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Schistosoma mansoni
cluster # 10221 cluster # 10221       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10221#0 length = 1706 sequences # 14  

consensusID : consensus_10221#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1706
fasta sequence
                              [CCCTCCGAGCCAANAATTCCTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC-AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCACGTTCACGAAGACGGAAACAAGAAGCTGAAGAGTTGGCAGCTGAAGCGCGACAGGCTATGGAGGACCCGTTACTTCCAGCTCCAGTTGATCTCGGTACTGATGGTTATCAGCTGGCCGAGGGTGAAGAACGCTCTATGATAGAACCTCAGTCAAAAGAACATCCATTAGTTCATGATTTATCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTTTCTCCAGCCATAATTCTACCACGTAAAGTTCAACATAACTGTTTTAATAGTTCGGAAAATCAATGGTATTTTACAACATAGACGTCAAATTGAACTACTTACTGATGTTGGAGATGAACAAGATAATACAGAAACTGATCATGATGCTATAAGTGCATTGGTCGATTGTGCCATACCAGAACAATTGGCTTCATTTCAACAAACTTTAAAAACATTTGTAAATCGTAATTTGAATAAACTGAATCTACATGTTACTGATTTGGAAAATGAAATGAGTGATGGTGTCTACTTCATTTTATTACTTGGTTTACTTGGCAACTATTTTGTTCCACTGCATGCTTATCATATCACACCAACAACAGACGCTCAAAAGTTGGCTAATCTTCAAGTAGCTTTTCAATTAGCTCATGATGCTGAAGGTATTGACTTGGAATATAATCAACCTGAAAATGTATTACGCCACGATTTAAAAGCAACATTACGTTTATTATATACATTATATACTCGATATGGTGATATTTAATAAGAGAAAAAGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAACTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAGAGGCAAAATGCATTTACTTTTTTTGATTACCGTGTGATTTTTCTTAAAGATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGTAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTCTCGTAAACACGTTTATAAATTTTTGGCTTTATTTGCTTTTATTATGAATTTGCCAAAAAAGGAACCTTATGATTAGTTTATATTAATTAAGAATCCGGGTATAACATCCTTTCATACATCAGTGGATATAAACTGAAGGGCTGATATTAAAACGTATCCAATATTAAGGCTCAAAGATAGATGAATGTAAAATATTTTGAGTGTAAAAGCCTTGACTGCTGATGAAACGTTGTGTTTTATTGTCCCTATGCTTCCATATTTTACGTTGTTAGTTTGTATAATAATAATGATA]

[+] EMBL CD079705             [CCCTCCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGTTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCCNAGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCACGTTCACGAAGACGGAAACAAGAAGCTGAAGAGTTGGCAGCTGAAGCGCGACAGGCTATGGAGGACCCGTTACTTCCAGCTCCAGTTGATCTCGGTACTGATGGTTATCAGCTGGCCGAGGGTGAAGAACGCTCTATGATAGAACCTCAGTCAAAAGAACATCCATTAGTTCATGATTTATCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTNTCTCCAGCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD199885             [                   CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAAACGTGCTGTAAGCCC ACGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAAAGTCTGGCTTCTTAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD199946             [                   CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGATAGTCTGGCTTCTTATCTAAGTTAAACACGCTGTCt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD199984             [                   CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGCAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD199845             [                   CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD165378             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGTAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTTTCTCCAGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD165316             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCATGCCCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTGTTGGTGGCATTAGTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD165374             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGTAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD165368             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD165319             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTGATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD078808             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTTTCTCCAGCCATAATTCTACCACGTAAAGTTCAACATAACTGTTTTAATAGTTCGGAAAATCAATGGTATTTTACAACATAGACGTCAAATTGAACTACTTACTGATGTTGGAGATGAACAAGATAATACAGAAACTGATCATGATGCTATAAGTGCATTGGTCGATTGTGCCATACCAGAACAATTGGCTTCATTTCAACAAACTTTAAAAACATTTGTAAATCGTAATTTGAATAAACTGAATCTACATGTTACTGATTTGGAAAATGAAATGAGTGATGGTGTCTACTTCATTTTATTACTTGGTTTACTTGGCAACTATTTTGTTCCACTGCATGCTTATCATATCACACCAACAACAGACGCTCAAAAGTTGGCTAATCTTCAAGTAGCTTTTCAATTAGCTCATGATGCTGAAGGTATTGACTTGGAATATAATCAACCTGAAAATGTATTACGCCACGATTTAAAAGCAACATTACGTTTATTATATACATTATATACTCGATATGGTGATATTTAATAAGAGAAAAAGGACTTATTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD136643             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACAGACGCTCAAAAGTTGGCTAATCTTCAAGTAGCTTTTCAATTAGCTCATGATGTTGAAGGTATTGACTTGGAATATAATCAACCTGAAAATGTATTACGCCACGATTTAAAAGCAGCATTACGTTTATTATATACATTATATACTCGATATGGTGATATTTAATAAGAGAAAAAGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAACTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAGAGGCAAAATGCATTTACTTTTCTTGATTACCGTGTGATTTTTCTTAAAGATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGTAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTCTCGTAAACACGTTTATAAATTTTTGGCTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073963             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGAGAAAAAGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAACTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAAAGGCAAAATGCATTTACTTTTTTTGATTACCGGGTGATTTTTTTTAAAAATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGGAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTCTCGTAAACCCGTTTATAAATTTTTGGCTTTATTTGCTTTTATTATGAATTTGCCAAAAAAGGAACCTTATGATTAGTTTATATTAATTAAGAATCCGGGTATAACATCCTTTCATACATCAGTGGATATAAACTGAAGGGCTGATATTAAAACGTATCCAATATTAAGGCTCAAAGATAGATGAATGTAAAATATTTTGAGTGTAAAAGCCTTGACTGCTGATGAAACGTTGTGTTTTATTGTCCCTATGCTTCCATATTTTACGTTGTTAGTTTGTATAATAATAATGATA]
[-] EMBL CD073268             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAAGTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAGAGGCAAAATGCATTTACTTTTTTTGATTACCGTGTGATTTTTCTTAAAGATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGTAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTTTCGTAAACACGTTTATAAATTTTTGGCTTTATTTGCTTTTATTATGAATTTGACAAAAAAGGAACATTATGTTTAGTTTATATTAATTAAGAATCCGTGTATAACATCATTTCATACATCAGTGGATATAAACTGAAGTGCTGATATTAAAACGTATACAATATTAAGGCTCAAAGATAGATGAATGTAAAATATTTTGAGTGTAAAAGCATTGACTGTTGATGAAACGTTGTGTCTTATTGTCACTATGCTTCCATATTTTACGTTGTTAGTTTGTATAATCCTAATGATA]


>consensus_10221#0 CCCTCCGAGCCAANAATTCCTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAA AGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCCAGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATC TATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTA AACACGCTGTCACGTTCACGAAGACGGAAACAAGAAGCTGAAGAGTTGGCAGCTGAAGCG CGACAGGCTATGGAGGACCCGTTACTTCCAGCTCCAGTTGATCTCGGTACTGATGGTTAT CAGCTGGCCGAGGGTGAAGAACGCTCTATGATAGAACCTCAGTCAAAAGAACATCCATTA GTTCATGATTTATCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGA ATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATT GAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAA AAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTT CGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTA CGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTTTCTCCAGCCATAATTCTACCACGTAAAGTT CAACATAACTGTTTTAATAGTTCGGAAAATCAATGGTATTTTACAACATAGACGTCAAAT TGAACTACTTACTGATGTTGGAGATGAACAAGATAATACAGAAACTGATCATGATGCTAT AAGTGCATTGGTCGATTGTGCCATACCAGAACAATTGGCTTCATTTCAACAAACTTTAAA AACATTTGTAAATCGTAATTTGAATAAACTGAATCTACATGTTACTGATTTGGAAAATGA AATGAGTGATGGTGTCTACTTCATTTTATTACTTGGTTTACTTGGCAACTATTTTGTTCC ACTGCATGCTTATCATATCACACCAACAACAGACGCTCAAAAGTTGGCTAATCTTCAAGT AGCTTTTCAATTAGCTCATGATGCTGAAGGTATTGACTTGGAATATAATCAACCTGAAAA TGTATTACGCCACGATTTAAAAGCAACATTACGTTTATTATATACATTATATACTCGATA TGGTGATATTTAATAAGAGAAAAAGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTA ACTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAGAGGCAAAATGCATTT ACTTTTTTTGATTACCGTGTGATTTTTCTTAAAGATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTA TAAATGGTAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTCTCGTAAACACGTTTATAAATTTTTGG CTTTATTTGCTTTTATTATGAATTTGCCAAAAAAGGAACCTTATGATTAGTTTATATTAA TTAAGAATCCGGGTATAACATCCTTTCATACATCAGTGGATATAAACTGAAGGGCTGATA TTAAAACGTATCCAATATTAAGGCTCAAAGATAGATGAATGTAAAATATTTTGAGTGTAA AAGCCTTGACTGCTGATGAAACGTTGTGTTTTATTGTCCCTATGCTTCCATATTTTACGT TGTTAGTTTGTATAATAATAATGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)