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Schistosoma mansoni
cluster # 10224 cluster # 10224       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10224#0 length = 889 sequences # 14  

consensusID : consensus_10224#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 889
fasta sequence
                              [CAATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT-TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC-ATCGGATGT-TCCTAAACGTATAAACAACACATCTTTGCAACCAGCA-TAATGTAATAATTTCGTCACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACAAATCTGGCATGCGAACCGGCTATATTTTCTACAGGTAATGCCAAACCAGCTAATTTAGCCATTGATATTGCAAAATTATGGATTCTACCACTGCTACCACATACACAGACG-CCTCTGACATCACCAAACTTCTCTTTGAAATCAAATGACTTTGTGGTGAATCCGAAATGATGGAACACATCTTCATCTAGTTCACTTAAATGACTATTCACAA]

[-] EMBL AI764819             [CAATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCANCTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACTCTCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD096501             [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCAGGTCTCTGTGCAAATAATGTAAATTCATCGGTAGATATAGTAATT TGATCACCTTCAAGACGATTTACAGCTGTTACACAAACTAGAATAGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAGACC ACCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCTTTGCAACCAGCA TAATGTAATAATTTCGTTACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGC AATAATATATGATCCACTTTGTAANGTAC                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD147127             [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATTGCAATGAGATGTAATTGCAGCACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGATCATAAACTGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACCTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD147117             [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATTGCAATGAGATGTAATTGCAGCACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGATCATAAACTGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACCTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD143625             [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCAGGTCTCTGTGCAAATAATGTAAATTCATCGGTAGATATAGTAATT TGATCACCTTCAAGACGATTTACAGCTGCTACACGAACTAGAATAGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAGACC ACCGGATGTNCCCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD096582             [             TGCATTAACGAACAATTATCCCA TGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAANCCAATCCCATGA TCTGCAAATAATATATGATCCA CTTTGTAAagtaca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD077366             [                                                                   GACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCCTTGCAACCgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD134360             [                                                                          tctCTGTGCAAATAATGTAAATTCATCGGTAGATATAGTAATT TGATCACCTTCAAGACGA TTACAGCTG TACACAAACTAGAATAGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD096549             [                                                                                gTCAAATAA TTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCCTTGCAACCGGCA TAATATAATAATTTTGTCACTTCATGCATTAAAATTAATGTTGATGGTATACCAATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACA                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD096513             [                                                                                               TTCATCCGTAGATGTAGTANCT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATTGCAATGAGATGTAATTGCAGCACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGATCATAAACTGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCCTTGCAACCGGCA TAATATAATAATTTTGTCACTTCATGCATTAAAATTAATGTCGATGGTATACCAATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACA                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AI820466             [                                                                                                                                                                          gcCCGGTTAAATTGCACTGGGATGT GTTGTCGCCCCCCCCATTTCCATATTT TTTTTCCATGATCATAAACTGACTGAGGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATT TACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD136714             [                                                                                                                                                                                                                                                         AAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAGACC ACCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCTTTGCAACCAGCA TAATGTAATAATTTCGTCACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGC                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD077623             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTGC ACCAGCANTAATGTAATAATTTCGTCACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACAAATCTGGCATGCGAACCGGCTATATTTTCTACAGGTAATGCCAAACCAGCTAATTTAGCCATTGATATTGCAAAATTATGGATTCTACCACTGCTACCACATACACAGACG CCTC                                                                                                   ]
[+] EMBL CD156554             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAAACCAGCTAATTTAGCCATTGATATTGCAAAATTATGGATTCTACCACTGCTACCACATACACAGACGAACT TGACATCACCAAACTTCTCTTTGAAATCAAATGACTTTGTGGTGAATCCGAAATGATGGAACACATCTTCATCTAGTTCACTTAAATGACTATTCACAA]


>consensus_10224#0 CAATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCA ACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACTTCA TCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAA TAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAA GCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAAT CTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACAT TTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTA GTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTA TTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACCATCGGATGTT CCTAAACGTATAAACAACACATCTTTGCAACCAGCATAATGTAATAATTTCGTCACTTCA TGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCC ACTTTGTAAAGTACAAATCTGGCATGCGAACCGGCTATATTTTCTACAGGTAATGCCAAA CCAGCTAATTTAGCCATTGATATTGCAAAATTATGGATTCTACCACTGCTACCACATACA CAGACGCCTCTGACATCACCAAACTTCTCTTTGAAATCAAATGACTTTGTGGTGAATCCG AAATGATGGAACACATCTTCATCTAGTTCACTTAAATGACTATTCACAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)