These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10221#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 1706 fasta sequence [CCCTCCGAGCCAANAATTCCTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC-AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCACGTTCACGAAGACGGAAACAAGAAGCTGAAGAGTTGGCAGCTGAAGCGCGACAGGCTATGGAGGACCCGTTACTTCCAGCTCCAGTTGATCTCGGTACTGATGGTTATCAGCTGGCCGAGGGTGAAGAACGCTCTATGATAGAACCTCAGTCAAAAGAACATCCATTAGTTCATGATTTATCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTTTCTCCAGCCATAATTCTACCACGTAAAGTTCAACATAACTGTTTTAATAGTTCGGAAAATCAATGGTATTTTACAACATAGACGTCAAATTGAACTACTTACTGATGTTGGAGATGAACAAGATAATACAGAAACTGATCATGATGCTATAAGTGCATTGGTCGATTGTGCCATACCAGAACAATTGGCTTCATTTCAACAAACTTTAAAAACATTTGTAAATCGTAATTTGAATAAACTGAATCTACATGTTACTGATTTGGAAAATGAAATGAGTGATGGTGTCTACTTCATTTTATTACTTGGTTTACTTGGCAACTATTTTGTTCCACTGCATGCTTATCATATCACACCAACAACAGACGCTCAAAAGTTGGCTAATCTTCAAGTAGCTTTTCAATTAGCTCATGATGCTGAAGGTATTGACTTGGAATATAATCAACCTGAAAATGTATTACGCCACGATTTAAAAGCAACATTACGTTTATTATATACATTATATACTCGATATGGTGATATTTAATAAGAGAAAAAGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAACTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAGAGGCAAAATGCATTTACTTTTTTTGATTACCGTGTGATTTTTCTTAAAGATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGTAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTCTCGTAAACACGTTTATAAATTTTTGGCTTTATTTGCTTTTATTATGAATTTGCCAAAAAAGGAACCTTATGATTAGTTTATATTAATTAAGAATCCGGGTATAACATCCTTTCATACATCAGTGGATATAAACTGAAGGGCTGATATTAAAACGTATCCAATATTAAGGCTCAAAGATAGATGAATGTAAAATATTTTGAGTGTAAAAGCCTTGACTGCTGATGAAACGTTGTGTTTTATTGTCCCTATGCTTCCATATTTTACGTTGTTAGTTTGTATAATAATAATGATA] [+] EMBL CD079705 [CCCTCCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGTTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCCNAGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCACGTTCACGAAGACGGAAACAAGAAGCTGAAGAGTTGGCAGCTGAAGCGCGACAGGCTATGGAGGACCCGTTACTTCCAGCTCCAGTTGATCTCGGTACTGATGGTTATCAGCTGGCCGAGGGTGAAGAACGCTCTATGATAGAACCTCAGTCAAAAGAACATCCATTAGTTCATGATTTATCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTNTCTCCAGCCA ] [+] EMBL CD199885 [ CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAAACGTGCTGTAAGCCC ACGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAAAGTCTGGCTTCTTAt ] [+] EMBL CD199946 [ CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGATAGTCTGGCTTCTTATCTAAGTTAAACACGCTGTCt ] [+] EMBL CD199984 [ CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGCAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCA ] [+] EMBL CD199845 [ CTCTTGTGATTTGTTGCATGCCACAGTCAGGTAACCTTCAAAGCCCTGGGACTCCCAGACGTGCTGTAGGCCC AGGGGCTTCAAATTTTGGAAGTGGAATCTATGGTCCAAATGTTGGTGGCGGAGCTGATTCCCGAGAGTCTGGCTTCTTAGCTAAGTTAAACACGCTGTCA ] [+] EMBL CD165378 [ TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGTAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTTTCTCCAGCC ] [+] EMBL CD165316 [ TCATGCCCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTGTTGGTGGCATTAGTTCAT ] [+] EMBL CD165374 [ TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGTAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCAT ] [+] EMBL CD165368 [ TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTAATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGGTGGCATTAGn ] [+] EMBL CD165319 [ TCATGCTCACTTATTGAATGGATTAATACTGAACTTGTAGATGATAGAATTTTAGTACGTGATCTAGAAGCAGACTTATTTGATGGACAAGTATTGCAAAAATTAATTGAAAAATTGCTAAATATTAAAATTAATCATCCAGAAGTAGCGCAGACTGAAATAGGCCAAAAACAACGTTTAAAAATTGTGATTGATGAAATCAATGGTGCTTTAGGCATATCACCTGTTCGTGCTGCCCAACTATGGCCTGTTTCTGCTGTGTATAATCGGGATTTAGTGGCTATACTACGTTTATTGG ] [+] EMBL CD078808 [ ACTACGTTTATTGGTGGCATTAGTTCATAAATTTTCTCCAGCCATAATTCTACCACGTAAAGTTCAACATAACTGTTTTAATAGTTCGGAAAATCAATGGTATTTTACAACATAGACGTCAAATTGAACTACTTACTGATGTTGGAGATGAACAAGATAATACAGAAACTGATCATGATGCTATAAGTGCATTGGTCGATTGTGCCATACCAGAACAATTGGCTTCATTTCAACAAACTTTAAAAACATTTGTAAATCGTAATTTGAATAAACTGAATCTACATGTTACTGATTTGGAAAATGAAATGAGTGATGGTGTCTACTTCATTTTATTACTTGGTTTACTTGGCAACTATTTTGTTCCACTGCATGCTTATCATATCACACCAACAACAGACGCTCAAAAGTTGGCTAATCTTCAAGTAGCTTTTCAATTAGCTCATGATGCTGAAGGTATTGACTTGGAATATAATCAACCTGAAAATGTATTACGCCACGATTTAAAAGCAACATTACGTTTATTATATACATTATATACTCGATATGGTGATATTTAATAAGAGAAAAAGGACTTATTTATG ] [-] EMBL CD136643 [ AACAGACGCTCAAAAGTTGGCTAATCTTCAAGTAGCTTTTCAATTAGCTCATGATGTTGAAGGTATTGACTTGGAATATAATCAACCTGAAAATGTATTACGCCACGATTTAAAAGCAGCATTACGTTTATTATATACATTATATACTCGATATGGTGATATTTAATAAGAGAAAAAGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAACTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAGAGGCAAAATGCATTTACTTTTCTTGATTACCGTGTGATTTTTCTTAAAGATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGTAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTCTCGTAAACACGTTTATAAATTTTTGGCTTTATT ] [-] EMBL CD073963 [ AAGAGAAAAAGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAACTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAAAGGCAAAATGCATTTACTTTTTTTGATTACCGGGTGATTTTTTTTAAAAATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGGAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTCTCGTAAACCCGTTTATAAATTTTTGGCTTTATTTGCTTTTATTATGAATTTGCCAAAAAAGGAACCTTATGATTAGTTTATATTAATTAAGAATCCGGGTATAACATCCTTTCATACATCAGTGGATATAAACTGAAGGGCTGATATTAAAACGTATCCAATATTAAGGCTCAAAGATAGATGAATGTAAAATATTTTGAGTGTAAAAGCCTTGACTGCTGATGAAACGTTGTGTTTTATTGTCCCTATGCTTCCATATTTTACGTTGTTAGTTTGTATAATAATAATGATA] [-] EMBL CD073268 [ AGGACTTATTTATGAGTGAATCTGTATACATCTTTTAAGTAGTCATTTCTTTTTTTATGCTGGATTATTATTTTGTTGCAAGAGGCAAAATGCATTTACTTTTTTTGATTACCGTGTGATTTTTCTTAAAGATAATCTGTATTCATCATTCAGTTTATAAATGGTAATCTTTTTAATTCAATTTTATGCTTTCGTAAACACGTTTATAAATTTTTGGCTTTATTTGCTTTTATTATGAATTTGACAAAAAAGGAACATTATGTTTAGTTTATATTAATTAAGAATCCGTGTATAACATCATTTCATACATCAGTGGATATAAACTGAAGTGCTGATATTAAAACGTATACAATATTAAGGCTCAAAGATAGATGAATGTAAAATATTTTGAGTGTAAAAGCATTGACTGTTGATGAAACGTTGTGTCTTATTGTCACTATGCTTCCATATTTTACGTTGTTAGTTTGTATAATCCTAATGATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||