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Schistosoma mansoni
cluster # 10256 cluster # 10256       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10256#0 length = 461 sequences # 14  

consensusID : consensus_10256#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 461
fasta sequence
                              [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGNCNNCTTTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAAAAAAACGAAGACGTATTGGTGTTGGATCTACTGGATTTGTACGATTAGGAATGATGAGGCATTTATTCCTGATTATTGATCTATCACAAGCAATGAATGAACAAGATTTAAAACCGAATCGTTTAATATGTACTGTAAAAGCTGCTTGTACATTTGTTCGAGAATATTTCGATCAAAATCCTATCAGTCAATTAGGCATTATTGTCACTTCAGATCGAAGAGCTGA]

[-] EMBL CD199818             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTAC TTTTTATCTTCACATTCATGTCCACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD199858             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGATAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGAC   AGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGNCNNCTTTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAA                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD199912             [TCTTGTGATCTGTTGCATGGTTTTATGCTAATATATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCCTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD200005             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACCATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD199837             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD199877             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD071174             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD199926             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATATTCACATTCATGTCCACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD199892             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTCTATCTTCACATTCATGTCCAnt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD199948             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD199954             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD199965             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD200009             [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AW017198             [   TGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGACAACACTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAAAAAAACGAAGACGTATTGGTGTTGGATCTACTGGATTTGTACGATTAGGAATGATGAGGCATTTATTCCTGATTATTGATCTATCACAAGCAATGAATGAACAAGATTTAAAACCGAATCGTTTAATATGTACTGTAAAAGCTGCTTGTACATTTGTTCGAGAATATTTCGATCAAAATCCTATCAGTCAATTAGGCATTATTGTCACTTCAGATCGAAGAGCTGA]


>consensus_10256#0 TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTAC TTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAA TTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGA CGTTTGGTGNCNNCTTTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAAAAAAA CGAAGACGTATTGGTGTTGGATCTACTGGATTTGTACGATTAGGAATGATGAGGCATTTA TTCCTGATTATTGATCTATCACAAGCAATGAATGAACAAGATTTAAAACCGAATCGTTTA ATATGTACTGTAAAAGCTGCTTGTACATTTGTTCGAGAATATTTCGATCAAAATCCTATC AGTCAATTAGGCATTATTGTCACTTCAGATCGAAGAGCTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)