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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10139#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 1151 fasta sequence
[GTCTGATTTGTGCTTTTTGTTATTCTCTAACTAAACACATCAGTAATGGACTCAGCAGATAACCCTTTTGCTTCGCTTGTAAAAAATTCATCAGTCGGTCTGGGTCCGGCAATTTTTGGTGCCTGTGAAACTGAAGTTACTAAAATCTTGGAGAACATACTACTCATTACCCATGATAAAGATCTTGTTTTTGGTGAATCAGGTAGACCCAGTCATCTACTTTACATACAACCGTTCTCGTGTGGTAATGTACATATTTCGGGGAGCAGTTTAGATGAACTTATATTTGACCGAACCCAAATGAGAAAATTTAACGATTATGATGTTGTCAGCATTAACACAGGGGCGGCCACGGATATCAATGACGTTTTGGCTTCCAACCCAATTAGTTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGCCTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAATAGCTTCCTAAATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCTGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATGCAGTCACTGCTCAGCTTCTTATTGAGTTGTCGTTTCCTCAGAATTTCTCCAGTGGTTCATTTAGACCTGATGAATTCGAAGGTGGTCTTTTGGGTCGACTTCTAGTTTCCAGTCATTTACATTCACCTCAAGCAGCGGAAACAATTTTCCTAACTAATCAGGCCCCAATCGGTGAATTTTTCACCGAAGAAGTACCTCTAAAATCTGTTGTGGAGTCCGAACAACGTACAATATGGCAGTTAACTGAACAAATGGATTTGGCATTGAACAC]
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[+] EMBL CD201604 [ TTATTTGGTCTCTTCTTATCACCGTGCGTGTGTAATTAAACAAACAAACGCTCTTTCACAGATCGTTGAAGATTGTCGCAAAAGTATTGTAAGACAAATTGTACTTCTATTGCTTGTTGATGCTGAGTCTGATAATCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGTCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATC ]
[+] EMBL CD181742 [ TCCGGAAAGCAGCACGAACCTATTTGATATCGTTTATCAAGCTCTCTGCACAGATGACTGCGATCAAATTGCTTATATTCAAAAAATGTTTGATGAAGTCCTTAGTCATCTGGAGCCGGAATCTCTATCGGATGTAAGTATATTAGAATCCTGTCCTCAGTCCGCATTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGCCTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAATAGCTTCCTANATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCCGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATG ]
[-] EMBL CD163595 [ TTAAACAGTTTACGGCCGTTGGTTAATCGCCTTCTAATTCAGTTAAGGAACATTTATTACTCCTCAGTGCAGTCACCAACAGTAGTAAATAGCTTCCTAAATAAACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCTGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATGCAGTCACTGCTCAGCTTCTTATTGAGTTGTCGTTTCCTCAGAATTTCTCCAGTGGTTCATTTAGACCTGATGAATTCGAAGGTGGTCTTTTGGGTCGACTTCTAGTTTCCAGTCATTTACATTCA ]
[+] EMBL CD188011 [ ACAGTTAGTTGGTGCTAGAGAACGTGTCTTGTTCTGTCCTCAACGCCGTCCTCTGCTGATCATGACAATTTGGTTATCTAAGTATGCAGTCACTGCTCAGCTTCTTATTGAGTTGTCGTTTCCTCAGAATTTCTCCAGTGGTTCATTTAGACCTGATGAATTCGAAGGTGGTCTTTTGGGTCGACTTCTAGTTTCCAGTCATTTACATTCACCTCAAGCAGCGGAAACAATTTTCCTAACTAATCAGGCCCCAATCGGTGAATTTTTCACCGAAGAAGTACCTCTAAAATCTGTTGTGGAGTCCGAACAACGTACAATATGGCAGTTAACTGAACAAATGGATTTGGCATTGAACAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||