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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10187#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 1234 fasta sequence
[AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTGTGGGGGTGGCTTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAGGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTTTTTGGACTAGATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATGTATTCTACAACTCTGGCACTATTATGTAATATGGACCTTTAATAAATAAACATTTA]
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[+] EMBL CD110959 [AGACCGCGAGTTTCGGAAAGTACGCTTCAGGCAAGGGGCTTGGCTTCATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATCAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTATAAAATGCTGACTGTGGCTGCATTCTGCTTCAACCTTTTGGATGTGGGTTCATTTG ]
[+] EMBL CD118524 [ GGAAA TACGCTTNAGGCAAGGGGCTTGGCTTNATTTTTTATGGCTTGTGCAAATAAAGGGTTATATNAGTTGCTTTGGCTTCCATTCCCCTTATTTGTAGTAGCTGGTGTATCGTTGTCGTTGTTTGGCTTAATTATTTGCCTCCTGATATCAACATACAATAATTTCGATGAGGTTACAGAGTCCGTGTGTGGGGTATCCAATTTTGTTCCATCTATCAGTGCTGTTACTGGGATTAAACCCCAAATATACCTATGGCGCTTCACAGTTGGGCTTCATAGTGCACCACGTCTACTCCTTGCGTTTATATATCTTCGATACCATATGTCTTATCACAAAATGTTCACCCAGTCATTGATTTACAAAATGCTGA ]
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[+] EMBL CD151778 [ TTTTATATCTAACCAAGAGAATTATCCTCTCCATGAACATTTGTTCATTGTTTTCCTAGTCGCTTCAACTGCCTATATGGTAGTCACTCTAGCGGTTCATCGGATAATAAGAATCACTTCTTGCACTCCGAGATTCGGATATTCTTTTAACCTGAAGCTCCTGTTCTTTGGACTAAATGTCTGCTTAATCCTCTTGTTAGTCCACCAGTTCTACAACCATACGGTCACCTGTACGGCAAATGCATTCAGACGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCTGGATGTGGCTCTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAAATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTACAGTATTTCTACCTGTCACCTCTTAAGCATTGTA ]
[-] EMBL CD195294 [ ACCAGTTCTACAACCATAGGTTCACCTGTAAGGCANATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATCTTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATG ]
[-] EMBL CD162792 [ ATAGGTTCACCTGTAAGGCAAATGCATTCAGTTGGTTTTCAGCTAGTGAATATGGTATTGCGATTGCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTCCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGT ]
[-] EMBL CD073552 [ GCTAATATGGGATTTCACCTAACAGCCGCATATGACTTTCAGGATGTGGCTTTAACAACCGTAACTTTTAAACCTTCTACTGAATAGATAACGTTTTTTGATGATCTGGTCTCTTGTCACTTGTTATAGAATCATCTGGCTTCCAGTATTTCTACCTGTTACCTCTTAAGCATTGTAATTACAACTTCTGTGCAATGCTTCTTATCACTTTATCATTTTTATATATTTGTTGATTGTGTTTGATACATATCTTTCAGTTTAAAAGTTAGTTACTTATTATTTCTTTTTGATTCGTACACCAAAATATATGCAGTGTTTTGTATTTTACCGATGTAAAATTTTGCTGGTATGATTTTCCGGAATCCGCCTTGTGATATTACTTTTACGTAAACTTATCTCAGATTATTTTCAAAGTATTATTATTTTTATTTATATCGTATTTCGTTTGGATGTATTCTACAACTCTGGCACTATTATGTAATATGGACCTTTAATAAATAAACATTTA]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||