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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10251#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 1165 fasta sequence
[TTTTCTCCAAAACAGATTTATCGACTATACAATAGGTATTTGGCTTTGGACAAGACGAACGCCGGGTATTTGAGGCGTCATGATTTTCTGTTAATTCCAGAATTAGCCATTAATCCACTTGGCGATCGAATCGTGAATGAATTCTTTAAAGATAGTCAAGGTGAATTAAATTTTCGTCAATTTGTACGTAAATTAGCAAGATTTCGTAAAGTTCGACCTCAACAATCAACTCAATTT-AATAATCGTGATGCAAAATTACGATTTCTATTCGGTATGTATGATTTAGATATGGATGGTAAAATATCAAGAAATGAATTATTGGGAATGTTACAAATGATGGTTGGTGCTAATATTACTGTTGAACAGATCAATAATATTGGTGAAAGAACAATGGCTGAAGCGGATCTTGATGGTGATTGTTATATATCTTATGCGGAATTTGTACAAGC-ATTTGACAATGTGGATATTGAACAAAAGATGAGTATAC-GCTTCTTGGAATGATTACACCGATCGATATATGTATATCTATCTTTATCCTCCTGTTGTTAGACACACACACACACACACCAAAACTCGCAACAATTCCAATTATGAACTAAATCACTTCTTATCAATGATTTTCTTGTCGTTCAACTTTCTTTTCTGTATTCACTTCATTTACACAATGCTCAACTGTT--TGTGCACATA-TAAATATTATTA-TCTTGAT-CCTATGATCGACGTTTTAGTTTTGAATAGTTAGTTGTGTATGTGTTGCTATACTTCTCAATTATCCTCTTGTGAACACATAAAGAAAGGCATGAAATG-ACATGCATACTATACATATCTCTTGTGTAATCTTTCTATATCATATAATTTTGTCCCTAGCTTACATATGAGTAGTAAAACTATAGTTTTATGTTATCTACTTATTTATATTTCAGTAGTATATTTGTGTATCCCAATTTTTAACGCCAATATCCATTGCGCTGTTTGTTATAGTGAATAATTTTTGAGAGATTTTTTTAAAAAATATCTTGATGATTATGTTTTTGGTTATTATTATCATTAATACTTATTGCAATGATTGGATGTGATTTAAAATTACCACTATTTATATCTTTACTATTCACCAATGTTCATAATTATGTGAATATTTGAATTCAATATGCTTAGAATAAATACTATT]
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[-] EMBL CD179736 [ TGAAAGAACAATGGCTGAAGCGGATCTTGATGGTGATTGTTATATATCTTATGCGGAATTTGTACAAGC ATTTGACAATGTGGATATTGAACAAAAGATGAGTATAC GCTTCTTGGAATGATTACACCGATCGATATATGTATATCTATCTTGATCCTCCTGTTGTTAGACACACACACACGCACACCAAAACTCGCAACAATTCCAATTATGAATTAAATCACTTCTTATCAATGATTTTCTTGTCGTTCAACTTTCTTTTCTGTATTCACTTCATTTACACAATGCTCAACTGTT TGTGCACATA TAAATATTATTA TCTTGAT CCTATGATCGACGTTTTAGTTTTGAATAGTTAGTTGTGTATGTGTT ]
[+] EMBL SMAA85771 [ ATTGTTATATATCTTATGCGGAATTTGTACAAGC ATTTGACAATGTGGATATTGAACAAAAGATGAGTATAC GCTTCTTGGAATGATTACACCGATCGATATATGTATATCTATCTTTATCCTCCTGTTGTTATACACACACACACACACACCAAAACTCGCAACAATTCCAATTATGAACTAAATCACTTCTTATCAATGATTTTCTTGTCGTTCAACTTTCTTTTCTGTATTCACTTCATTTACACAATGCTCAACTGTT TGTGCACATA TAAATATTATTA TCTTGAT CCTATGATCGACGTTTTAGTTTTGAATAGTTAGTTGTGTATGTGTTGCTATACTTCTCAATTATCCTCTTGTGAACACATAAAGAGAGGCATGAAATGCACAGGCAT ]
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[-] EMBL CD074384 [ TGTTNNTGTGCACATATTAAATATTATTATTCTTGATCCCTATGATCGACGTTTTAGTTTTGAATAGTTAGTTGTGTATGTGTTGCTATACTTCTCAATTATCCTCTTGTGAACACATAAAGAAAGGCATGAAATG ACATGCATACTATACATATCTCTTGTGTAATCTTTCTATATCATATAATTTTGTCCCTAGCTTACATATGAGTAGTAAAACTATAGTTTTATGTTATCTACTTATTTATATTTCAGTAGTATATTTGTGTATCCCAATTTTTAACGCCAATATCCATTGCGCTGTTTGTTATAGTGAATAATTTTTGAGAGATTTTTTTAAAAAATATCTTGATGATTATGTTTTTGGTTATTATTATCATTAATACTTATTGCAATGATTGGATGTGATTTAAAATTACCACTATTTATATCTTTACTATTCACCAATGTTCATAATTATGTGAATATTTGAATTCAATATGCTTAGAATAAATACTATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||