cluster # 10120

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Schistosoma mansoni
cluster # 10120 cluster # 10120 Sequences # 13 consensus # 3

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consensusID : consensus_10120#0
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Sequences nbr = 10
consensus length = 944
fasta sequence

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[+] EMBL CD074818             [ACAAAAAGATCAATGAATTACAGCTGGGTTAGGAGCGAAGGTTTTCTTTTGTTTTAACTTATACAACTGCATTAAAATAAATGGTAATTGAATATTGATTTGAAATATTTTCTCCTGGTAGATCCGATATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATTTGTTGTCGTTGCTAAGAATGTATAGGTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGT AAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACACAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATCTATTGTTTGCACTATTTGTATTATTTACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTGAAATTTATGTACATTTTCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
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[+] EMBL CD132648             [                                                                                                                               TATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATTTGTTGTCGTTGCTAAGAATGTATAGGTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGT AAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACACAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAGACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATCTATTGTTTGCACTATTTGTATTATTTACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTGAAAATTATGTACATTTTCCAGTGAAGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
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[-] EMBL CD188055             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gCTCTTGAAATTTATGTACATTTTCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTGCCACCTTTAATTCTTCTTGTTCAACATATTTGAATCGTAAAGCCTCCAGTTCCAATCCTAATACATCACAAAATTTTGAAAGTGTAATTATGCCTGTCTTTTGAGGATCGAATAATTCTTGCCATCTCGCTATAAAAGCAGGATCCATATCATTTTTCACCATATATGTTTGTAATTCATCTATTGTGATAGTTTCTGAACGATCTTGATCTATGGCGAAAAACGCTTCTACAAATGCATCCATATTTATCATACGTTCTACAACGGACTaatcca                 ]




>consensus_10120#0
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ATACAACTGCATTAAAATAAATGGTAATTGAATATTGATTTGAAATATTTTCTCCTGGTA
GATCCGATATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATTTGTTGTCGTTGCTAAGAATGTATAG
GTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGTAAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACA
CAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCAT
GACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTA
CAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATTTAA
CTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTG
TCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTA
ATTCATTTGATAATCTATTGTTTGCACTATTTGTATTATTTACGTTATTATTCGTTTGAC
CGTTCTCTTGAAATTTATGTACATTTTCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTGCCACCTTTA
ATTCTTCTTGTTCAACATATTTGAATCGTAAAGCCTCCAGTTCCAATCCTAATACATCAC
AAAATTTTGAAAGTGTAATTATGCCTGTCTTTTGAGGATCGAATAATTCTTGCCATCTCG
CTATAAAAGCAGGATCCATATCATTTTTCACCATATATGTTTGTAATTCATCTATTGTGA
TAGTTTCTGAACGATCTTGATCTATGGCGAAAAACGCTTCTACAAATGCATCCATATTTA
TCATACGTTCTACAACGGACTGCCTCGTGCCGAAAATTGGCTNC

consensusID : consensus_10120#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 593
fasta sequence

                              [CGAAGGTTTTCTTTTGTTTTAACTTATACAACTGCATTAAAATAAATGGTAATTGAATATTGATTTGAAATATTTTCTCCTGGTAGATCCGATATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATTTGTTGTCGTTGCTAAGAATATATAGGTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGTAAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACACAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATCTATTGTTTGCACTATTTGTATTATTTACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTAAGACCCTCGTGCCAAAAT]

[-] EMBL CD079798             [CGAAGGTTTTCTTTTGTTTTAACTTATACAACTGCATTAAAATAAATGGTAATTGAATATTGATTTGAAATATTTTCTCCTGGTAGATCCGATATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATTTGTTGTCGTTGCTAAGAATATATAGGTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGTAAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACACAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATCTATTGTTTGCACTATTTGTATTATTTACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTAAGACCCTCGTGCCAAAAT]
[+] EMBL CD128122             [                                                                                                                                                         ATAGTTTCAATGATGATATGTAAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACACAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATT                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_10120#1
CGAAGGTTTTCTTTTGTTTTAACTTATACAACTGCATTAAAATAAATGGTAATTGAATAT
TGATTTGAAATATTTTCTCCTGGTAGATCCGATATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATT
TGTTGTCGTTGCTAAGAATATATAGGTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGTAAAAAC
GATTAGAAATACACAAGCAAACACACAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTA
AACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAA
TAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTG
TCCAAACGTAATTTGATCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCA
CCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATC
TCTTGATAATCAGTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATCTATTGTTTGCACTATTTGTA
TTATTTACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTAAGACCCTCGTGCCAAAAT

consensusID : consensus_10120#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 580
fasta sequence

                              [TTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACANAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTGAAATTTATGTACATTTTCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTGCCACCTTTAATTCTTCTTGTTCAACATATTTGAATCGTAAAGCCTCCAGTTCCAATCCTAATTATGCCTGTCTTTTGAGGATCGAATAATTCTTGCCATCTCGCTATAAAAGCAGGATCCATATCATTTTTCACCATATATGTTTGTAATTCATCTATTGTGATAGTTTCTGAACGATCTTGATCTATGGCGATTTATCATACGTTCTACAACGGACTAATCCACAATGGCAGTCAGGACTGT]

[-] EMBL CD080992             [TTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACANAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCATAAACCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTGAAATTTATGTACATTTTCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTGCCACCTTTAATTCTTCTTGTTCAACATATTTGAATCGTAAAGCCTCCAGTTCCAATCCTAATTATGCCTGTCTTTTGAGGATCGAATAATTCTTGCCATCTCGCTATAAAAGCAGGATCCATATCATTTTTCACCATATATGTTTGTAATTCATCTATTGTGATAGTTTCTGAACGATCTTGATCTATGGCGATTTATCATACGTTCTACAACGGACTAATCCACAATGGCAGTCAGGACTGT]




>consensus_10120#2
TTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCATGACGGAAACANAATGA
ATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTACAATTACACAATGCCA
TAAACCCATTTAACTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACT
ATGGCAAAGATTGTCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCA
GTTGACTTGATTAATTCATTTGATAATACGTTATTATTCGTTTGACCGTTCTCTTGAAAT
TTATGTACATTTTCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTGCCACCTTTAATTCTTCTTGTTCA
ACATATTTGAATCGTAAAGCCTCCAGTTCCAATCCTAATTATGCCTGTCTTTTGAGGATC
GAATAATTCTTGCCATCTCGCTATAAAAGCAGGATCCATATCATTTTTCACCATATATGT
TTGTAATTCATCTATTGTGATAGTTTCTGAACGATCTTGATCTATGGCGATTTATCATAC
GTTCTACAACGGACTAATCCACAATGGCAGTCAGGACTGT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10120#0      ACAAAAAGATCAATGAATTACAGCTGGGTTAGGAGCGAAGGTTTTCTTTTGTTTTAACTT 60
consensus_10120#1      -----------------------------------CGAAGGTTTTCTTTTGTTTTAACTT 25
consensus_10120#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10120#0      ATACAACTGCATTAAAATAAATGGTAATTGAATATTGATTTGAAATATTTTCTCCTGGTA 120
consensus_10120#1      ATACAACTGCATTAAAATAAATGGTAATTGAATATTGATTTGAAATATTTTCTCCTGGTA 85
consensus_10120#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10120#0      GATCCGATATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATTTGTTGTCGTTGCTAAGAATGTATAG 180
consensus_10120#1      GATCCGATATGTTTTATTCTATATCCTGTTCAATTTGTTGTCGTTGCTAAGAATATATAG 145
consensus_10120#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10120#0      GTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGTAAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACA 240
consensus_10120#1      GTGGTTAAATAGTTTCAATGATGATATGTAAAAACGATTAGAAATACACAAGCAAACACA 205
consensus_10120#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10120#0      CAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCAT 300
consensus_10120#1      CAAATAATAATTTTGTTTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCAT 265
consensus_10120#2      ----------------TTAAGTATTCGGTGTTTTAAACAATAGAAAAACACGTGGTCCAT 44
                                       ********************************************

consensus_10120#0      GACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTA 360
consensus_10120#1      GACGGAAACAAAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTA 325
consensus_10120#2      GACGGAAACANAATGAATAACCTGGTTGATACGAATAGAATGATGAATATTGACCTCGTA 104
                       ********** *************************************************

consensus_10120#0      CAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATTTAA 420
consensus_10120#1      CAATTACACAATGCCATAAACGTTTATAATGTTTGTCCAAACGTAATTTGATCCATTTAA 385
consensus_10120#2      CAATTACACAATGCCATAAAC-------------------------------CCATTTAA 133
                       *********************                               ********

consensus_10120#0      CTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTG 480
consensus_10120#1      CTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTG 445
consensus_10120#2      CTAGTTCTTTATCGTTGTTGTTGTATATATCTTCACCTTCTGTAACTATGGCAAAGATTG 193
                       ************************************************************

consensus_10120#0      TCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTA 540
consensus_10120#1      TCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTA 505
consensus_10120#2      TCTCTTTCAATTCTGCTGGCATATCACCAGAGATCTCTTGATAATCAGTTGACTTGATTA 253
                       ************************************************************

consensus_10120#0      ATTCATTTGATAAT---CTATTGTTTGCACTATTTGTATTATTTACGTTATTATTCGTTT 597
consensus_10120#1      ATTCATTTGATAAT---CTATTGTTTGCACTATTTGTATTATTTACGTTATTATTCGTTT 562
consensus_10120#2      ATTCATTTGATAATACGTTATTATTCGT-TTGACCGTTCTCTTGAAATTTATGTACATTT 312
                       **************    **** ** *   *    **  * ** *  **  * * * ***

consensus_10120#0      GACCGTTCTCT-TGAAATTTATGTACATTTTCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTGCCACC 656
consensus_10120#1      GACCGTTCTCT-TAAGACCCTCGTGCCAAAAT---------------------------- 593
consensus_10120#2      TCCAGTGAAGAATGTAAATCTGTTGCCACCTTTAATTCTTCTTGTTCAACATATTTGAAT 372
                         * **      *   *      * *                                  

consensus_10120#0      TTTAATTCTTCTTGTTCAACATATTTGAATCGTAAAGCCTCCAGTTCCAATCCTAATACA 716
consensus_10120#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10120#2      CGTAAAGCCTCCAGTTCCAATCCTAATTATGCCTGTCTTTTGAGGATCGAATAATTCTTG 432
                                                                                   

consensus_10120#0      TCACAAAATTTTGAAAGTGTAATTATGCCTGTCTTTTGAGGATCGAATAATTCTTGCCAT 776
consensus_10120#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10120#2      CCATCTCGCTATAAAAGCAGGATCCATATCATTTTTCACCATATATGTTTGTAATTCATC 492
                                                                                   

consensus_10120#0      CTCGCTATAAAAGCAGGATCCATATCATTTTTCACCATATATGTTTGTAATTCATCTATT 836
consensus_10120#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10120#2      TATTGTGATAGTTTCTGAACGATCTTGATCTATGGCGATTTATCATACGTTCTACAACGG 552
                                                                                   

consensus_10120#0      GTGATAGTTTCTGAACGATCTTGATCTATGGCGAAAAACGCTTCTACAAATGCATCCATA 896
consensus_10120#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10120#2      ACTAATCCACAATGGCAGTCAGGACTGT-------------------------------- 580
                                                                                   

consensus_10120#0      TTTATCATACGTTCTACAACGGACTGCCTCGTGCCGAAAATTGGCTNC 944
consensus_10120#1      ------------------------------------------------
consensus_10120#2      ------------------------------------------------