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Schistosoma mansoni
cluster # 10187 cluster # 10187       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10187#0 length = 1234 sequences # 14  

consensusID : consensus_10187#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1234
fasta sequence
                              [AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATGTATTCTACAACTCTGGCACTATTATGTAATATGGACCTTTAATAAATAAACATTTA]

[+] EMBL CD110841             [AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGGGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAA TATCCTCTCCATG ACATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD110959             [AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD118524             [              GGAAA TACGCTTNAGGCAAGGGGCTTGGCTTNATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATNAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTACAAAATGCTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD118421             [                               CAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD155736             [                                            TTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD080474             [                                                                         GGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCANATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGANTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD079098             [                                                                                                                                                                                                                                                                            TATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTNTTTGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD196816             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCTAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGTACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD158933             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD151778             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAAGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTCTTTGGACTAAATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATACGGTCACCTGTACGGCAAATGCATTCAGACGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCTGGATGTGGCTCTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAAATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTACAGTATTTCTACCTGTCACCTCTTAAGCATTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD195294             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCANATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATG                                                        ]
[-] EMBL CD162792             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTCCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGT                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD073552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATATTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATGTATTCTACAACTCTGGCACTATTATGTAATATGGACCTTTAATAAATAAACATTTA]
[+] EMBL CD088320             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCCTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACAGCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTT                                                             ]


>consensus_10187#0 AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCT TGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCT GGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAAT TTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCT GTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCA CCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTC ACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGAT GTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAA CATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTT CATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAG CTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAAC CATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATT GCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTA ACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCT TGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATT GTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGAT TGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCG TACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATT TTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAG TATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATGTATTCTACAACTCTGGCACTAT TATGTAATATGGACCTTTAATAAATAAACATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)