|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10102#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 1351 fasta sequence
[AGTTTGAATGTTCTGTGTTAGGTGCAGATGTAGAACCAATAGTTAAATTTCAAGATGGTAGACTTGTCGAATCAGATCCTAACTTTCGAGTCACTCGCATTGATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCCTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA-TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG-AAAATAGAA-CTA-CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT-CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC-AATT-CGAATGTTCAACATCGATC-CC-AGGTGTATCT-CC-C--AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCAC-AAATTTAAATGTATTGTATCCGTAAATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGTCCACCTGGGCAAGCAAAGTGTAGATCTGGTGAATGCTTGCCAAGAGCAGTATTTTGTGATGGTAAATATGATTGTTCAGATAGATCAGATGAAGATCCAAGATCTTGTGTTTCTACAATTATTATTACTCCGTCAACAATTTTAACAAAACCACATGAATCCTTCCAATTTGAATGTAAATCAGTTATGCCAGGTGGTGAACCACAAATTACACTTGAAGGTTCTCCAGTTGAAAATGATCCCAGATTTACAATTATACGCCCAAGCCGTGAACATGTTATTGTTCGAGCAGAAAGTGGTATTGCTGATCCTGGAAAATATTCTTTCACCTGTACTGTA]
[+] EMBL AF013964 [AGTTTGAATGTTCTGTGTTAGGTGCAGATGTAGAACCAATAGTTAAATTTCAAGATGGTAGACTTGTCGAATCAGATCCTAACTTTCGAGTCACTCGCATTGATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCCTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGGAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATTCCGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCCAAATT CGAATGTTCAACATCGATC CC AGTTGTATCT CC C AAGTAACT ]
[+] EMBL BE519993 [AGTTTGAATGTTCTGTGTTAGGTGCAGATGTAGAACCAATAGTTAAATTTCAAGATGGTAGACTTGTCGAATCAGATCCTAACTTTCGAGTCACTCGCATTGATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCCTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCYCACGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTT A TGTGG ATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGC ATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATCWCTTGTATC TCCCCGGATTAG AAAAWAGAA CTA CTGT ATAGAAATTGTAAGACCTYGTCYCAGTGGRVAGTTTC ATGTWTGGATGGACGATGTTTACCACTTAAWTTA ]
[+] EMBL CD115089 [ ATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCTTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGT ]
[-] EMBL SM1247339 [ GGAACATG CGGTCAGAAACTGA TTCTGTAAMGG CAAGTTGATTG CCTGATGG TCAGATGACCG CCCCCATATTGTAGCCGAATTATACAAGTGGYAATCAGCCCAAGCATTATTCATGNTCAKCCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTCCCTGGAATAAACCNAGAAGCCCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAATTGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCRRCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTACCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAWTTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATTCCGTGTGATCCCAAATCAACG GTCC AATTCCGATMGGTCAACATCGATCSCCGAGTTGMATCT CC CCGAAGTAACTTT ]
[-] EMBL BE519426 [ AACAT TCGTTCAG AACTGA TTCCGTAATGGTCAAG TGATTGTCCTGAT GTTCAGATGAGCGACCCCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCA TATTCATGTTCAACCATAT AACCTTTTGAATTTGAA GTA TTCTCATGTTCCTGG AT AAACCAGAAGCTCGA TATCTAGC GTATAC TG TAGTC AGATCCACGTTTT A TGT GAATATC TTCACCGAATCGTC TCGTG TAGTGCAATATAT GTTTGAC GATAGAGATCATCC TTCCAGA TCA TG ATCT CCT GA TAGNNAATTGGAACCTAWCTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGNCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC AATT CGAATGTTCAACATCGATC CC AGGTGTATCTCCC C AAGTAACTTT ]
[-] EMBL SM1247340 [ ATGGTCAACCATATAAACCRTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGKCCCTGGAAT AAACCAGAAGCMCGATTATCTATCGGTATACTTGTTAGTCAAGYTCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCCTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG GAAATAGAA CCA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCMTGTCCAAGTGGACAGTTGCAATGTATGGATGGACGATGTTGACCATGTAATGTATTTTGTGATGGAAAATC GATTGTTCAGATAGVTCAGATGAGAGTGAACGATACTGTGCTMTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTMTGAT CCAAATCAACGTT C A T CG ATGTTCAACATCGAT CC A GTGGA CT CC C AAGTAAC ]
[+] EMBL CD189921 [ AGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACAT ]
[+] EMBL CD189936 [ AGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACAT ]
[-] EMBL CD183626 [ GAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTCTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC AATT CGAATGTTCA ]
[-] EMBL CD189415 [ GAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATC ]
[+] EMBL CD150476 [ ATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC GATT CGAATGTTCAACATCGATC CC AGGTGTATCTCCC C AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCAC ANATTTAAATGTATTGTATCCGTANATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGT ]
[-] EMBL CD148668 [ ATCAACGTTTCC AATT CGAATGTTCANCATCGATC CC AGGTGTATCTCCC C AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCACAAAATTTAAATGTATTGTATCCGTAAATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGTCCACCTGGGCAAGCAAAGTGTAGATCTGGTGAATGCTTGCCAAGAGCAGTATTTTGTGATGGTAAATATGATTGTTCAGATAGATCAGATGAAGATCCAAGATCTTGTGTTTCTACAATTATTATTACTCCGTCAACAATTTTAACAAAACCACATGAATCCTTCCAATTTGAATGTAAATCAGTTATGCCAGGTGGTGAACCACAAATTACACTTGAAGGTTCTCCAGTTGAAAATGATCCCAGATTTACAATTATACGCCCAAGCCGTGAACATGTTATTGTTCGAGCAGAAAGTGGTATTGCTGATCCTGGAAAATATTCTTTCACCTGTACTGTA]
[-] EMBL CD148709 [ ATCGATC CC AGGTGTATCT CCNC AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCACAAAATTTAAATGTATTGTATCCGTAAATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGTCCACCTGGGCAAGCAAAGTGTAGATCTGGTGAATGCTTGCCAAGAGCAGTATTTTGTGATGGTAAATATGATTGTTCAGATAGATCAGATGAAGATCCAAGATCTTGTGTTTCTACAATTATTATTACTCCGTCAACAATTTTAACAAAACCACATGAATCCTTCCAATTTGAATGTAAATCAGTTATGCCAGGTGGTGAACCACAAATTACACTTGAAGGTTCTCCAGTTGAAAATGATCCCAGATTTACAATTATACGCCCAAGCCGTGAACATGTTATTGTTCGAGCAGAAAGTGGTATTGCTGATCCTGGAAAATATTCTTTCACCTGTACTGTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||