These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10187#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 1234 fasta sequence [AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATGTATTCTACAACTCTGGCACTATTATGTAATATGGACCTTTAATAAATAAACATTTA] [+] EMBL CD110841 [AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGGGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAA TATCCTCTCCATG ACATTT ] [+] EMBL CD110959 [AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTG ] [+] EMBL CD118524 [ GGAAA TACGCTTNAGGCAAGGGGCTTGGCTTNATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATNAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTACAAAATGCTGA ] [+] EMBL CD118421 [ CAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGG ] [+] EMBL CD155736 [ TTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGC ] [+] EMBL CD080474 [ GGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCANATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGANTT ] [+] EMBL CD079098 [ TATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTNTTTGATG ] [+] EMBL CD196816 [ GCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCTAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGTACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTA ] [-] EMBL CD158933 [ GTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATT ] [+] EMBL CD151778 [ TTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAAGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTCTTTGGACTAAATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATACGGTCACCTGTACGGCAAATGCATTCAGACGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCTGGATGTGGCTCTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAAATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTACAGTATTTCTACCTGTCACCTCTTAAGCATTGTA ] [-] EMBL CD195294 [ ACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCANATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATG ] [-] EMBL CD162792 [ ATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTCCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGT ] [-] EMBL CD073552 [ GCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATATTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATGTATTCTACAACTCTGGCACTATTATGTAATATGGACCTTTAATAAATAAACATTTA] [+] EMBL CD088320 [ CTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCCTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACAGCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||