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Schistosoma mansoni
cluster # 1025 cluster # 1025       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1025#0 length = 642 sequences # 2  

consensusID : consensus_1025#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 642
fasta sequence
                              [GAAACAATAAATTCTACATCAGATTCCCTAATTTGTCAATGAGTCTTCTATCCACCCGCGTACTCCTCCTTCCAATATGCATACAATCCCAAAAAGCCTTTCATTTCCATTAATACTCCCTAAAAGTACATGATAGGAAGTGGAATTATAAATACTTTTCTCTTTGGATATCCAACAACCTTCATAATTCTTCATTTTTATGTTGCATTAAAACCAAACGTATACGTATATGACGATGATAATGAGTTGTCCCTATCGTTTGGTTGACCTTTTTTTT--AATATAGCAAC-CTAAAAT-ATAAGACGAACATTGATGCTAGTTTGCATCATTAACTATTATTACTTTTTGCTGAAATGTTTTGATACTTCTATAAACAAAACCTCTCTCCATTCTTTCCTTTCAACTATGTCGATTGTCTTTATTTTTCCTATGACATCTATACGCAACATATATATTCATGTATACTCATGTGTACTTGGATTCATCATTTGATGTAGATAACGTTTCTTGTTCATCTTTAATAGTTTTAATTAATGTTAATACAATTATTCCGTTACAATCGGTTGAATTTCTTAAAACGGATTAATTACATGCATAAAGGTCATTTCTATTCGTGGTTGAAGTGATTATGTCATCATAGTATA]

[+] EMBL CD140033             [GAAACAATAAATTCTACATCAGATTCCCTAATTTGTCAATGAGTCTTCTATCCACCCGCGTACTCCTCCTTCCAATATGCATACAATCCCAAAAAGCCTTTCATTTCCATTAATACTCCCTAAAAGTACATGATAGGAAGTGGAATTATAAATACTTTTCTCTTTGGATATCCAACAACCTTCATAATTCTTCATTTTTATGTTGCATTAAAACCAAACGTATACGTATATGACGATGATAATGAGTTGTCCCTATCGTTTGGTTGACCTTTTTTTT  AATATAGCAAC CTAAAAT ATAAGACGAACATTGATGCTAGTTTGCATCATTAACTATTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD197535             [                                                                                                                                                                                                                                                         TCCCTATAGTTTGGTTGACCTTTTTTTTTAAATATAGCAACACTAAAATAATAAGACGAACATTGATGCTAGTTTGCATCATTAACTATTATTACTTTTTGCTGAAATGTTTTGATACTTCTATAAACAAAACCTCTCTCCATTCTTTCCTTTCAACTATGTCGATTGTCTTTATTTTTCCTATGACATCTATACGCAACATATATATTCATGTATACTCATGTGTACTTGGATTCATCATTTGATGTAGATAACGTTTCTTGTTCATCTTTAATAGTTTTAATTAATGTTAATACAATTATTCCGTTACAATCGGTTGAATTTCTTAAAACGGATTAATTACATGCATAAAGGTCATTTCTATTCGTGGTTGAAGTGATTATGTCATCATAGTATA]


>consensus_1025#0 GAAACAATAAATTCTACATCAGATTCCCTAATTTGTCAATGAGTCTTCTATCCACCCGCG TACTCCTCCTTCCAATATGCATACAATCCCAAAAAGCCTTTCATTTCCATTAATACTCCC TAAAAGTACATGATAGGAAGTGGAATTATAAATACTTTTCTCTTTGGATATCCAACAACC TTCATAATTCTTCATTTTTATGTTGCATTAAAACCAAACGTATACGTATATGACGATGAT AATGAGTTGTCCCTATCGTTTGGTTGACCTTTTTTTTAATATAGCAACCTAAAATATAAG ACGAACATTGATGCTAGTTTGCATCATTAACTATTATTACTTTTTGCTGAAATGTTTTGA TACTTCTATAAACAAAACCTCTCTCCATTCTTTCCTTTCAACTATGTCGATTGTCTTTAT TTTTCCTATGACATCTATACGCAACATATATATTCATGTATACTCATGTGTACTTGGATT CATCATTTGATGTAGATAACGTTTCTTGTTCATCTTTAATAGTTTTAATTAATGTTAATA CAATTATTCCGTTACAATCGGTTGAATTTCTTAAAACGGATTAATTACATGCATAAAGGT CATTTCTATTCGTGGTTGAAGTGATTATGTCATCATAGTATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)