGACAAAGTCCATCTTTAACAGCTAATCGTATCATACAGGGGTTTCCGTCTACTTTGCCGTCGAATAGCACTGAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCct ]
[+] EMBL CD185635 [ GAAGATGAACTACTGCCCTTATTTCCATTTGATGTGGAAAATCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCATCCAGGTTGGACAGGGAACCTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCCTTTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGT ]
[+] EMBL CD201464 [ TCTAGACTTTGCTGATATATTAACAAATTTAGACCATATGCCAACCAGGACAGGTGATACGCTTTTGGTTTTTTATGTTGCTGCTGGTCAGTCAAAAGTTGGTGATATTCTTGCGAATATGAAAATTTGGCCAAGGCTGCCTGAAGCATTTCATCAGTTCTTAAGTGGTATCGGCTGTATCAAAAATATTTCTGATCATCCAGGTTGGACAGGGAACCTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCCTTTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAGAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTATTGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCA ]
[+] EMBL CD156018 [ TGGACAGGGAACCTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCCTTTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAGATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAG ]
[-] EMBL CD161111 [ ACAGGGAA CTTCAAACCAGTTATCGTACATCAAATGGACCC TTGTAACGAGTCACTGTAATCAGACGAAAAATATACATGCTGACCACTGTCCAGATGGTATTCAATCAATTATATATTATGCTGATGCAATAACAGAATTAGCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGGAAACGAAGAGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC AGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCC ]
[+] EMBL CD082313 [ agacatCATGCATTTGTCCCACTAATCAATTTTATGTTAACGAAGAGAATCCTGCTCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC AGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTTNTAAACTGT ATATCCACTA CTGGTGTGAACAAGGATTNCTTCACACTTACATATCANACAGAATGTTNTTTTTCTTTTTATTTTCATAGNTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAANTATACT ]
[+] EMBL SMAA18454 [ AGAATCCTGATCAAAATTGTATATTAAAGAGTACACG TTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGTGGGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACtt ]
[-] EMBL BF936972 [ ATATTAAAGAGTACACGTTTATCGCACTGCTAGCGAAATCATAACTAACATCACTCGT GGACAAGTCAACGTGTAGTAGGTA TGGGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCCAAGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTC TTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTTTT ]
[-] EMBL CD075915 [ CGTGTAGTAGGTA T GGGGAAGTTGGGGCGGACCCGACTGGAGGTCGAGTGGCAGTTGTATGGCTCGAACGATGGGAAGATGGACCTATGCACTGTGAATCAGGAGTTGGAATGAACATCC AGANATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTT ]
[-] EMBL CD061767 [ ATGAACATCC AGA ATATGACTAGCAAGAATTTTGATTGCCCTGTCACAATTTATATTCATCCTTTAAGTTCCGGATTATGTAGAGTTGGCATCATGCGTCTTCAAGGAAGAACATTTGAAGCTGGTCCATTACAGAATGGATCTGTATTAAGTCAGCGTTGTCTTAGTAGTTTTGTAAGACAAACTGTTATAAACTTATCACGACGACGTCGTTTGGCTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGGCAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATAT CACTACCTGTT ]
[-] EMBL AI395296 [ CGTCGTTTGCTTTCCGACTCATTTCAACCTCCTCATGTTCGACGAAGCCATGAATTATTCAGATTGGCAGAAGC AAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTTTTACATTTTAAAAAA ]
[-] EMBL AI395128 [ AAGCCATGAATT TTCAGATTGGCAG AGCAAAACCGTAAAATTGTTCGGGCTCAGCCATCATCATCTGGCAATAAAACTAGTACATACTCTTGTAACACAGCGAATATTGTGCGTAGTCTTTTTTTTTAGACAACCTCAAATTCATTCTAGCTAAAGCTTTTCATGTT TTAACTGTAATATCCACTA CTGTTGTGAACAAGGATTCCTTCACACTTACATATCAAACAGAATGTTTTTTTTCTTTTTATTTTCATAGTTTCTAATCTTACGTATTTAACACGTACCTAAA TATACTTTTACATTTTAATTCTGTTCATCTATAATTATGGTAATGATATATGAAACTTGCACGCTTACTACACCTTCAAAATCAATAATAGTTTGACTAAGTATAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||