cluster # 10065

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Schistosoma mansoni
cluster # 10065 cluster # 10065 Sequences # 13 consensus # 2

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consensus_10065#0 length = 835 sequences # 12

consensus_10065#1 length = 499 sequences # 1

consensusID : consensus_10065#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 835
fasta sequence

                              [CGGGGTGGGGCTACACGAACTTATCAAAATTTGGATATTAGCGTATATGAAGCTTTGGATTATCGACGTGGAAAATTTCAAG-GTGTTGCAACATGTCAGTTAGATGATACATTGGAAGTGATTGTGAATAGAATTGTTGACGCTGGTGTACATCGTTTAGTAGTTGTCAATGATAATAAAGTATTAGGTATTGTTTCATTATCGGATATTCTACGTTTTTTAATTGCTGAACCAACTGTACAAAAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTGTTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAAAAAAGTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTTTGGTTCCTTGATGTTGGCTTA-TTTTTTTGAAGGGACAAACCCTATCATCTCAACATATATATTATGTNTGTACACATATGAGTTACTGATGTTTATGCATTTGTAATG-AGGATGTGTATGCATGTTGTGTAAGTGTTTTTTTTTTAGCATGCACAACCTCTTTGATTACTTTTGTTTTCTCTCCTGGTTTCAACCTATACTTCCTCNATTTCAATTGCGGCAAATTTGTTTTCATTCATTGTAAATTATCCGTAACTCA]

[-] EMBL CD200583             [CGGGGTGGGGCTACACGAACTTATCAAAATTTGGATATTAGCGTATATGAAGCTTTGGATTATCGACGTGGAAAATTTCAAGTGTGTTGCAACATGTCAGTTAGATGATACATTGGAAGTGATTGTGAATAGAATTGTTGACGCTGGTGTACATCGTTTAGTAGTTGTCAATGATAATAAAGTATTAGGTATTGTTTCATTATCGGATATTCTACGTTTTTTAATTGCTGAACCAACTGTACAAAAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATCCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTGTTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD200773             [                                                                               AAG GTGTTGCAACATGTCAGTTAAATGATACATTGGAAGTGATTGTGAATAGAATTGTTGACGCTGGTGTACATCGTTTAGTAGTGGTCAATGATAATAAAGTATTAGGTATTGTTTCATTATCGGATATTCTACGTTTTTTAATTGCTGAACCAACTGTACAAAAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATGGCTTTGGACTAAGATCTTCTTATTCACTGCTTACAATGGACACTCACAATGTAGAATAGTGGCGCCCATCTCATAATCCTTTTTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AA559442             [                                                                                AG GTGTTGCAACATGTCAGTTAGATGATACATTGGAAGTGATTGTGAATAGAATTGTTGACGCTGGTGTACATCGTTTAGTAGTTGTCAATGATAATAAAGTATTAGGTATTGTTTCATTATCGGATATNCTACGTTTTTTAATTGCTGAACCAACTGTACAAAAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTNCTNCTTATTCACTTCTTACAATGTANACNCACAATGTANAATAGTGTTGTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD145482             [                                                                                                                            GTGAATAGAATTGTTGACGCTGGTGTACATCGTTTAGTAGTTGTCAATGATAATAAAGTATTAGGTATTGTTTCATTATCGGATATTCTACGTTTTTTAATTGCTGAACCAACTGTACAAAAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTGTTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD134918             [                                                                                                                                                                                                                                                    AAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTGTTGTTCATTTTATAATCTTTTTTTGTTTNTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAGAAGAGTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTT                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD144482             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAGTTGGATTTCATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTGTTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCTATCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTNATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI111009             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTGTTGTNCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTTTNGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATANAANAGTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTTTGGTTCCTTGATGTTGGCTCATTTTTTTTGAAG                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI110919             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTANACTCNCAATGTANAATAGTGTTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCANCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATG TCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCACCGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAAAAAANTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCNAATTATCTTTGGTTCCTTGATGTTGGCTTA TTTTTTTGAAGGGACAAACCCTATCATCNCAACATATATATTATGTNTGTACACATATGAGTTACTGATGTTTATGCATTTGTAATG AGGATGTGTATGCATGTTGTGT                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI111166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAAACTCACAATGTAAAATAGTGTTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAGAAAAGTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTTTGGTTCCTTGATGTTGGCTTA TTTTTTTGAAGGGACAAACCCTATCATCTCAACATATATATTATGTNTGTACACATATGAGTTACTGATGTTTATGCATTTGTAATGAAGAANGTGTATGCATGTTGTG                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI111134             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTNCTTATTCACTNCTTACAATGTAAACNCACAATGTANAATAGTGTTGTNCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACGTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATG TCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTTTNGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAAAAAAGTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTTTGGTNCCTTGATGTTGGCTTA TTTTTTNGAAGGGACAAACCCTATCATCTCAACATATATATTATGTATGTACACATATGAGTTACTGATGTTTATGCATTTGTAATG AGGATGTGTATGCATGTTGTGTAAGTGTTTTTTTTTTAGCATGCACAACCTCTT                                                                                                 ]
[+] EMBL AI111112             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTCATAATTGTTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAAACTCACAATGTAAAATAGTGTTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACNTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTTTNGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAAAAAAGTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTTTGGTTCCTTGATGTTGGCTTA TTTTTTTGAAGGGACAAACCCTATCATCTCAACATATATATTATGTATGTACACATATGAGTTACTGATGTTTATGCATTTGTAATG AGGATGTGTATGCATGTTGTGTAAGTGTTTTTTTTTTAGCATGCACAACCTCTTTGATTACTTTTGTTTTCTCTCCTGGTTTCAACCTATACTTCCTCNATTTCAATTGCGGCAAATTTGTTTTCATTCATTGTAAATTATCCGTAACTCA]
[+] EMBL AI111117             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATCTTNTTTTGTTACTATGTNAAACCCANCCCCCCCCCACACACACCTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCANCGGTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTNCAAATCTAATCAGTAAATAAAAAAGTANTTGTCTAATGGGTNAATNAACCGAATTATCTTTGGTNCCTTGATGTGGGCTTA TTTTTNNGAAGGGACAAACCCNATCANCTCAACATA                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_10065#0
CGGGGTGGGGCTACACGAACTTATCAAAATTTGGATATTAGCGTATATGAAGCTTTGGAT
TATCGACGTGGAAAATTTCAAGGTGTTGCAACATGTCAGTTAGATGATACATTGGAAGTG
ATTGTGAATAGAATTGTTGACGCTGGTGTACATCGTTTAGTAGTTGTCAATGATAATAAA
GTATTAGGTATTGTTTCATTATCGGATATTCTACGTTTTTTAATTGCTGAACCAACTGTA
CAAAAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATTGTT
TTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTGTT
GTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACACGT
CTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGGTT
TTGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAAAAAA
GTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTTTGGTTCCTTGATGTTGGCTTATTT
TTTTGAAGGGACAAACCCTATCATCTCAACATATATATTATGTNTGTACACATATGAGTT
ACTGATGTTTATGCATTTGTAATGAGGATGTGTATGCATGTTGTGTAAGTGTTTTTTTTT
TAGCATGCACAACCTCTTTGATTACTTTTGTTTTCTCTCCTGGTTTCAACCTATACTTCC
TCNATTTCAATTGCGGCAAATTTGTTTTCATTCATTGTAAATTATCCGTAACTCA

consensusID : consensus_10065#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 499
fasta sequence

                              [TTCTATTCACAATCACTTCCAATGTATCATCTAACTGACATGTTGCAACACCTTGAAATTTCTACATAAAAATGATAAGAAAAATAAGGAATTAGTTTTTTTATGAAAAGGGAAACTATAAATTAAAACAAGGACTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGTTGAAACCAACCTCAAAGTGTGTGTACACGCGTGATAAGACTTAGTGGAAACAATTGAATTCTTTTAATTTTACAAATGTGAAGAAGCTTGAGAAAACCTGCAAGTTGAACTGTGTGACACCGGTTCAGCACCATTGCCTACTTTGATGCGCGATGGTGGGTCGTGGGAGTGTAACTTGTAAGAAATTTAGAGGAGGGTCAAATTAAAATTTGTGAGGTGAAGATCATGTAGTTGGGCTTCATGAAGTGATCGTGATCAACAGTTGGAAATCTTAAGTGATCTAGATCAAAGTCGACTGAAGTGGCCAATCAGAAATAATAAACGCTGCCTGCTTGAATATCTG]

[+] EMBL CD084971             [TTCTATTCACAATCACTTCCAATGTATCATCTAACTGACATGTTGCAACACCTTGAAATTTCTACATAAAAATGATAAGAAAAATAAGGAATTAGTTTTTTTATGAAAAGGGAAACTATAAATTAAAACAAGGACTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGTTGAAACCAACCTCAAAGTGTGTGTACACGCGTGATAAGACTTAGTGGAAACAATTGAATTCTTTTAATTTTACAAATGTGAAGAAGCTTGAGAAAACCTGCAAGTTGAACTGTGTGACACCGGTTCAGCACCATTGCCTACTTTGATGCGCGATGGTGGGTCGTGGGAGTGTAACTTGTAAGAAATTTAGAGGAGGGTCAAATTAAAATTTGTGAGGTGAAGATCATGTAGTTGGGCTTCATGAAGTGATCGTGATCAACAGTTGGAAATCTTAAGTGATCTAGATCAAAGTCGACTGAAGTGGCCAATCAGAAATAATAAACGCTGCCTGCTTGAATATCTG]




>consensus_10065#1
TTCTATTCACAATCACTTCCAATGTATCATCTAACTGACATGTTGCAACACCTTGAAATT
TCTACATAAAAATGATAAGAAAAATAAGGAATTAGTTTTTTTATGAAAAGGGAAACTATA
AATTAAAACAAGGACTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGTTGAAACCAACCTCAAAGTGTGTGT
ACACGCGTGATAAGACTTAGTGGAAACAATTGAATTCTTTTAATTTTACAAATGTGAAGA
AGCTTGAGAAAACCTGCAAGTTGAACTGTGTGACACCGGTTCAGCACCATTGCCTACTTT
GATGCGCGATGGTGGGTCGTGGGAGTGTAACTTGTAAGAAATTTAGAGGAGGGTCAAATT
AAAATTTGTGAGGTGAAGATCATGTAGTTGGGCTTCATGAAGTGATCGTGATCAACAGTT
GGAAATCTTAAGTGATCTAGATCAAAGTCGACTGAAGTGGCCAATCAGAAATAATAAACG
CTGCCTGCTTGAATATCTG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10065#0      CGGGGTGGGGCTACACGAACTTATCAAAATTTGGATATTAGCGTATATGAAGCTTTGGAT 60
consensus_10065#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10065#0      TATCGACGTGGAAAATTTCAAGGTGTTGCAACATGTCAGTTAGATGATACATTGGAAGTG 120
consensus_10065#1      ----------------------------------TTCTATTCACAATCACTTCCAATGTA 26
                                                          **  **       ** *   * ** 

consensus_10065#0      ATTGTGAATAGAATTGTTGACGCTGGTGTACATCGTTTAGTAGT--TGTCAATGATAATA 178
consensus_10065#1      TCATCTAACTGACATGTTGCAACACCTTGAAATTTCTACATAAAAATGATAAGAAAAATA 86
                             **  **  *****   *   *  * **   *   **    **  **  * ****

consensus_10065#0      AAGTATTAGGTATTGTTTCATTATCGGATATTCTACGTTTTTTAATTGCTGAACCAACTG 238
consensus_10065#1      AGGAATTAG---TTTTTTTATGAAAAGGGAAACTATAAATTAAAACAA--GGACTGTGTG 141
                       * * *****   ** *** ** *   *  *  ***    **  **     * **    **

consensus_10065#0      TACAAAAGATCATTTCAAATTAATTAACGTTGGATTAAGTTGGATTTCATTTCATAATTG 298
consensus_10065#1      TGTGTGTGCTTGTGTTGAA---ACCAACCTCAAAGTGTGT--GTACACGCGTGATAA--- 193
                       *      * *  * *  **   *  *** *   * *  **  *    *   * ****   

consensus_10065#0      TTTTTGACTTAGTTCTTCTTATTCACTTCTTACAATGTAGACTCACAATGTAGAATAGTG 358
consensus_10065#1      -----GACTTAGTGGAAACAATTGAATTCTTTTAATTT----TACAAATGTGAAGAAGCT 244
                            ********       *** * *****  *** *    *   *****  *  **  

consensus_10065#0      TTGTTCATCTTATAATCTTTTTTTGTTTCTATGTGAAACCCATCCCCCCCCCACACACAC 418
consensus_10065#1      TGAGAAAACCTGCAAGTTGAA-------CTGTGTGACACCGGTTCAGCACCATTGCCTAC 297
                       *     * * *  **  *          ** ***** ***  * *  * **    *  **

consensus_10065#0      GTCTACATTTGCCAGTACAGCAACATGTTCCCCTTTTTGTCAATTTGTTTTGATCATCGG 478
consensus_10065#1      TTTGATGCGCGATGGTGGGTCGTGGGAGTGTAACTTGTAAGAA---ATTTAGAGGAG-GG 353
                        *  *     *   **    *       *     ** *   **    *** **  *  **

consensus_10065#0      TTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCAGTTTACATGTAATTTTCAAATCTAATCATTAAATAAAA 538
consensus_10065#1      TCAAATTAAAATTTGTGAGGTGAAGATCATGTAGTT----GGGCT--TCATGAAGTGATC 407
                       *    **    *****   *       ****** **       **  **** ** * *  

consensus_10065#0      AAGTAGTTGTCTAATGGGTTAATTAACCGAATTATCTTTGGTTCCTTGATGTTGGCTTAT 598
consensus_10065#1      --GTGATCAACAGTTGGAAATCTTAAGTGATCTAGATCAAAGTCGACTGAAGTGGCCAAT 465
                         **  *   *   ***     ****  **  **  *     **        ****  **

consensus_10065#0      TTTTTTGAAGGGACAAACCCTATCATCTCAACATATATATTATGTNTGTACACATATGAG 658
consensus_10065#1      CA----GAAATAATAAACGCTGCCTGCTTGA-ATATCTG--------------------- 499
                             ***   * **** **  *  **  * **** *                      

consensus_10065#0      TTACTGATGTTTATGCATTTGTAATGAGGATGTGTATGCATGTTGTGTAAGTGTTTTTTT 718
consensus_10065#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10065#0      TTTAGCATGCACAACCTCTTTGATTACTTTTGTTTTCTCTCCTGGTTTCAACCTATACTT 778
consensus_10065#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10065#0      CCTCNATTTCAATTGCGGCAAATTTGTTTTCATTCATTGTAAATTATCCGTAACTCA 835
consensus_10065#1      ---------------------------------------------------------