These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10096#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 661 fasta sequence [GTCCTAAAGGTTATCCTGGCGAACAAGGACCACCAGGGCTAAGGGGTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGTTCAGTTACCACA-TGGAAC-AGGCCG-AAAGCTCTAATTGGACCTCCTGGCGATCGAGGTGATACAGGTCCTAAAGGCTATCCAGGTTCTAAAGAAAGCCGCTTTCG] [+] EMBL CD180957 [GTCCTAAAGGTTATCCTGGCGAACAAGGACCACCAGGGCTAAGGGGTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAc ] [+] EMBL CD180736 [ GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTANAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTA ] [+] EMBL CD181068 [ GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTANAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGAC ] [+] EMBL CD180637 [ GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGAC ] [+] EMBL CD180688 [ GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGT ] [-] EMBL CD180945 [ TATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTG ] [-] EMBL CD180972 [ TATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTG ] [+] EMBL CD180802 [ GTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTA ] [+] EMBL CD180953 [ GTGAACATGGTGAGAGTGGATAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACATGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATATATGGCGAACGTGGTGATCCTGGT ] [+] EMBL CD092856 [ GTGAACATGGNGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAG ] [+] EMBL CD182096 [ ATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGCGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGNTCAGTTACCACA TGGAAC AGGNCG AAAGCTCTATTTGGA ] [+] EMBL CD130711 [ ATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGTTCAGTTACCACATTGGAACAAGGCCGAAAAGCTCTAATTGGACCTCCTGGCGATCGAGGTGATACAGGTCCTAAAGGCTATCCAGGTTCTAAAGAAAGCCGCTTTCG] [+] EMBL CD182047 [ CTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGTTCAGTTACCACATTGGAACAAGGCCGAAAAGCTCTAATTGGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||