cluster # 10252

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Schistosoma mansoni
cluster # 10252 cluster # 10252 Sequences # 14 consensus # 3

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consensus_10252#0 length = 997 sequences # 9

consensus_10252#1 length = 795 sequences # 4
consensus_10252#2 length = 474 sequences # 1

consensusID : consensus_10252#0
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fasta sequence

                              [NAATTTTGGCACGAGGAGCTAANTCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTCATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAACAATCGTTGAAACATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAGTGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACATCCTTTCAGGTTTTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTCTGAATTATGTTCTTTTTCATTCCTTATTTGATTTCCAGGTTGAAATGTCAATGTGATATGCTTACTTTTTAATTTAATTTTCAGTTGCATAACGTTTTGCTTTAAATGTATAACTAACATAAATTACCTCACTAATTCTCTTATCTGATATATATCTTCAATATTTATGTTTTTCGTTTTAACTGATCTCCTAAGCTATCTAACAAATTCAATGTATTTCCGGTGTTCAAATTGAAGTG-GAA-GTCTTTGTTTATCATGGTTCCATCTAACTCGTTGCAAATGTGATTTCATTTGTGTGTTTCTCGATTTATAGTGTGATTTTTCCCTTAATAATAGTTTTAAGTTGAATTACAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD080849             [NAATTTTGGCACGAGGAGCTAANTCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTCATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAACAATCGTTGAAACATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAGTGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACATCCTTTCAGGTTTTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTCTGAATTATGTTCTTTTTCATTCCTTATTTGATTTCCAGGTTGAAATGTCAATGTGATATGCTTACTTTNTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD167533             [                                TGATATTTATATC CATGCGTATCTCATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTTGCAACAATCGTTGAAACATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAGTGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD065807             [                                                                                                                                                                                cGTGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTACTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACATCCTTTCAGGTTTTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTATGAATTATGTTCTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD152963             [                                                                                                                                                                                                                     GACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACATCCTTTCAGGTTTTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTCTGAATTATGTTCTTTTTCATTCCTTATTTGATTTCCAGGTTGAAATGTCAATGTGATATGCTTACTTTTTAATTTAATTTTCAGTTGCATAACGTTTTGCTTTAAATGTATAACTAACATAAATTACCTCACTAATTCTCTTATCTGATATATATCTTCAATATTTATGTTTTTCGTTTTAACTGATCTCCTAAGCTATCTAACAAATTCAATGTATTTCCGGTGTTCAAATTGAAGTG GAA GTCTCTGTgtcg                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD133512             [                                                                                                                                                                                                                                               CATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACATCCTTTCAGGTTTTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTCTGAATTATGTTCTTTTTCATTCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD152639             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACATCCTTTCAGGTTTTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTCTGAATTATGTTCTTTTTCATTCCTTATTTGATTTCCAGGTTGAAATGTCAATGTGATATGCTTACTTTTTAATTTAATTTTCAGTTGCATAACGTTTTGCTTTAAATGTATAACTAACATAAATTACCTCACTAATTCTCTTATCTGATATATATCTTCAATATTTATGTTTTTCGTTTTAACTGATCTCCTAAGCTATCTAACAAATTCAATGTATTTCCGGTGTTCAAATTGAAG                                                                                                                                     ]
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>consensus_10252#0
NAATTTTGGCACGAGGAGCTAANTCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTCAT
CAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAACAATCGTTGAAACA
TCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAGTG
TTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTC
ATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGAT
TTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAG
GTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTT
AAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATAT
ATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTTTTGATTTTTATG
TCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACATCCTTTCAGGTT
TTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTCTGAATTATGTTCTTTTTCATTCCTTATTTGA
TTTCCAGGTTGAAATGTCAATGTGATATGCTTACTTTTTAATTTAATTTTCAGTTGCATA
ACGTTTTGCTTTAAATGTATAACTAACATAAATTACCTCACTAATTCTCTTATCTGATAT
ATATCTTCAATATTTATGTTTTTCGTTTTAACTGATCTCCTAAGCTATCTAACAAATTCA
ATGTATTTCCGGTGTTCAAATTGAAGTGGAAGTCTTTGTTTATCATGGTTCCATCTAACT
CGTTGCAAATGTGATTTCATTTGTGTGTTTCTCGATTTATAGTGTGATTTTTCCCTTAAT
AATAGTTTTAAGTTGAATTACAAAAAAAAAAAAAAAA

consensusID : consensus_10252#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
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Sequences nbr = 4
consensus length = 795
fasta sequence

                              [GCTCGCTTGTGCGCTGTGTACGGTGGGACTTATATGCTCAATAAACCGATTGATGAACTAGTGATGGAAAAAGGAAGAGTTGTTGGAGTCAAATCAGATAATAAAATTGCAAAATGTAACATGGTTATTTGTGATCCAAGTTATGTGCCCACTATGGTAATAAAAGTCGATCAAGTTGTTCGTGCTATCTGCA-TCTGACACATCGGATTGCGGAAGTACAAAACTCTCTATCAACCCAAATTATTATTCCTCAAAGTGAAGTTAATCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTCATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAAC-AATCGTTGAAACATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAGTGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTT-AAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATCTATCTGTGTATTATTATTGTTTATCGTCATTGTTAAACGTAACAGTGT]

[+] EMBL SMAA69188            [GCTCGCTTGTGCGCTGTGTACGGTGGGACTTATATGCTCAATAAACCGATTGATGAACTAGTGATGGAAAAAGGAAGAGTTGTTGGAGTCAAATCAGATAATAAAATTGCAAAATGTAACATGGTTATTTGTGATCCAAGTTATGTGCGCACTATGGTAATAAAAGTCGATCAAGTTGTTCGTGCTA CTGCA TCTGACACATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD152592             [                                                                                          AAATCAGATAATAAAATTGCAAAATGTAACATGGTTATTTGTGATCCAAGTTATGTGCCCACTATGGTAATAAAAGTCCATCAAGTTGTTCGTGCTATCTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD078891             [                                                                                                                           GTTATTTGTGATCCAAGTTATGTGCCCACTATGGTAATAAAAGTCGATCAAGTTGTTCGTGCTATCTGCATTCTGACACATCCGATTGCGGAAGTACAAAACTCTCTATCAACCCAAATTATTATTCCTCAAAGTGAAGTTAATCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTCATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAAC AATCGTTGAAACATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAGTGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTT AAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATC                                                                                             ]
[+] EMBL CD167526             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCA ATGCGTATCTCATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAACAAATCGTTGAAACATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAGTGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTTTCCTTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAGATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAGAGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATCTATCTGTGTATTATTATTGTTTATCGTCATTGTTAAACGTAACAGTGT]




>consensus_10252#1
GCTCGCTTGTGCGCTGTGTACGGTGGGACTTATATGCTCAATAAACCGATTGATGAACTA
GTGATGGAAAAAGGAAGAGTTGTTGGAGTCAAATCAGATAATAAAATTGCAAAATGTAAC
ATGGTTATTTGTGATCCAAGTTATGTGCCCACTATGGTAATAAAAGTCGATCAAGTTGTT
CGTGCTATCTGCATCTGACACATCGGATTGCGGAAGTACAAAACTCTCTATCAACCCAAA
TTATTATTCCTCAAAGTGAAGTTAATCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTC
ATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAACAATCGTTGAAA
CATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAG
TGTTTTATTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTTT
TCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTAG
ATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAAAGAGGTATGAAG
AGGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGAAAAGTCTTCACGATAAAAATCTGATTATCCTGCT
TTAAACAGATGTTATTTTCTGTTGTCTACGTATTTATTCATCGTTGTTAGTTGTGTTATA
TATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATCTATCTGTGTATTATTATTGTTTATCGTCATTGT
TAAACGTAACAGTGT

consensusID : consensus_10252#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 474
fasta sequence

                              [TCCTGGGAACACCAATCAGCAAAACCAGTTAACTGAGTACATTTACGATGATTATCTATTAGCCAAGGATATGCGTTCTCCTAGGAAATTAACAACACACAATAATTAAAGAAATAATAACTCCTTACTGTTTCTAACTTCACCATTAGGGAAGTTATCAAGTTGAACACTGTTACGTTTAACAATGACGATAAACAATAATAATACACAGATAGATAAACCAGTGCATAAAGCGGTAAACTATCTTATTTTACTCATTTAATCACAAAAAATCTGGAACAATAGGAAACCAAAATTGTATGAACGATACAAATAAAGAGACGACTGTCAAGACGATCACAAGATTACTCGAGTTTTGTTAAAGTCTTTCTAATAACAGTAACCGTCAGTGCTTGCTTCAATCAATTTTTTCGCACTAGCTCTTCACAATTTTGATTAGTTGCCACTACCTTTAGTTCGTTAACTTTTTGTGTG]

[+] EMBL CD169069             [TCCTGGGAACACCAATCAGCAAAACCAGTTAACTGAGTACATTTACGATGATTATCTATTAGCCAAGGATATGCGTTCTCCTAGGAAATTAACAACACACAATAATTAAAGAAATAATAACTCCTTACTGTTTCTAACTTCACCATTAGGGAAGTTATCAAGTTGAACACTGTTACGTTTAACAATGACGATAAACAATAATAATACACAGATAGATAAACCAGTGCATAAAGCGGTAAACTATCTTATTTTACTCATTTAATCACAAAAAATCTGGAACAATAGGAAACCAAAATTGTATGAACGATACAAATAAAGAGACGACTGTCAAGACGATCACAAGATTACTCGAGTTTTGTTAAAGTCTTTCTAATAACAGTAACCGTCAGTGCTTGCTTCAATCAATTTTTTCGCACTAGCTCTTCACAATTTTGATTAGTTGCCACTACCTTTAGTTCGTTAACTTTTTGTGTG]




>consensus_10252#2
TCCTGGGAACACCAATCAGCAAAACCAGTTAACTGAGTACATTTACGATGATTATCTATT
AGCCAAGGATATGCGTTCTCCTAGGAAATTAACAACACACAATAATTAAAGAAATAATAA
CTCCTTACTGTTTCTAACTTCACCATTAGGGAAGTTATCAAGTTGAACACTGTTACGTTT
AACAATGACGATAAACAATAATAATACACAGATAGATAAACCAGTGCATAAAGCGGTAAA
CTATCTTATTTTACTCATTTAATCACAAAAAATCTGGAACAATAGGAAACCAAAATTGTA
TGAACGATACAAATAAAGAGACGACTGTCAAGACGATCACAAGATTACTCGAGTTTTGTT
AAAGTCTTTCTAATAACAGTAACCGTCAGTGCTTGCTTCAATCAATTTTTTCGCACTAGC
TCTTCACAATTTTGATTAGTTGCCACTACCTTTAGTTCGTTAACTTTTTGTGTG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10252#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#1      GCTCGCTTGTGCGCTGTGTACGGTGGGACTTATATGCTCAATAAACCGATTGATGAACTA 60
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#1      GTGATGGAAAAAGGAAGAGTTGTTGGAGTCAAATCAGATAATAAAATTGCAAAATGTAAC 120
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#1      ATGGTTATTTGTGATCCAAGTTATGTGCCCACTATGGTAATAAAAGTCGATCAAGTTGTT 180
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#1      CGTGCTATCTGCATCTGACACATCGGATTGCGGAAGTACAAAACTCTCTATCAACCCAAA 240
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      NAATTTTGGCACGAGG--AGCTAANTCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTC 58
consensus_10252#1      TTATTATTCCTCAAAGTGAAGTTAATCGAAAACATGATATTTATATCACATGCGTATCTC 300
consensus_10252#2      TCCTGGGAACACCAATC-AGCAAAACCAGTTAACTGA-GTACATTTACGATGATTATCT- 57
                          *     * * *    *    *  *    *  ***  *  ** *   ***  ***** 

consensus_10252#0      ATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAACAATCGTTGAAA 118
consensus_10252#1      ATCAGCATAATACCTGTCCTGAAAATTTCTTTGTGGCACATGTCGCAACAATCGTTGAAA 360
consensus_10252#2      ATTAGCCAAGGATATGCGTT-----CTCCTAGGAAATTAACAACACA-CAATAATTAAAG 111
                       ** ***  *  *  **   *      * **  *      *   * ** ****  ** ** 

consensus_10252#0      CATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAG 178
consensus_10252#1      CATCTTCTCCAGAGAAAGAGCTCGAACCTGGATTAAAACTTCTTGGAACTATTGAACAAG 420
consensus_10252#2      -----------AAATAATAACTCCTTACTGT-TTCTAACTTC-----ACCATTAGGGAAG 154
                                   *  ** * ***    ***  **  ******     ** ***    ***

consensus_10252#0      TGTTTTA-TTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTT 237
consensus_10252#1      TGTTTTA-TTCTGTACAGGATCTTTTTGTGCCAACAGACGACGGTCGTGAATCTCGGGTT 479
consensus_10252#2      TTATCAAGTTGAACACTGTTACGTTTAACAATGACGATAAACAATAATAATACACAGATA 214
                       *  *  * **    ** *   * ***       **     **  *  * *  * * * * 

consensus_10252#0      TTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTA 297
consensus_10252#1      TTCATTTCGTCAAGCTATGATGCTTCTACACATTTTGAGTCTACTTGTGCTGATGTTTTA 539
consensus_10252#2      GATAA---ACCAGTGCATAAAGCGG-TAAACTATCTTATTTTACTCATTTAATCACAAAA 270
                          *      **    ** * **   ** **  * * * * ****  *           *

consensus_10252#0      GATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAA-AGAGG--TAT 354
consensus_10252#1      GATTTGTATGAACGTGTAGTTGGAAAACCGTTTGAACTAAGTAAATTAA-AGAGG--TAT 596
consensus_10252#2      AATCTGGAACAATAGGAAACC--AAAATTGTATGAACGATACAAATAAAGAGACGACTGT 328
                        ** ** *  **   * *     ****  ** ***** *   **** ** *** *  * *

consensus_10252#0      GAAGA-GGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGA-AAAGTCTTCACGATAAAAAT--CTGATT 410
consensus_10252#1      GAAGA-GGTGAATGAATAACTCGGTTTCTGA-AAAGTCTTCACGATAAAAAT--CTGATT 652
consensus_10252#2      CAAGACGATCACAAGATTACTCGAGTTTTGTTAAAGTCTTTCTAATAACAGTAACCGTCA 388
                        **** * * *    ** *****  ** **  ********    **** * *  * *   

consensus_10252#0      ATCCTGCTTTAAAACAGATGTTATTTTCT-GTTGTCTACGTATTT-ATTCATCGTTGTTA 468
consensus_10252#1      ATCCTGCTTTAAA-CAGATGTTATTTTCT-GTTGTCTACGTATTT-ATTCATCGTTGTTA 709
consensus_10252#2      GTGCTTGCTTCAATCAATTTTTTCGCACTAGCTCTTCACAATTTTGATTAGTTGCCACTA 448
                        * **   ** ** **  * **     ** * * *  **   *** ***  * *    **

consensus_10252#0      GTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATTTATCTGTATGCTTTATTTTGTT 528
consensus_10252#1      GTTGTGTTATATATACTTTTGCAATCGCAATTTTTATCTATCTGTGTATTATTATTGTTT 769
consensus_10252#2      CCTTTAGTTCGTTAACTTTTTGTGTG---------------------------------- 474
                         * *  *   *  ******    *                                   

consensus_10252#0      TTGATTTTTATGTCAGTGGCATATTATTCAGTTTAAGTACACTTTTCTTAGTACTTTACA 588
consensus_10252#1      ATCGTCATTGT-TAAACGTAACAGTGT--------------------------------- 795
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      TCCTTTCAGGTTTTTCAAACTGATTTCACTCTCAGTCATTCTGAATTATGTTCTTTTTCA 648
consensus_10252#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      TTCCTTATTTGATTTCCAGGTTGAAATGTCAATGTGATATGCTTACTTTTTAATTTAATT 708
consensus_10252#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      TTCAGTTGCATAACGTTTTGCTTTAAATGTATAACTAACATAAATTACCTCACTAATTCT 768
consensus_10252#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      CTTATCTGATATATATCTTCAATATTTATGTTTTTCGTTTTAACTGATCTCCTAAGCTAT 828
consensus_10252#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      CTAACAAATTCAATGTATTTCCGGTGTTCAAATTGAAGTGGAAGTCTTTGTTTATCATGG 888
consensus_10252#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      TTCCATCTAACTCGTTGCAAATGTGATTTCATTTGTGTGTTTCTCGATTTATAGTGTGAT 948
consensus_10252#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10252#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10252#0      TTTTCCCTTAATAATAGTTTTAAGTTGAATTACAAAAAAAAAAAAAAAA 997
consensus_10252#1      -------------------------------------------------
consensus_10252#2      -------------------------------------------------