These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10159#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 872 fasta sequence [GTTTATGACTCTTTTCTTCAAGTTGAATGTACTCAGTCGTGCGATAACGAGGAGCGAAATTGTAAAAACTTGGGGTATCTTGGCGACTAAACAAGACCGGTGGGAGATACAACGGCATATCACGAGATAAATAAGAATCAATCATTGTTGTTGGATCCTTGATTATGAGATCATTGTAGAATATTTTATAATTAGGTGGAATAACTTTAGGTCCTTCACTTTTATCTGTAGTCGGAACACGCTCAAATGGACCAAACTGAAAATCAGCCATGGCATCGAATTTATAAACCCGAGTTACGCGTCCCAGAATAACAGGAACTAATTTGAGCTTGCCTGTTACCTTGTTCCTAAGACGTTGAATACGTATGACAAATGAGTTGGACGAATGACCATCTCCACAAGCAGGCTTTGAATACACCATATGCGGACGAAAAGTGAGATTTAAACGACGTTTGTCGTCAGCGAATACCTCAGATATTTGACTGAGTCCACCAAGCATTTCAATAGCAGTCTCTACATTGTTTACTACTGCCGGGAACTCAACACCATAGAATGTATGACTTGGAAACGTTAAATCCATTTACATATGCGACCGTCAAAGTAGGCAATAAGCGCTTAGCCAGGGATTTAATACGTAAACTAATGTCCG-ATATTGTGACGATGACATTCGTTCTGAAAATATATTGGATGTGATCTGAAAGTACA-TTAAGTGGTTT-CAAGTATAAAG-TATAGTTTAAAAGCTTTAAGAACAAATATGTTGTTTATGATTTAGAACGCTAAATAATAGGGATAGAGCAGCTCT-TTAAGTTGACTGAAAAAGGGAGAACATGCCGGGCGCGACCTTGAGCAACCAGATCGCCCTCCAGTCGTTT] [+] EMBL CD121012 [GTTTATGACTCTTTTCTTCAAGTTGAATGTACTCAGTCGTGCGATAACGAGGAGCGAAATTGTAAAAACTTGGGGTATCTTGGCGACTAAACAAGACCGGTGGGAGATACAACGGCATATCACGAGATAAATAAGAATCAATCATTGTTGTTGGATCCTTGATTATGAGATCATTGTAGAATATTTTATAATTAGGTGGAATAACTTTAGATCCTTCACTTTTATCTGTAGTCGGAACACGCTCAAATGGACCAAACTGAAAATCAGCCATGGCATCGAATTTATAAACCCGAGTTACGCGTCCCAGAATAACAGGAACTAATTTGAGCTTGCCTGTTACCTTGTTCCTAAGACGTTGAATACGTATGACAAATGAGTTGGACGAATGACCATCTCCACAAGCAGGCTTTGAATATACCATATGCGGACGAAAAGTGAGATTTAAACGACGTTTGTCGTCAGCGAATACCTCAGATATTTGACTGAGTCCACCAAGCATTTCGATAGCAGTCTCTACATTGTTTACTACTGCCGGGAACTCAACACCATAGAATGTATGACTTGNAAACGTTAAATCCATTTACATATGCGACCG ] [-] EMBL CD117188 [ 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TTAAGTTGACTGAAAAAGGGAGAACATGCCGGGCGCGACCTTGAGCAACCAGATCGCCCTCCAGTCGTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||