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consensusID : consensus_10147#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1043 fasta sequence
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[-] EMBL CD165631 [ CAGATAGACAACTCTAAGGACACTGATATTTCCCAGCCACATTATCAACGAAGTGATCAACCATCGTTAGACTCCCAGAAGCTGTTCATGCCTGAAAATGATGATAATGATAAGTATAAACGACATCTAACATTGTCATGGTTCACGCGCTTCCTTCGGAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGGTTATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATCAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTTG ]
[-] EMBL CD074030 [ GTCATGG TCACGCGC TCC TCGNAGGCATGCATCATACTTTACACGTTTATCGG TATTCGACGAAATCGTCTTACTCTATTAATTATGGGTTGTATAATATCTATTTTCCTACTGGGTTTCTATGGTTCTCAACCGGATATCACTGGTGACCCATTATTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTTTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAATGATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTATAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAA ]
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[-] EMBL AI067886 [ TTAGATCCTCATATGAATCCAAATATTCGTNTTAATTTGGAACCTATAGATTCAATAAAAGGAGCCTTAAATAATGATAATAATAATAATCTTAATAACCATAGAGATAGAGGTGTTATTGATGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGATTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTATAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTTATGCTTCTGTCCCTGAGTTCCTTCCTTAGCTAATATATAGTAACCAACATTCGCTTAGGTTTTGTATTAGTGATCAGATATGTACAAGATATTTTACACTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCAT ]
[-] EMBL AI067492 [ GACGTTTTCAAACTTTCAATGGATGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATCGTATATTTTGATAATTTTTATATTTTTCCTACTCACTCCTGATTATCACCAATGTAATACTATCTTTGTATAACCTTATTTTAATGACTGTATGCTGGTGAATAGTGGTTAATTCGCCTTCCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTTATGCTTCTGTCCCTGAGTTCCTTCCTTAGCTAATATATAGTAACCAACATTCGCTTAGGTTTTGTATTAGTGATCAGATATGTACAAGATATTTTACACTATTT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCT]
consensusID : consensus_10147#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 490 fasta sequence
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[+] EMBL CD141362 [TGGGTTGAATGAAGTCTAATTCTATAGTAAGATGGTATTTCTTCTAAACACTATCTTCCTTATTGTGACTCGAACCAATGAACACTTTAGCTCGATGTAACTCGTCATTTTATCTTTTATTGTCTAGTTTGTAATTTTTCTTATTTCTTGTTATTCAAATCGTTAGACGTTTTCAAACTTTCAATGGACGACTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGNTAGATTCGAATGTACATGTCTGATCGNCTG ]
consensusID : consensus_10147#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 348 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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*** **** * * * *** * * *
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consensus_10147#2 GAGCCCCTGTATGTCTTAAAACTAGCAATCTTT--TCATTTAAAAATCAACATAGTATAA 148
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consensus_10147#0 CTTGTTGTTCATCTTCTGTTTAGTTAGATTCGAATGTGCATGTCTGATCGTCTGTTAATC 718
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consensus_10147#2 AATAACTTTCCTCGTATGTATGTACAGTT---ATTATTTATATTATTATGGCTATTTATC 205
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consensus_10147#0 CCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAGTTT 898
consensus_10147#1 CCTTTATGTTTTAATAAATCCCTGTAACTTATTATCCAATAAAAACTGATATTCAAAAAA 431
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consensus_10147#2 --------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||