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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10116#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 991 fasta sequence
[TATTACTGGTCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAGTACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT-TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG-AGAC-CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAATAACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACCTATGCTTAGAAATTGACTTTTCTCTAGAAACCTGCACTTTTGTTTGATTGTCCCAGTAAGTTAAACGCAGCGTAGGATCTGGCACAAGCGTAAATTGGTCCAAGTTGCCATACTCCATTAGCACAGCGAAATAGCATTGTCAGGGCAAATCTCGCAGTAGCAGCAGTATTAGTGGCAGTAAGACTGAAGAAAATATAAATTATCGGAACGAAAATAATACTTATGGGGAATTTAGGATCTAAGGGAAGATAATGAATGTATCTGGGCTACTGTGAACGGTTCCAAGTTATATCATTCAAATT]
[+] EMBL CD078249 [ ATTACTGGTCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAGTACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCANAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAA ]
[+] EMBL CD078329 [ ATTACTGGTCTACTCGGTGCTGTCTCGTGTGTTCGTTCATTAATATTTCGGTTTTTCAGTACAAGTCTGATCTTTGACTTGGACAATTCTGGACTAGATGAACCTCACTGAACTTTTCAAGTGGCTTTCCTTTTAATGGCTGT TAATTCCGTTATCCCATCAGAACTACGTCAATTAAGAGCCTGCTTATTATGTGGTCTAGTGAAAACTCTTAACCAATTTCAACTAAACGGATGCGAAAACTGTGAGGACTTTCTAAAGATGCAAGG AGAC CGAGAAAAGGTATACGAATGTTCTTCTGCCAACTTTGATGGTTTACTTGCTATGATGTCACCAAACGACAGTTGGGTCGCCAGATGGCAGATGATTGATAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTA ]
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[+] EMBL CD201045 [ TAAACTTACGCCAGGTGTTTATGCAATCAGTGTTTACGGATCTCTTCCTAGTGATATAGTGCACTATTTACGAAGCAAAGGGATTTCTTATCGATCATTAGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCCTCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAATAACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACCTATGCTTAGAAATTGACTTTTCTCTAGAAACCTGCACTTTTGTTTGATTGTCCCAGTAAGTTAAACGCAGCGTAGGATCTGGCACAAGCGTAAAT ]
[-] EMBL SMAA69189 [ AGACAAAAGTGGTAAATAGTGTCTTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGAT ]
[+] EMBL CD114241 [ TTCCTCTGCTACGTACATTCATCAACATGGACATTGAGTATTGTCTATTGAATTTCATCAGATAAAACCTTTGTATGAAATCAAGCTATTAGTTATCTTCATGTACAAAATCTCTTTTCTCGAAAAAAGTAAGATCAAACTGTAAAAATACACCATTCTCCTGAATAACTGCCGTATTTTATTAGTAATTAAACCTATGCTTAGAAATTGACTTTTCTCTAGAAACCTGCACTTTTGTTTGATTGTCCCAGTAAGTTAAACGCAGCGTAGGATCTGGCACAAGCGTAAATTGGTCCAAGTTGCCATACTCCATTAGCACAGCGAAATAGCATTGTCAGGGCAAATCTCGCAGTAGCAGCAGTATTAGTGGCAGTAAGACTGAAGAAAATATAAATTATCGGAACGAAAATAATACTTATGGGGAATTTAGGATCTAAGGGAAGATAATGAATGTATCTGGGCTACTGTGAACGGTTCCAAGTTATATCATTCAAATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||