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Schistosoma mansoni
cluster # 10138 cluster # 10138       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10138#0 length = 821 sequences # 13  

consensusID : consensus_10138#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 821
fasta sequence
                              [AAATATCCAGATGGATTTTATGCACATTATTATAGTATGGTTGGTACAGTTTTGCCTGCATTAGCTTGGGGTTTTCTTGGACCAAATGAAAATTATTTTCATATATGTGATCGTTTCCGTGAAATTATTATATCATTTATTCGTGAATCATTTATATGTTATGATGCATCAACATCATCTACATTATCAAGAATTTCTTGTTCAAATGGTTTACCATTATATTTCAGTGAACATTCCATAAAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATAAAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCAAATGATAGTAATCATGATTATAATAATCATAATAGTGGTGATGATAATAGCAGTGCAGGTACTACTATATCTGAATCTGGTCCTACAATAGTGTGTCAATCAGATCAATTACCACAAACAATTTCACCGAATACAATTCATCGTCAAATTGGTTTACGTTATACAACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG-AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG-TTGA-ATT-GGAATCG-AATCCTG-TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT-CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAAG]

[+] EMBL CD081488             [AAATATCCAGATGGATTTTATGCACATTATTATAGTATGGTTGGTACAGTTTTGCCTGCATTAGCTTGGGGTTTTCTTGGACCAAATGAAAATTATTTTCATATATGTGATCGTTTCCGTGAAATTATTATATCATTTATTCGTGAATCATTTATATGTTATGATGCATCAACATCATCTACATTATCAAGAATTTCTTGTTCAAATGGTTTACCATTATATTTCAGTGAACATTCCATAAAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATAAAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCAAATGATAGTAATCATGATTATAATAATCATAATAGTGGTGATGATAATAGCAGTGCAGGTACTACTATATCTGAATCTGGTCCTACAATAGTGTGTCAATCAGATCAATTACCACAAACAATTTCACCGAATACAATTCATCGTCAAATTGGTTTACGTTATACAACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG  AATTATCTG AAATACCGTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAAACAACAGCTGATCATTTTTTAGCAG AATATGTTTTTAATTCCCCATTATTN CTATTGGTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGNATGGACATATGCATNNA TAATGGATGATGGAC TCCTTTGCTCTAGNA TTATTTATCATG TAA TATG AGCA TCCT AATATAa   ]
[+] EMBL CD078442             [AAATATCCAGATGGATTTTATGCACATTATTATAGTATGGTTGGTACAGTTTTGCCTGCATTAGCTTGGGGTTTTCTTGGACCAAATGAAAATTATTTTCATATATGTGATCGTTTCCGTGAAATTATTATATCATTTATTCGTGAATCATTTATATGTTATGATGCATCAACATCATCTACATTATCAAGAATTTCTTGTTCAAATGGTTTACCATTATATTTCAGTGAACATTCCATANAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATANAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCANATGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD075312             [                                                                                                                                                                                                                                           CCATAAAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATAAAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCAAATGATAGTAATCATGATTATAATAATCATAATAGTGGTGATGATAATAGCAGTGCAGGTACTACTATATCTGAATCTGGTCCTACAATAGTGTGTCAATCAGATCAATTACCACAAACAATTTCACCGAATACAATTCATCGTCAAATTGGTTTACGTTATACAACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAAG]
[+] EMBL SMAA69091            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATATCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTG                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL SMAA8343             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAAG]
[+] EMBL SMAA85767            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAA ]
[+] EMBL SMAA85796            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAA ]
[+] EMBL SMAA85836            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTA                                       ]
[+] EMBL SMAA85794            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTTCCAATGGTTTTATATAAAC                                                                                                          ]
[+] EMBL SMAA85775            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAA ]
[+] EMBL SMAA85751            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACA                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL SMAA85790            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTGTAAATTATCTGAAAATACGTTACCAGATTGAGATTGGGAATCGCAATCCTGCTCCAACCGgat                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AA938822             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATCAGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATCATATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACACGTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATT                                                                                                                              ]


>consensus_10138#0 AAATATCCAGATGGATTTTATGCACATTATTATAGTATGGTTGGTACAGTTTTGCCTGCA TTAGCTTGGGGTTTTCTTGGACCAAATGAAAATTATTTTCATATATGTGATCGTTTCCGT GAAATTATTATATCATTTATTCGTGAATCATTTATATGTTATGATGCATCAACATCATCT ACATTATCAAGAATTTCTTGTTCAAATGGTTTACCATTATATTTCAGTGAACATTCCATA AAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATAAAAACTTGATG AATTCTACCATTGATTCAAATGATAGTAATCATGATTATAATAATCATAATAGTGGTGAT GATAATAGCAGTGCAGGTACTACTATATCTGAATCTGGTCCTACAATAGTGTGTCAATCA GATCAATTACCACAAACAATTTCACCGAATACAATTCATCGTCAAATTGGTTTACGTTAT ACAACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGAT TTATTAAACATGTTCATTGACGAACTGAAATTATCTGAAAATACGTTACCAGTTGAATTG GAATCGAATCCTGTCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCAT TTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTTCTATTGTTTTATATAAACTCTTC GTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATT TATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)