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consensusID : consensus_10073#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 807 fasta sequence
[AGAATTCGGCACGAGGTTTGTGACCTTTCCCGTTTGAAGGTCTAGTTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAGTTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTTTTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGTCTTTCACATGATTAATGACAAGGATTTTGATATTTATAATAACGCTAAAGGATTACCGTGTTAATAATAATGACGTTACCAATAATATAATCCTCTTCCATGTATAATTCAGCTTCCATAATATGCTTTATAAATTA-TT-TTGCATTCGTAATATATTTGAATTTATA]
[+] EMBL CD082023 [AGAATTCGGCACGAGGTTTGTGACCTTTCCCGTTTGAAGGTCTAGTTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAGTTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTTTTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGTCTTTCACATGATTAATGANCAGGATTNTGATATTTATAATAACGCTAAAGGATTACCGTGTTAATAATAATGACGTTACCAAT ATATAATCCTCTTNCATGTATAANTCAGCTTCCAT ATATGCTNTATAAAATA TT TTGCATTCGT ATATATTTGAAT ]
[-] EMBL CD073948 [ GATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTTTTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGTCTTTCACATGATTAATGACAAGGATTTTGATATTTATAATAACGCTAAAGGATTACCGTGTTAATAATAATGACGTTACCAATAATATAATCCTCTTCCATGTATAATTCAGCTTCCATAATATGCTTTATAAATTA TTGTTGCATTCGTAATATATATAAATTTATA]
[+] EMBL AI976442 [ TTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTATTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGGCTTTCACATGATTAATGACAAGGATTTTGAT ]
[-] EMBL CD075637 [ TGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTTTTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGTCTTTCACATGATTAATGACAAGGATTTTGATATTTATAATAACGCTAAAGGATTACCGTGTTAATAATAATGACGTTACCAATAATATAATCCTCTTCCATGTATAATTCAGCTTCCATAATATGCTTTATAAATTATTT TTGCATTCGTAATATATTTGAATTT ]
[-] EMBL CD076796 [ ATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTTTTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGTCTTTCACATGATTAATGACAAGGATTTTGATATTTATAATAACGCTAAAGGATTACCGTGTTAATAATAATGACGTTACCAATAATATAATCCTCTTCCATGTATAATTCAGCTTCCATAATATGCTTTATAAATTATTT TTGCATTCGTAATATATTTGAATTTATA]
consensusID : consensus_10073#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 788 fasta sequence
[GCCTTGTGACACGTTTGTGACCTTTCCCGTTTGAAGGTCTAGTTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAGTTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTG-CCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTTTTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGTCTTTCACATGATTAATGANCAGGATTTTGATATTTATAATAACGCTAAAGGATTACCGTGTTAATAATATGACGTTACCAATATATAATCCTCTTCATGTATAATCAGCTTCATATATGCTTATAAATATTNTGCATCGTATATATTGATT]
[+] EMBL CD079689 [GCCTTGTGACACGTTTGTGACCTTTCCCGTTTGAAGGTCTAGTTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAGTTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTG CCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTTGTAAATGTACATCCCGATTTTTAATACCTCATCGTTCCATATTTGATTAAACTTGGTTACATAGTCTTTCACATGATTAATGANCAGGATTTTGATATTTATAATAACGCTAAAGGATTACCGTGTTAATAATATGACGTTACCAATATATAATCCTCTTCATGTATAATCAGCTTCATATATGCTTATAAATATTNTGCATCGTATATATTGATT]
[+] EMBL AW587527 [ CACGTTTGTGACCTTTCCCGTTTGAAGGTCTAGTTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAGTTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTTAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTTGTGTCCAAATTCCCTGGTTTTGTTA ]
consensusID : consensus_10073#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 574 fasta sequence
[CACGNAGCCAAGATTCGGCACGAGGCCCGTTTGAAGGTCTAGTTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAG-TTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAG--TATTTCGTTGCAAAACAA--TACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACANCCAACAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTNGT]
[+] EMBL CD083225 [CACGNAGCCAAGATTCGGCACGAGGCCCGTTTGAAGGTCTAGTTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAG TTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAG TATTTCGTTGCAAAACAA TACCACTGTATCACCACAATCAACAACAGCATGTACAACANCCAACAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAACTATACCAGCTCGTACACAAGTTGCTAAATAATCGTTNGT]
[+] EMBL CD153490 [ TTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAG TTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAG TATTTCGTTGCAAAACAA TACCACTGTATCA CAC ATC AC ACAGCg ]
[+] EMBL AI110998 [ TTTGGACCGTCCACTTTCCTTAAACCTCATTTATACTGCTACTAG TTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATNCTTCTACTAGGACTCAACAAAAANTGGCCTCNATTGATGCTGCTGATAAAATTNAAATTAAAAAAGANTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATNCCCTGGTTTGGTTAACAATGCNTCGTCTTTGCTACNTCNACGGCTAANTAAAAATNTGAAATATTT ]
[-] EMBL CD186352 [ TTAGACCTCATTTATACTGCTACTAG TTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACATGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACACGAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTATAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGAAGGGGGAAACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAG TATTTCGTTGC ]
[+] EMBL CD098222 [ TAAACCTCATTTATACTGCTACTAGCTTGTTGTAAATTGCGACATCACGGAATTTTATTCTTGTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATT ]
[+] EMBL CD097092 [ GTTTTACTTGAAGTTCCTATACTTCTACTAGGACTCAACAAAAAATGGCCTCGATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATACCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAAATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTTTCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATCTATTCTACGAAGTAAAAGNNTATTTCGTTGCAAAACAANNTACCgtgg ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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************************************************************
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************************************************************
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consensus_10073#1 GATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATA 235
consensus_10073#2 GATTGATGCTGCTGATAAAAGTGAAATTAAGAAAGAGTCGGAAAAGCTTCGTGCCAAATA 235
************************************************************
consensus_10073#0 CCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAA 298
consensus_10073#1 CCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAA 295
consensus_10073#2 CCCTGGTTTGGTTAACAATGCATCGTCATTGCTACATCGACGGCTAAGTAAAAATGTGAA 295
************************************************************
consensus_10073#0 ATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTT 358
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consensus_10073#2 ATATTTCGATTCTGGCGATTATAATATGGCTAAGTCGAGGCCACTAATGAAGGATTCCTT 355
************************************************************
consensus_10073#0 TCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATC 418
consensus_10073#1 TCCCTCAGGTAATTTGGATTCACCGACGGGGGATACTATTCCAACTGTGGATAATATATC 415
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************************************************************
consensus_10073#0 TATTCTACGAAGTAAAAGTATTTCGTTGCAAAACAATACCACTGTATCACCACAATCAAC 478
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consensus_10073#0 AACAGCATGTACAACACCAACAAGCACTTCAACTGCAACAACTACATGCAGTTATATAAC 538
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consensus_10073#2 ------------------------------------------------------------
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consensus_10073#2 -----------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||