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Schistosoma mansoni
cluster # 10102 cluster # 10102       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10102#0 length = 1351 sequences # 13  

consensusID : consensus_10102#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 1351
fasta sequence
                              [AGTTTGAATGTTCTGTGTTAGGTGCAGATGTAGAACCAATAGTTAAATTTCAAGATGGTAGACTTGTCGAATCAGATCCTAACTTTCGAGTCACTCGCATTGATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCCTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA-TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG-AAAATAGAA-CTA-CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT-CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC-AATT-CGAATGTTCAACATCGATC-CC-AGGTGTATCT-CC-C--AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCAC-AAATTTAAATGTATTGTATCCGTAAATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGTCCACCTGGGCAAGCAAAGTGTAGATCTGGTGAATGCTTGCCAAGAGCAGTATTTTGTGATGGTAAATATGATTGTTCAGATAGATCAGATGAAGATCCAAGATCTTGTGTTTCTACAATTATTATTACTCCGTCAACAATTTTAACAAAACCACATGAATCCTTCCAATTTGAATGTAAATCAGTTATGCCAGGTGGTGAACCACAAATTACACTTGAAGGTTCTCCAGTTGAAAATGATCCCAGATTTACAATTATACGCCCAAGCCGTGAACATGTTATTGTTCGAGCAGAAAGTGGTATTGCTGATCCTGGAAAATATTCTTTCACCTGTACTGTA]

[+] EMBL AF013964             [AGTTTGAATGTTCTGTGTTAGGTGCAGATGTAGAACCAATAGTTAAATTTCAAGATGGTAGACTTGTCGAATCAGATCCTAACTTTCGAGTCACTCGCATTGATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCCTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGGAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATTCCGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCCAAATT CGAATGTTCAACATCGATC CC AGTTGTATCT CC C  AAGTAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BE519993             [AGTTTGAATGTTCTGTGTTAGGTGCAGATGTAGAACCAATAGTTAAATTTCAAGATGGTAGACTTGTCGAATCAGATCCTAACTTTCGAGTCACTCGCATTGATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCCTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCYCACGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTT A TGTGG ATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGC ATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATCWCTTGTATC TCCCCGGATTAG AAAAWAGAA CTA CTGT ATAGAAATTGTAAGACCTYGTCYCAGTGGRVAGTTTC ATGTWTGGATGGACGATGTTTACCACTTAAWTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD115089             [                                                                                                      ATCCTAACACTGTTAGTGTTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCCCTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAATTCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATTGTCTTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL SM1247339            [                                                                                                                                                                                                                                                              GGAACATG CGGTCAGAAACTGA TTCTGTAAMGG CAAGTTGATTG CCTGATGG TCAGATGACCG CCCCCATATTGTAGCCGAATTATACAAGTGGYAATCAGCCCAAGCATTATTCATGNTCAKCCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGTCCCTGGAATAAACCNAGAAGCCCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAATTGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCRRCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTACCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAWTTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATTCCGTGTGATCCCAAATCAACG GTCC AATTCCGATMGGTCAACATCGATCSCCGAGTTGMATCT CC CCGAAGTAACTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BE519426             [                                                                                                                                                                                                                                                                AACAT TCGTTCAG AACTGA TTCCGTAATGGTCAAG TGATTGTCCTGAT GTTCAGATGAGCGACCCCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCAGACCAAGCA TATTCATGTTCAACCATAT AACCTTTTGAATTTGAA GTA TTCTCATGTTCCTGG AT AAACCAGAAGCTCGA TATCTAGC GTATAC TG TAGTC AGATCCACGTTTT A TGT GAATATC TTCACCGAATCGTC TCGTG TAGTGCAATATAT GTTTGAC GATAGAGATCATCC TTCCAGA TCA TG ATCT  CCT GA TAGNNAATTGGAACCTAWCTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGNCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC AATT CGAATGTTCAACATCGATC CC AGGTGTATCTCCC C  AAGTAACTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL SM1247340            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGGTCAACCATATAAACCRTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATGKCCCTGGAAT AAACCAGAAGCMCGATTATCTATCGGTATACTTGTTAGTCAAGYTCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCCTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG GAAATAGAA CCA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCMTGTCCAAGTGGACAGTTGCAATGTATGGATGGACGATGTTGACCATGTAATGTATTTTGTGATGGAAAATC GATTGTTCAGATAGVTCAGATGAGAGTGAACGATACTGTGCTMTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTMTGAT CCAAATCAACGTT  C A  T CG ATGTTCAACATCGAT  CC A GTGGA CT CC C  AAGTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD189921             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD189936             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD183626             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTCTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC AATT CGAATGTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD189415             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD150476             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCACGTTTTAA TGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGACGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAG AAAATAGAA CTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGATGTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAAGTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATT CGTGTGATCCCAAATCAACGTTTCC GATT CGAATGTTCAACATCGATC CC AGGTGTATCTCCC C  AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCAC ANATTTAAATGTATTGTATCCGTANATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD148668             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCAACGTTTCC AATT CGAATGTTCANCATCGATC CC AGGTGTATCTCCC C  AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCACAAAATTTAAATGTATTGTATCCGTAAATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGTCCACCTGGGCAAGCAAAGTGTAGATCTGGTGAATGCTTGCCAAGAGCAGTATTTTGTGATGGTAAATATGATTGTTCAGATAGATCAGATGAAGATCCAAGATCTTGTGTTTCTACAATTATTATTACTCCGTCAACAATTTTAACAAAACCACATGAATCCTTCCAATTTGAATGTAAATCAGTTATGCCAGGTGGTGAACCACAAATTACACTTGAAGGTTCTCCAGTTGAAAATGATCCCAGATTTACAATTATACGCCCAAGCCGTGAACATGTTATTGTTCGAGCAGAAAGTGGTATTGCTGATCCTGGAAAATATTCTTTCACCTGTACTGTA]
[-] EMBL CD148709             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCGATC CC AGGTGTATCT CCNC  AAGTAACTTTTGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAACTATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCACAAAATTTAAATGTATTGTATCCGTAAATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGTCCACCTGGGCAAGCAAAGTGTAGATCTGGTGAATGCTTGCCAAGAGCAGTATTTTGTGATGGTAAATATGATTGTTCAGATAGATCAGATGAAGATCCAAGATCTTGTGTTTCTACAATTATTATTACTCCGTCAACAATTTTAACAAAACCACATGAATCCTTCCAATTTGAATGTAAATCAGTTATGCCAGGTGGTGAACCACAAATTACACTTGAAGGTTCTCCAGTTGAAAATGATCCCAGATTTACAATTATACGCCCAAGCCGTGAACATGTTATTGTTCGAGCAGAAAGTGGTATTGCTGATCCTGGAAAATATTCTTTCACCTGTACTGTA]


>consensus_10102#0 AGTTTGAATGTTCTGTGTTAGGTGCAGATGTAGAACCAATAGTTAAATTTCAAGATGGTA GACTTGTCGAATCAGATCCTAACTTTCGAGTCACTCGCATTGATCCTAACACTGTTAGTG TTGAAGCGATTCATGGCTTAACGGAAAAAAAGGAGCGTTTTAGTTTCATATGTACATTCC CTGGTGGACCAGAAGAGGAGATAGACGTTTTCGTTCGACGACGATGTCCTCATGGTCAAT TCATGTGTAAAGATGGAACATGTCGTTCAGAAACTGATTTCTGTAATGGTCAAGTTGATT GTCCTGATGGTTCAGATGAGCGACCTCCATATTGTAGACAAATTATACAAGTGGAAATCA GACCAAGCATTATTCATGTTCAACCATATAAACCTTTTGAATTTGAATGTATTTCTCATG TTCCTGGAATAAAACCAGAAGCTCGATTATCTAGCGGTATACTTGTTAGTCAAGATCCAC GTTTTAATGTGGAATATCTTTCACCGAATCGTCTTCGTGTTAGTGCAATATATGGTTTGA CGGATAGAGATCATCCTTTCCAGATTCATTGTATCTTCCCTGGATTAGAAAATAGAACTA CTGTAATAGAAATTGAAAGACCTTGTCCAAGTGGACAGTTTCAATGTATGGATGGACGAT GTTTACCATTTAATTTATTTTGTGATGGAAAATCGGATTGTTCAGATAGTTCAGATGAAA GTGAACGATACTGTGCTGTAAACATCAGAGTGACACCAGGTTCGATTCGTGTGATCCCAA ATCAACGTTTCCAATTCGAATGTTCAACATCGATCCCAGGTGTATCTCCCAAGTAACTTT TGACGAGCGTTCGGTAGAAAGAGATAATCGTTTTGTTGTTACTCGTCCAAGTCTTCAAAC TATAGTGGTGACAGCACCAACTGGTATATCAGATATTGGAGCTCACAAATTTAAATGTAT TGTATCCGTAAATATTGTTAAAGAAGTTGATGTAGAAATCATAAGTGAATGTCCACCTGG GCAAGCAAAGTGTAGATCTGGTGAATGCTTGCCAAGAGCAGTATTTTGTGATGGTAAATA TGATTGTTCAGATAGATCAGATGAAGATCCAAGATCTTGTGTTTCTACAATTATTATTAC TCCGTCAACAATTTTAACAAAACCACATGAATCCTTCCAATTTGAATGTAAATCAGTTAT GCCAGGTGGTGAACCACAAATTACACTTGAAGGTTCTCCAGTTGAAAATGATCCCAGATT TACAATTATACGCCCAAGCCGTGAACATGTTATTGTTCGAGCAGAAAGTGGTATTGCTGA TCCTGGAAAATATTCTTTCACCTGTACTGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)