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Schistosoma mansoni
cluster # 10116 cluster # 10116       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10116#0 length = 991 sequences # 13  

consensusID : consensus_10116#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 991
fasta sequence
                              [TATTACTGGTCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAGTACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT-TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG-AGAC-CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAATAACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACCTATGCTTAGAAATTGACTTTTCTCTAGAAACCTGCACTTTTGTTTGATTGTCCCAGTAAGTTAAACGCAGCGTAGGATCTGGCACAAGCGTAAATTGGTCCAAGTTGCCATACTCCATTAGCACAGCGAAATAGCATTGTCAGGGCAAATCTCGCAGTAGCAGCAGTATTAGTGGCAGTAAGACTGAAGAAAATATAAATTATCGGAACGAAAATAATACTTATGGGGAATTTAGGATCTAAGGGAAGATAATGAATGTATCTGGGCTACTGTGAACGGTTCCAAGTTATATCATTCAAATT]

[+] EMBL CD078249             [ ATTACTGGTCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAGTACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCANAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD078329             [ ATTACTGGTCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAGTACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD162191             [ttctctttgcCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAGTACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGTCTAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAACGGCCTGCTTATTATGTTGTCTAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD162576             [                                                                                                    GAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGGCAGACACGATAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD072887             [                                                                                                                    TTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAATAACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD123572             [                                                                                                                                                                       CTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD123599             [                                                                                                                                                                       CTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGCTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD135840             [                                                                                                                                                                                                TATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTCGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAGGATCAAACTGTAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD162282             [                                                                                                                                                                                                                                         GGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGTCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGCGTTTACGGATCTCTATCTAGTGATATATTGCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD146758             [                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD201045             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCCTCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAATAACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACCTATGCTTAGAAATTGACTTTTCTCTAGAAACCTGCACTTTTGTTTGATTGTCCCAGTAAGTTAAACGCAGCGTAGGATCTGGCACAAGCGTAAAT                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL SMAA69189            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD114241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAATAACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACCTATGCTTAGAAATTGACTTTTCTCTAGAAACCTGCACTTTTGTTTGATTGTCCCAGTAAGTTAAACGCAGCGTAGGATCTGGCACAAGCGTAAATTGGTCCAAGTTGCCATACTCCATTAGCACAGCGAAATAGCATTGTCAGGGCAAATCTCGCAGTAGCAGCAGTATTAGTGGCAGTAAGACTGAAGAAAATATAAATTATCGGAACGAAAATAATACTTATGGGGAATTTAGGATCTAAGGGAAGATAATGAATGTATCTGGGCTACTGTGAACGGTTCCAAGTTATATCATTCAAATT]


>consensus_10116#0 TATTACTGGTCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAG TACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCA AGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGTTAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAG AGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGA AAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGGAGACCGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTC TGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATG GCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCC TAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAG TGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCT ATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTAC AAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAAT AACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACCTATGCTTAGAAATTGACTTTTCTCTAGAAAC CTGCACTTTTGTTTGATTGTCCCAGTAAGTTAAACGCAGCGTAGGATCTGGCACAAGCGT AAATTGGTCCAAGTTGCCATACTCCATTAGCACAGCGAAATAGCATTGTCAGGGCAAATC TCGCAGTAGCAGCAGTATTAGTGGCAGTAAGACTGAAGAAAATATAAATTATCGGAACGA AAATAATACTTATGGGGAATTTAGGATCTAAGGGAAGATAATGAATGTATCTGGGCTACT GTGAACGGTTCCAAGTTATATCATTCAAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)