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Schistosoma mansoni
cluster # 10080 cluster # 10080       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10080#0 length = 1213 sequences # 13  

consensusID : consensus_10080#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 1213
fasta sequence
                              [GAAGATAATGACATTCATTGAATACTTAATCTGTACAAATAAGATAAACTGTTTTTTATCGTTAACTGAACAAAAGACATAACCAAAT-AAACAAACACAATCAATCAAAACTGTACACAATATGAAACTAAACATAAACGTATACAAACTTTTTTGAAACCAACAGTAATGAGTAATAAGCTATGTCCGTATGTATATATATATTTGAGTTACAATTCTTGTGTTTATGCACATATGGGACAATAATGAAAATGACTATGTATTAAACGGTAACCCAAACTAGT----TGAATGAATAAATAAATAGAAAAACCATGCAATTGAATAAGTATACACATAGAATAATTAAGAGGAAATAAATAAACAATTGTACAAAATGTCGGACGGAGGGAGATAAGGGGTGGTCGATGGAAAACAAAAAAAACATGAATCCACAAAAATAAGCAAATCAATGTTTTAAAGTAAAATAAATAGATAGATAGATTTGTATATGTACATGTACCTTCTCCTTTTTCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTTTTTAATGCTTGAATAAATTGATGAAAAAATAATTTATCATTAGTAGTTGAAACACTATACTGTGGAGTGTTTAGTGCTTCGGAATAACAAATACGAAACAATAGAAAGTAAACAATCTTAGAAATGCAAACAAAAACGGCAGTGGGATAGATTTTGTATAGTAGTAAC-TAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGGTGTTGTAAAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAGAGTACGCTTAGTAATCGGTTGTGAGGCATTTGTTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGAGGAAGGTGTATTAGATACATCCTGAAGCCAACGAACTTGTGTTGCCGGTCCATATCCTTTTTCATTCCGAGCAGCAATCCGAAAGATCACAGCAGGTTTTGAACTAAGATCTAAATGAGCAGTAGCCAATGTTGCAGAAGTAACAGTTGCTGAAGGTGATTGACCACAATATACACGAACAAATGCCATGCCAGATGGTGTAGAACCGACCTTGCTCTCTGCAGAATCTTGTCCTGCAGTGTGAGATTTGACAGG]

[+] EMBL CD076017             [GAAGATAATGACATTCATTGAATACTTAATCTGTACAAATAAGATAAACTGTTTTTTATCGTTAACTGAACAAAAGACATAACCAAAT AAACAAACACAATCAATCAAAACTGTACACAATATGAAACTAAACATAAACGTATACAAACTTTTTTGAAACCAACAGTAATGAGTAATAAGCTATGTCCGTATGTATATATATATTTGAGTTACAATTCTTGTGTTTATGCACATATGGGACAATAATGAAAATGACTATGTATTAAACGGTAACCCAAACTAGT    TGAATGAATAAATAAATAGAAAAACCATGCAATTGAATAAGTATACACATAGAATAATTAAGAGGAAATAAATAAACAATTGTACAAAATGTCGGACGGAGGGAGATAAGGGGTGGTCGATGGAAAACAAAAAAAACATGAATCCACAAAAATAAGCAAATCAATGTTTTAAAGTAAAATAAATAGATAGATAGATTTGTATATGTACATGTACCTTCTCCTTTTTCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTTTTTAATGCTTGAATAAATTGATGAAAAAATAATTTATCATTAGTAGTTGAAACACTATACTGTGGAGTGTTTAGTGCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI976135             [GAAGATAATGACATTCATTGAATACTTAATCTGTACAAATAAAATAAACTGTTTTTTATCGTTAACTGACCAAAATACATAACCAAAT AAACAAACCCATTCTATCAAAACTGTACACAATATGAAACTAAACATAAACGTATACAAACTTTTTTGAAACCAACAGTAATGAGTTATAAGCTATGTCCGTATGTATATATATATTTGAGTTACAATTCTTGTGTTTATGCACATATGGGACAATAATGAAAATGACTATGTATTAAACGGTAA CCAAACTAGTTGAATGAATGAATAAATAAATAGAAAAACCATGCATTTGAATAAGTGTACACATAGAATAATTAAGAGGAAATAAATAAATAAacaatt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI026184             [GAAGATAATGACATTCATTGAATACTTAATCTGTACAAATAAGATAAACTGTTTTTTATCGTTAACTGAACAAAAGACATAACCAAATGAAACAAACACAATCAATCAAAACTGTACACAATACGAAACTAAACATAAACGTATACAAACTTTTTTGAAACCAACAGTAATGAGTAATAAGCTATGCCCAAATGaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD077139             [      AATGACATTCATTGAATACTTAATCTGTACAAATAAAATAAACTGTTTTTTATCGTTAACTGAACAAAAGACATAACCAAAT AAACAAACCCAATCAATCAAAACTGTCCCCAATATGAAACTAAACATAAACGTATACAAACTTTTTTGAAACCAACAGTAATGAGTAATAAGCTATGTCCGTATGTATATATATATTTGAGTTACAATTCTTGGGTTTATGCACATATGGGACAATAATGAAAATGACTATGTATTAAACGGTAACCCAAACTAGT    TGAATGAATAAATAAATAGAAAAACCATGCCATTGAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BG930794             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAAAATAAATAGATAGATAGATTTGTATATGTACATGTACCTTCTCCTTTTTCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTTTTTAATGCTTGAATAAATTGATGAAAAAATAATTTATCATCAGTAGTTGAAACACTATACTGTGGAGTGTTTAGTGCTTCGGAATAACAAATACGAAACAATAGAAAGTAAACAATCTTAGAAATGCAAACAAAAACGGCAGTGGGATAGATTTTGTATAGTAGTAAC TAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGac                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL SMAA98634            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTCCTTTTTCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTTTTTAATGCTTGAATAAATTGATGAAAAAATAATTTATCATTAGTAGTTGAAACACTATACTGTGGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL AA952757             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTCCTTTTTCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTTTTTAATGCTTGAATAAATTGATGAAAAAATAATTTATCATTAGTAGTTGAAACACTATACTGTGGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD154909             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tnAATGCTTGAATAAATTGATGAAAAAATAATTTATCATTAGTAGTTGAAACACTATACTGTGGAGTGTTTAGTGCTTCGGAATAACAAATACGAAACAATAGAAAGTAAACAATCTTAGAAATGCAAACAAAAACGGCAGTGGGATAGATTTTGTATAGTAGTAAC TAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGGTGTTGTAAAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAGAGTACGCTTAGTAATCGGTTGTGAGGCATTTGTTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGAGGAAGGTGTATTAGATACATCCTGAAGCCAACGAACTTGTGTT                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD090129             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAGTAAACAATCTTAGAAATGCAAACAAAAACGGCAGTGGGATAGATTTTGTATAGTAGTAAC TAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGGTGTTGTAAAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAGAGTACGCTTAGTAATCGGTTGTGAGGCATTTGTTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGAGGAAGGTGTATTAGATACATCCTGAAGCCAACGAACTTGTGTTGCCG                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD178095             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGAAATGCAAACAAAAACGGCAGTGGGATAGATTTTGTATAGTAGTAAC TAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACANACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGGTGTTGTAAAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAGAGTACGCTTAGTAATCGGTTGTGAGGCATTTGCTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGAGGAAGGTGTATTAGATACATCCTGAAGCCAACGAACTTGTGTTGCCGGTCCATATCCTTTTTCATTCCGAGCAGCAATCCGAAAGATCACAGCAGGTTTTGAACTAAGATCTAAATGAGCAGTAGCCAATGTTGCAGAAGTAACAGTTGCTGAAGGTGATTGACCACAATATACACGAACAAATGCCATGCCAGATGGTGTAGAACCGACCTTGCTCTCTGCAGAATCTTGTCCTGCAGTGTGAGATTTGACAGG]
[+] EMBL CD194271             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTATAGTAGTAACTTAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGGTGTTGTAGAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAGAGTACGCTTAGTAATCGGTTGTGAGGCATTTGTTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGAGGAAGGTGTATTAGATACATCCTGAAGCCAACGAACTTGTGTTGCCGGTCCATATCCTTTTTCATTCCGAGCAGCAATCCGAAAGATCACAGCAGGTTTTGAACTAAGATCTAAATGAGCAGTAGCCAACGTT                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD194378             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcGTATAGTAGTAACTTAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGGTGTTGTAAAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAGAGTACGCTTAGTAATCGGTTGTGAGGCATTTGTTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGAGGAAGGTGTATTAGATACATCCTGAAGCCAACGAACTTGTGTTGCCGGTCCATATCCTTTTTCATTCCGAGCAGCAATCCGAAAGATCACAGCAGGTTTTGAACTAAGATCTAAATGAGCAGTAGCCAATGTT                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD200478             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATAGTAGTAAC TAAAAAAACAACAACAACCATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGCTGGTCTTGAAGAAAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGACTGGTGTTGTAAAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAAAGTACGCTTAGTAATCGGTTGTGAGGCATTTGTTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGGGGAAGGTGTATTAGATACATCTTGAAGCCAACGAACTTGTGT                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_10080#0 GAAGATAATGACATTCATTGAATACTTAATCTGTACAAATAAGATAAACTGTTTTTTATC GTTAACTGAACAAAAGACATAACCAAATAAACAAACACAATCAATCAAAACTGTACACAA TATGAAACTAAACATAAACGTATACAAACTTTTTTGAAACCAACAGTAATGAGTAATAAG CTATGTCCGTATGTATATATATATTTGAGTTACAATTCTTGTGTTTATGCACATATGGGA CAATAATGAAAATGACTATGTATTAAACGGTAACCCAAACTAGTTGAATGAATAAATAAA TAGAAAAACCATGCAATTGAATAAGTATACACATAGAATAATTAAGAGGAAATAAATAAA CAATTGTACAAAATGTCGGACGGAGGGAGATAAGGGGTGGTCGATGGAAAACAAAAAAAA CATGAATCCACAAAAATAAGCAAATCAATGTTTTAAAGTAAAATAAATAGATAGATAGAT TTGTATATGTACATGTACCTTCTCCTTTTTCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTTTTTAATG CTTGAATAAATTGATGAAAAAATAATTTATCATTAGTAGTTGAAACACTATACTGTGGAG TGTTTAGTGCTTCGGAATAACAAATACGAAACAATAGAAAGTAAACAATCTTAGAAATGC AAACAAAAACGGCAGTGGGATAGATTTTGTATAGTAGTAACTAAAAAAACAACAACAACC ATACTTGCACACCAATTCCAAGAGATGAAAAAAGAAGGAATGTGCAGTTGATCTTGAAGA AAATCATGTTGATGAACAACAAACGCAGCTATAATTGATCATCTGATTTTAATCGCTTGA CTGGTGTTGTAAAAGCTCCTTCTTGTGATGACCCTAAACTTAGAGTACGCTTAGTAATCG GTTGTGAGGCATTTGTTGCTTGGAAATTGATGGATTGAGGGTTTATCCCAGCAACAGAGG AAGGTGTATTAGATACATCCTGAAGCCAACGAACTTGTGTTGCCGGTCCATATCCTTTTT CATTCCGAGCAGCAATCCGAAAGATCACAGCAGGTTTTGAACTAAGATCTAAATGAGCAG TAGCCAATGTTGCAGAAGTAACAGTTGCTGAAGGTGATTGACCACAATATACACGAACAA ATGCCATGCCAGATGGTGTAGAACCGACCTTGCTCTCTGCAGAATCTTGTCCTGCAGTGT GAGATTTGACAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)