cluster # 10058

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Schistosoma mansoni
cluster # 10058 cluster # 10058 Sequences # 13 consensus # 2

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consensus_10058#0 length = 909 sequences # 10

consensus_10058#1 length = 668 sequences # 3

consensusID : consensus_10058#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 909
fasta sequence

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[-] EMBL CD166372             [AGTAGTAGTAACGGCGGTGATTGAATTGTTACTGTTGGCAAAAACCATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGATTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTTATTAATTCTATCTGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATATTTAATTCGACGAACTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD202341             [                                              ATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGATTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTTATTAATTCTATCTGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATATTTAATTCGACGAACTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAAAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTTTTACGACATTTCGATGCTAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTGAAATGAT AACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCAC AAGTTTCATCAGCTGATTTTGAGACAGAT                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD153096             [                                                                                                                                                                                        GGAAATATTTAATTCGACGANCTNTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTTTTACGACATTTCGATGCTAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTG AATGATAAACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAAGTTTCATCAGCTGATTTTGAGACAGATC                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD153014             [                                                                                                                                                                                         GAAATATTTAATTCGACGANCTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATCTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTTTTACGACATTTCGATGCTAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTG AATGATAAACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAAGTTTCATCAGCTGATTTTGAGACAGATC                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD153294             [                                                                                                                                                                                                          GAACTNTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTTTTACGACATTTCGATGCTAAATCCGTTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTG AATGATAAACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAAGTTTCATCAGCTGATTTTGAGACAGATC                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD153394             [                                                                                                                                                                                                                  AAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTTTTACGACATTTCGATGCTAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTG AATGATAAACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAAGTTTGATCAGCTGATTTTGAGACAGATCTTAGAAA                                                                                                                                                          ]
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[-] EMBL CD114735             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAAATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAGAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATGGGCATTAGTTTTACGACATTTCGATGCTAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTG AATGATAAACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATT                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD144394             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATTTGCATTAGTTTANCGACATTTCGATGCTAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTNTTATAGCTG AATGATAAACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAAGTTTCATCAGCTGATTTTGAGACAGATCTTAGAAAATCAACAGCCTTTTCTTTTCTTGTCTTATTTCGTACGTTTAATTCTTCTTCGAATTCCAGAAATACACGAAAACCATGATCATGCTTAAATGTTG                                                           ]
[-] EMBL CD181320             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtnnGCATCTTTTATAGCTG AATGATAAACAGCTAAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAAGTTTCATCAGCTGATTTTGAGACAGATCTTAGAAAATCAACAGCCTTTTCTTTTCTTGTCTTATTTCGTACGTTTAATTCTTCTTCGAATTCCAGAAATACACGAAAACCATGATCATGCTTAAATGTTGGATGTGATGCTAGTCGTTGTAAAAACACTTCATGCATTGCAACTGTTTTCTTAAAAGTA]




>consensus_10058#0
AGTAGTAGTAACGGCGGTGATTGAATTGTTACTGTTGGCAAAAACCATCGGTTTCATGGT
AATCGTAGATGATTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTT
ATTAATTCTATCTGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTT
TTATGGAAATATTTAATTCGACGAACTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCT
GAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCT
TTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCA
CGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAAT
GTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTT
TCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTT
GGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTTTTACGA
CATTTCGATGCTAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTGAATGATAAACAGCT
AAGGTACATTTCTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAA
GTTTCATCAGCTGATTTTGAGACAGATCTTAGAAAATCAACAGCCTTTTCTTTTCTTGTC
TTATTTCGTACGTTTAATTCTTCTTCGAATTCCAGAAATACACGAAAACCATGATCATGC
TTAAATGTTGGATGTGATGCTAGTCGTTGTAAAAACACTTCATGCATTGCAACTGTTTTC
TTAAAAGTA

consensusID : consensus_10058#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 668
fasta sequence

                              [AAATGGNATGTTATTNTTCGGTGAATTGGAATGGGCAATATTACTCGTAGTAGTAGTAACGNCGGTGATTGAATTGTTACTGTTGGCAAAAACCATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGATTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTT-ATTAATTCTATCTGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATATTTAATTCGACGAAC-TTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTCCTCGTGCCGAATTNTTGGCTCGAGGG]

[-] EMBL CD082700             [AAATGGNATGTTATTNTTCGGTGAATTGGAATGGGCAATATTACTCGTAGTAGTAGTAACGNCGGTGATTGAATTGTTACTGTTGGCAAAAACCATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGATTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTT ATTAATTCTATCTGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATATTTAATTCGACGAAC TTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTAGATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTCCTCGTGCCGAATTNTTGGCTCGAGGG]
[+] EMBL CD153477             [                                                                                              ATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGATTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTT ATTAATTCTATCTGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATATTTAATTCGACGAAC TTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATCACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAATTTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTGGATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTT                                                                                ]
[-] EMBL BE505123             [                                                                                                                                                          TTAATGAAGATTTTAATNAATTCTATCTGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCNGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATATTTAATTCGACGAACTTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTGAAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCACGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGATAGAG                                                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_10058#1
AAATGGNATGTTATTNTTCGGTGAATTGGAATGGGCAATATTACTCGTAGTAGTAGTAAC
GNCGGTGATTGAATTGTTACTGTTGGCAAAAACCATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGA
TTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTTATTAATTCTATC
TGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATAT
TTAATTCGACGAACTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTG
AAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCA
CGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGA
TAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAAT
TTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTG
GATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTA
GATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTCCTCGTGCCGAATTNTTGG
CTCGAGGG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10058#0      ------------------------------------------------AGTAGTAGTAAC 12
consensus_10058#1      AAATGGNATGTTATTNTTCGGTGAATTGGAATGGGCAATATTACTCGTAGTAGTAGTAAC 60
                                                                       ************

consensus_10058#0      GGCGGTGATTGAATTGTTACTGTTGGCAAAAACCATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGA 72
consensus_10058#1      GNCGGTGATTGAATTGTTACTGTTGGCAAAAACCATCGGTTTCATGGTAATCGTAGATGA 120
                       * **********************************************************

consensus_10058#0      TTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTTATTAATTCTATC 132
consensus_10058#1      TTTTATACAGGTATATTGATTAGTTTTAATCGTGTTAATGAAGATTTTATTAATTCTATC 180
                       ************************************************************

consensus_10058#0      TGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATAT 192
consensus_10058#1      TGGGACTTAGCATGTTTAACTTCTAATTCAGCGAGATCAACTAAATTTTTATGGAAATAT 240
                       ************************************************************

consensus_10058#0      TTAATTCGACGAACTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTG 252
consensus_10058#1      TTAATTCGACGAACTTTGAAATCTTCTAATTCAAGTTTAGCTGATTCTGAAATAGACTTG 300
                       ************************************************************

consensus_10058#0      AAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCA 312
consensus_10058#1      AAACGTTCATTAGCTGCAGTTTGTGCATCTTCCGCTGTTTGAACATCTTTCATACGTGCA 360
                       ************************************************************

consensus_10058#0      CGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGA 372
consensus_10058#1      CGGGCTTTATCGAGATTACGATTAGCAGTTTCATAATCTGCTAATGCACGACATCGACGA 420
                       ************************************************************

consensus_10058#0      TAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAAT 432
consensus_10058#1      TAGAGTAGGTCACGTGCGGCTCCAGTATCAATGGCATAGTAACGAAATGTATCAGATAAT 480
                       ************************************************************

consensus_10058#0      TTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTG 492
consensus_10058#1      TTTAAATCTTCATCCGAACTCAAACGAACTAGAATTTTTCGAAAGCTTTCAAAGAAGTTG 540
                       ************************************************************

consensus_10058#0      GATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTA 552
consensus_10058#1      GATAACAGAGTTGTCAAATCAGTTTCAGAAGTGATATTGCATTCTTTTGGAATTAGATTA 600
                       ************************************************************

consensus_10058#0      GATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTTTTACGACATTTCGA-TGC 611
consensus_10058#1      GATAGAGCCAATTCAATTTGTAATAAAGTATTTGCATTAGTCCT----CGTGCCGAATTN 656
                       *****************************************  *    * *  *** *  

consensus_10058#0      TAAATCCGCTGCTACCGTTGCATCTTTTATAGCTGAATGATAAACAGCTAAGGTACATTT 671
consensus_10058#1      TTGGCTCGAGGG------------------------------------------------ 668
                       *     **  *                                                 

consensus_10058#0      CTCTTCACAAAAGAAAGTATCATTATCGCGTTGATTATTTAACCACAAAGTTTCATCAGC 731
consensus_10058#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10058#0      TGATTTTGAGACAGATCTTAGAAAATCAACAGCCTTTTCTTTTCTTGTCTTATTTCGTAC 791
consensus_10058#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10058#0      GTTTAATTCTTCTTCGAATTCCAGAAATACACGAAAACCATGATCATGCTTAAATGTTGG 851
consensus_10058#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10058#0      ATGTGATGCTAGTCGTTGTAAAAACACTTCATGCATTGCAACTGTTTTCTTAAAAGTA 909
consensus_10058#1      ----------------------------------------------------------