|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10138#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 821 fasta sequence
[AAATATCCAGATGGATTTTATGCACATTATTATAGTATGGTTGGTACAGTTTTGCCTGCATTAGCTTGGGGTTTTCTTGGACCAAATGAAAATTATTTTCATATATGTGATCGTTTCCGTGAAATTATTATATCATTTATTCGTGAATCATTTATATGTTATGATGCATCAACATCATCTACATTATCAAGAATTTCTTGTTCAAATGGTTTACCATTATATTTCAGTGAACATTCCATAAAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATAAAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCAAATGATAGTAATCATGATTATAATAATCATAATAGTGGTGATGATAATAGCAGTGCAGGTACTACTATATCTGAATCTGGTCCTACAATAGTGTGTCAATCAGATCAATTACCACAAACAATTTCACCGAATACAATTCATCGTCAAATTGGTTTACGTTATACAACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG-AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG-TTGA-ATT-GGAATCG-AATCCTG-TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT-CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAAG]
[+] EMBL CD081488 [AAATATCCAGATGGATTTTATGCACATTATTATAGTATGGTTGGTACAGTTTTGCCTGCATTAGCTTGGGGTTTTCTTGGACCAAATGAAAATTATTTTCATATATGTGATCGTTTCCGTGAAATTATTATATCATTTATTCGTGAATCATTTATATGTTATGATGCATCAACATCATCTACATTATCAAGAATTTCTTGTTCAAATGGTTTACCATTATATTTCAGTGAACATTCCATAAAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATAAAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCAAATGATAGTAATCATGATTATAATAATCATAATAGTGGTGATGATAATAGCAGTGCAGGTACTACTATATCTGAATCTGGTCCTACAATAGTGTGTCAATCAGATCAATTACCACAAACAATTTCACCGAATACAATTCATCGTCAAATTGGTTTACGTTATACAACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AATTATCTG AAATACCGTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAAACAACAGCTGATCATTTTTTAGCAG AATATGTTTTTAATTCCCCATTATTN CTATTGGTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGNATGGACATATGCATNNA TAATGGATGATGGAC TCCTTTGCTCTAGNA TTATTTATCATG TAA TATG AGCA TCCT AATATAa ]
[+] EMBL CD078442 [AAATATCCAGATGGATTTTATGCACATTATTATAGTATGGTTGGTACAGTTTTGCCTGCATTAGCTTGGGGTTTTCTTGGACCAAATGAAAATTATTTTCATATATGTGATCGTTTCCGTGAAATTATTATATCATTTATTCGTGAATCATTTATATGTTATGATGCATCAACATCATCTACATTATCAAGAATTTCTTGTTCAAATGGTTTACCATTATATTTCAGTGAACATTCCATANAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATANAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCANATGATA ]
[-] EMBL CD075312 [ CCATAAAACATGATACATTTGATAAAAGTATTTTCAATAATTATTCATTAGATAAAAACTTGATGAATTCTACCATTGATTCAAATGATAGTAATCATGATTATAATAATCATAATAGTGGTGATGATAATAGCAGTGCAGGTACTACTATATCTGAATCTGGTCCTACAATAGTGTGTCAATCAGATCAATTACCACAAACAATTTCACCGAATACAATTCATCGTCAAATTGGTTTACGTTATACAACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAAG]
[+] EMBL SMAA69091 [ AACTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATATCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTG ]
[+] EMBL SMAA8343 [ CTGTAGAAGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAAG]
[+] EMBL SMAA85767 [ AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAA ]
[+] EMBL SMAA85796 [ AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAA ]
[+] EMBL SMAA85836 [ AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTA ]
[+] EMBL SMAA85794 [ AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTTCCAATGGTTTTATATAAAC ]
[+] EMBL SMAA85775 [ AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACAGCTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATTT CTATTGTTTTATATAAACTCTTCGTACGTTGTATGTACATATGCATTTATTAATGTATGATGGACTTCTTTTGCTCTAGTATTTATTATTCATGTTAATTATGAAGCATTCCTAAATATAGAA ]
[+] EMBL SMAA85751 [ AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATACGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATACTATGTCGTAAAGTTGAATAACA ]
[+] EMBL SMAA85790 [ AGATTTAGCTAATGATTTATATAAATTAATTAATGTTTATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTGTAAATTATCTGAAAATACGTTACCAGATTGAGATTGGGAATCGCAATCCTGCTCCAACCGgat ]
[+] EMBL AA938822 [ TATTCTCAAGATTTATTAAACATGTTCATTGACGAACTG AAATTATCTGAAAATCAGTTACCAG TTGA ATT GGAATCG AATCCTG TCCAACCGATCATATGTCGTAAAGTTGAATAACAAACACGTGATCATTTTTTAGCAGAAATATGTTTTTAATTCCCATTTATT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||