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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10184#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 611 fasta sequence
[GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT-CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT-ACCAAAA-TTTC-AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT-CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT-GG-ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCAGACTGTTCTGTAGACGGT]
[+] EMBL AI764903 [GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT ATAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCNTYCAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTT ]
[+] EMBL AI764909 [GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT NTAAAAAAAGCC ]
[+] EMBL AI764910 [GGTTTTTCCCAAACCTGACACAAGATGAATTCTGGAGTAAAATGTCACTCATCTTGCCCTATTGCTTTCCATGATTTGAAAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATTNCNAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGTCACCAAAATTTTCGAGAGAA ]
[+] EMBL CD119658 [ atcttcAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTACAACATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGA ]
[+] EMBL CD119732 [ gccttcAATGAACAAAAAACATCGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGCGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGA ]
[+] EMBL CD146449 [ CGTTATGTTTTGTTTCACATCAACGATGGAGGAGAAGTCAGCATT CTAAAAAAAGCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAATAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAG ]
[-] EMBL CD126173 [ GCCGAGAGAGAGGCAACGT ACCAAAA TTTC AGAGAAGATATGATTGAAGCAATGGAATTGAAAGACGGTCGGTACGTTGTATATGACTATGAATACCCCAACAAATGTACAGACTTGTTTTTTATAATGTGGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCTAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTC AACTTTGTATTTCCATAGTCTC ]
[+] EMBL CD199475 [ GGACCCCGAAAAACTTAAGCACTAAAAAGAATATGGTGTATGCAGCCT CAAAGTGTGCCGTAAAGTCTCAGTTCCAAGGAATCAAACATTTCTTGGAGGCACATGACCTAGAAGATATCAGTGAAGAGCGTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTA ]
[+] EMBL CD119911 [ GTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCAAACTGGATTTAACTTGTTTTTTTTCAAATTAAGGCAACTCATCCCATGAATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCA ]
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[+] EMBL CD119561 [ GTTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATGT GG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTG TTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCTGACCA ]
[-] EMBL CD119449 [ TTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATATAAG ATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCAGACCAGACTGTTCTGTAGACGGT]
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[-] EMBL CD119366 [ TTTTAATGAAGTGGGGAAGCAGAATAGATTGAGCTGAGTTATTGGAACTTTAATAT GGAATCATTTGTACGGATTACACTTTCTAACTGGATTTTACTTGTTTTTTTTCTAATTAATGCAACTCATCCCATGTATTTGATTTTCAGCTTCAGTTCAAACTTTGTATTTCCATAGTCTCAGACCAGACTGTTCTGTAGACGGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||