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Schistosoma mansoni
cluster # 10207 cluster # 10207       Sequences # 14       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10207#0 length = 996 sequences # 4  
consensus_10207#1 length = 860 sequences # 5  
consensus_10207#2 length = 517 sequences # 5  

consensusID : consensus_10207#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 996
fasta sequence
                              [GCCTTATTCGGCACGACGTTAAGTGTGAAGAAGTATTAGAATCTGTCCTATTAATTTTATCAGGTATACATTTATGTACTCAACTTTGGGTCTCATATTTTTATAAGGCACGTTGATGCTACTTGACTATCCAGACCGAAATATATTGATGTAGTGGCGTCAAACCTGCGACCTAACGATTGGATGTCCAGTGCCTTGACAACTTAGCAACTTCTATGACGAAGAATTAGCACGATAAATTGCACATTCATGGTATAAAAGTTAGAGTCCTATCAAGTGTTATTTAATATGTGAATCAATGGAATGATTATCATTTGTTAATTTTTAGCTACTTAATAGATTTGATAAAGCTTTTCTTCTTCTTAAAGCGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACACCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGGATATTATCTGTGATGAAAAGAAGTGGTTCTGAAGTCGATGAAGAACTAGAAAGACTTGTAAATGAATGGAAGAAAAGGCGGGTAAATCTTATGTGTAAACAATCAAAAGCTGAGAGGAAACAACTCTTAGACGGTTCGATTAGTCGTCGACGTGGTGAAAGACGCCTTGCTTACAAGGTGCTTAAG-AACTGCAACAAAGAAAAGAATGCTGAAAATATTGACATTCATGATAAGAGCTCGTGGTTTAGACCATGGAATCCTCACAGAGGTCGTATAAGTGAAGTACCTGGTGCGCTAAGCAAAAAACGCAAGATTGGATGATAGGTTTGT-AATTTGAAATTACTTT-CCTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAANCTAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD081763             [GCCTTATTCGGCACGACGTTAAGTGTGAAGAAGTATTAGAATCTGTCCTATTAATTTTATCAGGTATACATTTATGTACTCAACTTTGGGTCTCATATTTTTATAAGGCACGTTGATGCTACTTGACTATCCAGACCGAAATATATTGATGTAGTGGCGTCAAACCTGCGACCTAACGATTGGATGTCCAGTGCCTTGACAACTTAGCAACTTCTATGACGAAGAATTAGCACGATAAATTGCACATTCATGGTATAAAAGTTAGAGTCCTATCAAGTGTTATTTAATATGTGAATCAATGGAATGATTATCATTTGTTAATTTTTAGCTACTTAATAGATTTGATAAAGCTTTTCTTCTTCTTAAAGCGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACACCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGGATATTATCTGTGATGAAAAGAAGTGGTTCTGAAGTCGATGAAGAACTAGAAAGACTTGTAAATGAATGGAAGAAAAGGCGGGTAAATCTTATGTGTAAACAATCAAAAGCTGAGAGGAAACAACTCTTAGACGGTTCGATTAGTCGTCGACGTGGTGAAAGACGCCTTGCTTANCAGGTGCTTAAGAAACTGC ACANAGAANAGAATGCTGAANATATTGACATTCATGATAAGAGCTCGTGGTTTAGACCATGGAATCCTCACAGAGGTCGTATAAGTGAAGTACCTGGTGCGCTAAGC AAAAACGCAAGATTGGATGATANGTTNGTAAATTTGAAA TACTTTNCTTTAGT AT CTATTCAAAGATAAtt                           ]
[-] EMBL CD075495             [                                                                                                                                                                                     GGATGTCCAGTGCCTTGACAACTTAGCAACTTCTATGACGAAGAATTAGCACGATAAATTGCACATTCATGGTATAAAAGTTAGAGTCCTATCAAGTGTTATTTAATATGTGAATCAATGGAATGATTATCATTTGTTAATTTTTAGCTACTTAATAGATTTGATAAAGCTTTTCTTCTTCTTAAAGCGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACACCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGGATATTATCTGTGATGAAAAGAAGTGGTTCTGAAGTCGATGAAGAACTAGAAAGACTTGTAAATGAATGGAAGAAAAGGCGGGTAAATCTTATGTGTAAACAATCAAAAGCTGAGAGGAAACAACTCTTAGACGGTTCGATTAGTCGTCGACGTGGTGAAAGACGCCTTGCTTACAAGGTGCTTAAG AACTGCAACAAAGAAAAGAATGCTGAAAATATTGACATTCATGATAAGAGCTCGTGGTTTAGACCATGGAATCCTCACAGAGGTCGTATAAGTGAAGTACCTGGTGCGCTAAGCAAAAAACGCAAGATTGGATGATAGGTTTGT AATTTGAAATTACTTT CCTTAGTAATCCTGTTCAAAGATAAATTTa                        ]
[-] EMBL AI395538             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGG TATTATCTGTGATGAAAAGAAGTGGTTCTGAAGTCGATGAAGAACTAGAAAGACTTGTAAATGAATGGAAGAAAAGGCGCGTAAATCTTATGTGTAAACAATCAAAAGCTGAGAGGAAACAACTCTTAGACGGTTCGATTAGTCGTCGACGTGGTGAAAGACGCCTTGCTTACAAGGTGCTTAAG AACTGCAACAAAGAAAAGAATGCTGAAAATATTGACATTCATGATAAGAGCTCGTGGTTTAGACCATGGAATCCTCACAGAGGTCGTATAAGTGAAGTACCTGGTGCGCTAAGCAAAAAACGCAAGATTGGATGATAGGTTTGT AATTTGAAATTACTTT CCTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAANCTAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL AI394982             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GACGCTTGGCTTACAAGGTGCTTAAG AACTGCAACAAAGAAAAGAATGCTGAAAATATTGACATTCATGATAAGAGCTCGTGGTTTAGACCATGGAATCCTCACAGAGGTCGTATAAGTGAAGTACCTGGTGCGCTAAGCAAAAAACGCAAGATTGGATGATAGGTTTGT AATTTGAAATTACTTT CCTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAA   AAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_10207#0 GCCTTATTCGGCACGACGTTAAGTGTGAAGAAGTATTAGAATCTGTCCTATTAATTTTAT CAGGTATACATTTATGTACTCAACTTTGGGTCTCATATTTTTATAAGGCACGTTGATGCT ACTTGACTATCCAGACCGAAATATATTGATGTAGTGGCGTCAAACCTGCGACCTAACGAT TGGATGTCCAGTGCCTTGACAACTTAGCAACTTCTATGACGAAGAATTAGCACGATAAAT TGCACATTCATGGTATAAAAGTTAGAGTCCTATCAAGTGTTATTTAATATGTGAATCAAT GGAATGATTATCATTTGTTAATTTTTAGCTACTTAATAGATTTGATAAAGCTTTTCTTCT TCTTAAAGCGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCT GTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACG ATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGAC ACCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGGATAT TATCTGTGATGAAAAGAAGTGGTTCTGAAGTCGATGAAGAACTAGAAAGACTTGTAAATG AATGGAAGAAAAGGCGGGTAAATCTTATGTGTAAACAATCAAAAGCTGAGAGGAAACAAC TCTTAGACGGTTCGATTAGTCGTCGACGTGGTGAAAGACGCCTTGCTTACAAGGTGCTTA AGAACTGCAACAAAGAAAAGAATGCTGAAAATATTGACATTCATGATAAGAGCTCGTGGT TTAGACCATGGAATCCTCACAGAGGTCGTATAAGTGAAGTACCTGGTGCGCTAAGCAAAA AACGCAAGATTGGATGATAGGTTTGTAATTTGAAATTACTTTCCTTAGTAATCCTATTCA AAGATAAATTTTCCATAANCTAAAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_10207#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 860
fasta sequence
                              [TAATTTCTACCCCTAGTCGATTAAGCACTCTATTATCTCTTCCATCAGAACATTGTCCCATTGATTTATCCAGACTGTCTTGGCTTGTAGTAGATGAATGCGATAAAATGTTAGAAGTCAATTTTAACGATATATCCTTTTCTAACACTGAACATGGTAACAAGACAAAATACCGACCTCGAGGATTTCATAATCAGGTTGCGCCTATTTTTGAATTTATTCAGAAAGTAAACCTCACTGGGACAATCAATTAGGAGACCTTCAGTCGCTTTATTTTCAGCCTACTGTTCCTGATGAAGTTGTTTCATGGGCACGAAATCAGCTGCCTGT-CCCCTTAAAATTAGACAGTTC-GGAGTATGAGTTAATTCAGTTACGAGTAGGTATCCGAAATGCTGCTGTTTCTACTGTCAAACAAGAGTTACGTTATTGTGCTACAGAACAGGGGAAATTGTTAGAGATGCGTTATCTATTGGCTAATGGACTAGCTTATCCATGTTTAATTTTTATGCAGTCTCGAGATAGAGCCAATGAAATTCTTAAGGAAATTCTATTGTCTGATGCAGATATTCTTGCGAATGTTATTTCAAGTGACAAAACAGAAGCACAACGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACACCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGGATATTATCTGTGATGAAAAGAAGTG]

[+] EMBL AI381067             [TAATTTCTACCCCTAGTCGATTAAGCACTCTATTATCTCTTCCATCAGAACATTGTCCCATTGATTTATCCAGACTGTCTTGGCTTGTAGTAGATGAATGCGATAAAATGTTAGAAGTCAATTTTAACGATATATCCTTTTCTAACACTGAACATGGTAACAAGACAAAATACCGACCTCGAGGATTTCATAATCAGGTTGCGCCTATTTTTGAATTTATTCAGAAAGTAAACCTCACTGGGACAATCAATTAGGAGACCTTCAGTCGCTTTATTTTCAGCCTACTGTTCCTGATGAAGTTGTTTCATGGGCACGAAATCAGCTGCCTGT Ct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD185320             [                                                                                                                                                                                                                             CAGAAAGTAAACCTCACT GGACAATCAATTAGGAGACCTTTAGTCGCTTTATTTTCAG CTACTGTTCCTGATGAAGTTGTTTCATGGGCACGAAATCAGCTGCCTGT CCTCTTAAAATTAGACAGTTC GGAGTATGAGTTAATTCAGTTACGAGTAGGTATCCGAAATGCTGCTGTTTCTACTGTCAAACAAGAGTTACGTTATTGTGCTACAGAACAGGGGAAATTGTTAGAGATGCGTTATCTATTGGCTAATGGACTAGCTTATCCATGTTTAATTTTTATGCAGTCTCGAGATAGAGCCAATGAAATTCTTAAGGAAATTCTATTGTCTGATGCAGATATTCTTGCGAATGTTATTTCAAGTGACAAAACAGAAGCACAACGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTNTANAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAA                                                                                                ]
[-] EMBL CD117094             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTGTTCCTGATGAAGTTGTTTCATGGGCACGAAATCAGCTGCCTGT CCCCTTANAATTAGACAGTTC GGAGTATGAGTTAATTCAGTTACGAGTAGGTATCCGAAATGCTGCTGTTTCTACTGTCAAACAAGAGTTACGTTATTGTGCTACAGAACAGGGGAAATTGTTAGAGATGCGTTATCTATTGGCTAATGGACTAGCTTATCCATGTTTAATTTTTATGCAGTCTCGAGATAGAGCCAATGAAATTCTTAAGGAAATTCTATTGTCTGATGCAGATATTCTTGCGAATGTTATTTCAAGTGACAAAACAGAAGCACAACGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGCCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACACCATGGA                                                                         ]
[-] EMBL CD117135             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACGAAATCAGCTGCCTGTCCCCCTTAAAATTAGACAGTTCGGGAGTATGAGTTAATTCAGTTACGAGTAGGTATCCGAAATGCTGCTGTTTCTACTGTCAAACAAGAGTTACGTTATTGTGCTACAGAACAGGGGAAATTGTTAGAGATGCGTTATCTATTGGCTAATGGACTAGCTTATCCATGTTTAATTTTTATGCAGTCTCGAGATAGAGCCAATGAAATTCTTAAGGAAATTCTATTGTCTGATGCAGATATTCTTGCGAATGTTATTTCAAGTGACAAAACAGAAGCACAACGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGCCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACACCATGGA                                                                         ]
[-] EMBL CD159900             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATCTATGGGCTAATGGACTAGCTTATCCATGTTTAATTTTTATGCAGTCTCGAGATAGAGCCAATGAAATTCTTAAGGAAATTCTATTGTCTGATGCAGATATTCTTGCGAATGTTATTTCAAGTGACAAAACAGAAGCACAACGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGTCATGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACACCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGGATATTATCTGTGATGAAAAGAAGTG]


>consensus_10207#1 TAATTTCTACCCCTAGTCGATTAAGCACTCTATTATCTCTTCCATCAGAACATTGTCCCA TTGATTTATCCAGACTGTCTTGGCTTGTAGTAGATGAATGCGATAAAATGTTAGAAGTCA ATTTTAACGATATATCCTTTTCTAACACTGAACATGGTAACAAGACAAAATACCGACCTC GAGGATTTCATAATCAGGTTGCGCCTATTTTTGAATTTATTCAGAAAGTAAACCTCACTG GGACAATCAATTAGGAGACCTTCAGTCGCTTTATTTTCAGCCTACTGTTCCTGATGAAGT TGTTTCATGGGCACGAAATCAGCTGCCTGTCCCCTTAAAATTAGACAGTTCGGAGTATGA GTTAATTCAGTTACGAGTAGGTATCCGAAATGCTGCTGTTTCTACTGTCAAACAAGAGTT ACGTTATTGTGCTACAGAACAGGGGAAATTGTTAGAGATGCGTTATCTATTGGCTAATGG ACTAGCTTATCCATGTTTAATTTTTATGCAGTCTCGAGATAGAGCCAATGAAATTCTTAA GGAAATTCTATTGTCTGATGCAGATATTCTTGCGAATGTTATTTCAAGTGACAAAACAGA AGCACAACGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCTTATCTG TACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAATTACGA TGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAACTGGCCGAGCTGGACA CCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGCATATGGATGGGATATT ATCTGTGATGAAAAGAAGTG



consensusID : consensus_10207#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 517
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTGGATGATAGGTTTGTAATTTGAAATTACTTTCCTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAAACTATATTGTTTTCATGCGTAAAAAGATAAGATAGAACATGGCAAAGTTTAAAGATTTGTCGATGAGTTATGGAAAAAAACAAGGGAGTTACGTAGTACAAACAAATAGCTTATAAATATTTGGTAACATGCCTTACTAATTTTTGTGAATAAGAGTTATCTGAATGAAATAAATTTAAAGTAATCTACTTCACAATGTAATCACAGATCGAATTAAAGGCTTCC-CAAGACGTAATTCTTCAGAAAGTATACGTTTCATTTCTTCTTTGTAAGTGTAGCTTGGGGGAACCCAACGATATTTTTTTCGTTGTTTGTGAGGTGTAGATTTGTTCTTTACATGTTCATCAATTGTTGATTCGTTATCTACAGATGCACTTGTATTCAGAATCCTATTGATTTGGTTATCTTGCG-CCTCGTTACTATGTTCAGTCAAACAGTTA]

[+] EMBL AI394930             [TTTTTTTTTTGGATGATAGGTTTGTAATTTGAAATTACTTTCCTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAAACTATATTGTTTTCATGCGTAAAAAGATAAGATAGAACATGGCAAAGTTTAAAGATTTGTCGATGAGTTATGGAAAAAAACAAGGGAGTTACGTAGTACAAACAAATAGCTTATAAATATTTGGTAACATGCCTTACTAATTTTTGTGAATAAGAGTTATCTGAATGAAATAAATTTAAAGTAATCTACTTCACAATGTAATCACAGATCGAATTAAAGG TTCCACAAGACGTAA TCTTCAGAAAGTAAACGTTTAATTCCT                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BF936983             [                   GTTTGTAATTTGAAATTACTTTCCTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAAACTATATTGTTTTCATGCGTAAAAAGATAAGATAGAACATGGCATAGTTTAAAGATTTGTCGATGAGTTATGGAAAAAAACAAGGGAGTTACGTAGTACAAACAAATAGCTTATAAATATTTGGTAACATGCCTTACTAATTTTTGTGAATAAGAGTTATCTGAATGAAATAAATTTAAAGTAATCTACTTCACAATGTAATCACAGATCGAATTAAAGGCTTCC CAAGACGTAATTTTTCAGAAAGTATACGTTTCATTTCTTCTTTGTAAGTGTAGCTTGGGGGAACCCAACGATATTTTTTTCGTTGTTTGTGAGGTGTAGATTTGTTCTTTACATGTTCATCAATTGTTGATTCGTTATCTACAGATGCACTTGTATTCAGAATCCCATTGATTTGGTTATCTTGCG ACTCGTTACTA                  ]
[+] EMBL BF936988             [                   GTTTGTAATTTGAAATTACTTTCCTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAAACTATATTGTTTTCATGCGTAAAAAGATAAGATAGAACATGGCAAAGTTTAAAGATTTGTCGATGAGTTATGGAAAAAAACAAGGGAGTTACGTAGTACAAACAAATAGCTTATAAATATTTGGTAACATGCCTTACTAATTTTTGTGAATAAGAGTTATCTGAATGAAATAAATTTAAAGTAATCTACTTCACAATGTAATCACAGATCGAATTAAAGGCTTCC CAAGACGTAATTCTTCAGAAAGTATACGTTTCATTTCTTCTTTGTAAGTGTAGCTTGGGGGAACCCAACGATATTTTTTTCGTTGTTTGTGAGGTGTAGATTTGTTCTTTA                                                                                                         ]
[-] EMBL SMAA28845            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTT GGGGAACCCAACGATATTTTTTTCGTTGTTTGTGAGGTGTAGATTTGTTCTTTACATGTTCATCAATTGTTGATTCGTTATCTACAGATGCACTTGTATTCAGAATCCTATTGATTTGGTTATCTT CGTCCTCGTTACTATGTTCAGTCAAACAGT  ]
[-] EMBL SMAA25627            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTT GGGGAACCCAACGATA TTTTTTCGTTGTTTGTGAGGTGTAGATTTGTTCTTTACATGTTCATCAATTGTTGATTCGTTATCTACAGATGCACTTGTATTCAGAATCCTATTGATTTGGTTATCTCG T CCTCGTTACTATGTTCA  CAAACAGTTA]


>consensus_10207#2 TTTTTTTTTTGGATGATAGGTTTGTAATTTGAAATTACTTTCCTTAGTAATCCTATTCAA AGATAAATTTTCCATAAACTATATTGTTTTCATGCGTAAAAAGATAAGATAGAACATGGC AAAGTTTAAAGATTTGTCGATGAGTTATGGAAAAAAACAAGGGAGTTACGTAGTACAAAC AAATAGCTTATAAATATTTGGTAACATGCCTTACTAATTTTTGTGAATAAGAGTTATCTG AATGAAATAAATTTAAAGTAATCTACTTCACAATGTAATCACAGATCGAATTAAAGGCTT CCCAAGACGTAATTCTTCAGAAAGTATACGTTTCATTTCTTCTTTGTAAGTGTAGCTTGG GGGAACCCAACGATATTTTTTTCGTTGTTTGTGAGGTGTAGATTTGTTCTTTACATGTTC ATCAATTGTTGATTCGTTATCTACAGATGCACTTGTATTCAGAATCCTATTGATTTGGTT ATCTTGCGCCTCGTTACTATGTTCAGTCAAACAGTTA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10207#0      GCCTTATTCGGCACGACGTTAAGTGTGAAGAAGTATTAGAATCTGTCCTATTAATTTTAT 60
consensus_10207#1      ---------------------------------------------------TAATTTCTA 9
consensus_10207#2      -------------------------------------------------------TTTTT 5
                                                                              **   

consensus_10207#0      CAGGTATACATTTATGTACTCAACTTTGGGTCTCATATTTTTATAAGGCACGTTGATGCT 120
consensus_10207#1      CCCCTAGTCGATTAAGCACTCTATT----ATCTC----TTCCATCAGA-ACATTG-TCCC 59
consensus_10207#2      TTTTTGGATGAT-AGGTTTGTAATTTGAAATTAC----TTTCCTTAGTAATCCTATTCAA 60
                           *      * * *      * *     *  *    **   * **  *   *  *   

consensus_10207#0      ACTTGACTATCCAGACCGAAATATATTGATGTAGTGGCGTCAAACCTGCGACCTAACGAT 180
consensus_10207#1      ATTGATTTATCCAGACTGTCTTGGCTTGTAGTAG----ATGAA---TGCGATAAAATG-T 111
consensus_10207#2      AGATAAATTTTCCA--TAAACTATATTGTTTTCATG-CGTAAA----AAGATAAGATA-G 112
                       *      * * *         *   ***   *       * **      **    *    

consensus_10207#0      TGGATGTCCAGTGCCTTGACAACTTAGCAACTT-CTATGACGAAGAAT--TAGCACGATA 237
consensus_10207#1      TAGAAGTCAA---TTTTAACGATATATCCTTTT-CTAACACTGAACATGGTAACAAGACA 167
consensus_10207#2      AACATGGCAA--AGTTTAAAGATTTGTCGATGAGTTATGGAAAAAAACAAGGGAGTTACG 170
                          * * * *     ** *  *  *  *       **      *  *          *  

consensus_10207#0      AATTGC--ACATTCATGGTATAAAAGTTAGAGT---CCTATCA--AGTGTTATTTAATAT 290
consensus_10207#1      AAATACCGACCTCGAGGATTTCATAATCAGGTTGCGCCTATTTTTGAATTTATTCAGAAA 227
consensus_10207#2      TAGTACAAACAAATAGCTTATAAATATTTGGTAACATGCCTTACTAATTTTTGTGAATAA 230
                        * * *  **    *   * * *   *  *          *        **  * *  * 

consensus_10207#0      GTGAA--TCAATGGAATGATTATCATTTGTTAATTTTTAGCTACTTAATAGATTTGATAA 348
consensus_10207#1      GTAAACCTCACTGGGACAATCA--ATTAGGAGACCTTCAGTCGCTTTAT----TT--TCA 279
consensus_10207#2      GAG----TTATCTGAATGAA----ATAAATTTAAAGTAATCTACTTCACA------ATGT 276
                       *      * *   * *  *     **      *   * *    *** *         *  

consensus_10207#0      AGCTTTTCTTCTTCTTAAAGCGTGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTC 408
consensus_10207#1      GCCTACTGTTCCTGATGAAGT---------TGTTTCATGGGCAC----GAAATCAGCTGC 326
consensus_10207#2      AATCACAGATCGAATTAAAGGCTTCC--CAAGACGTAATTCTTCAGAAAGTATACGTTTC 334
                                **    * ***           *           *           * * *

consensus_10207#0      ATGTTCTTATCTGTACGGATCTATTGGGT---CGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTA 465
consensus_10207#1      CTGTCCCCTTAAAATTAGACAGTTCGGAG---TATGAGTTAATTCAGTTACGAGTAGGTA 383
consensus_10207#2      AT-TTCTTCTTTGTAAGTGTAGCTTGGGGGAACCCAACGATATTTTTTTCGTTGTTTGTG 393
                        * * *   *             * **                          **  ** 

consensus_10207#0      TGGTAGTCAATTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAAGAATATATACATCGCGTTGGTCGAA 525
consensus_10207#1      TCCGA---AATGCTGCTGTTTCTACTGTCAAACAAGAGTTACGTTATTGTGCTA-CAGAA 439
consensus_10207#2      AGGTG--TAGATTTGTTCTTTACATGTTCAT-CAATTGTTGATTCGTTAT-CTA-CAGAT 448
                               *     * * **       * *  ***   *       *     *    ** 

consensus_10207#0      CTGGCCGAGCTGGACACCATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTCCCGC 585
consensus_10207#1      CAGGGGAAATTGTTAGAGATGCGTTATCTATTGGCTAATGGACTAGCTTA-----TCCAT 494
consensus_10207#2      GCACTTGTATTCAGAATCCTATTGATTTGGTTATCTTGCGCCTCGTTACTATGTTCAGTC 508
                                 *        *          **  **   *                    

consensus_10207#0      ATATGGATGGGATATTATCTGTGATGAAAAGAAGTGGTTCTGAAGTCGATGAAGAACTAG 645
consensus_10207#1      GTTTAATTTTTATGCAGTCT----CGAGA-----------TAGAGCCAATGAAATTCTTA 539
consensus_10207#2      AAACAGTTA--------------------------------------------------- 517
                              *                                                    

consensus_10207#0      AAAGACTTGTAAATGAATGGAAGAAA-AGGCGGGTAAATCTTATGTGTAAACAATCAAAA 704
consensus_10207#1      AGGAAATTCTAT-TGTCTGATGCAGATATTCTTGCGAATGTTATTT-CAAGTGAC--AAA 595
consensus_10207#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10207#0      GCTGAGAGGAAACAACTCTTAGACGGTTCGATTAGTCGTCGACGTGGTGAAAGACGC-CT 763
consensus_10207#1      ACAGAAGCACAACG-TGCCAGTGTGGTTCGCGCTTTCCGTGAGGGACAGCTTCATGTTCT 654
consensus_10207#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10207#0      TGCTTACAAGGTGCTTAAGAACTGCAACAAAGAAAAGAATGCTGAAAATATTGACATTCA 823
consensus_10207#1      TATCTGTACGGATCTATTGGGTCGTGGAATAGACTTTAAAGGTGTCAGTATGGTAGTCAA 714
consensus_10207#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10207#0      TGATAAGAGCTCGTGGTTTAGACCATGGAATCCTCACAGAGGTCGTATAAGTGAAGTACC 883
consensus_10207#1      TTACGATGTTCCTCCGTTAAAACAA--GAATATATACA----TCGCGTTGGTCGAA---C 765
consensus_10207#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10207#0      TGGTGCGCTAAGCAAAAAACGCAAGATTGGATGATAGGTTTGTAATTTGAAATTACTTTC 943
consensus_10207#1      TGG----CCGAGCTGGACAC-CATGGACGGGCTATTACCTTATGGACTGATTCTGACCTC 820
consensus_10207#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10207#0      CTTAGTAATCCTATTCAAAGATAAATTTTCCATAANCTAAAAAAAAAAAAAAA 996
consensus_10207#1      CCGCATA-------TGGATGGGATATTATCTGTGATGAAAAGAAGTG------ 860
consensus_10207#2      -----------------------------------------------------
                                                                            




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)