These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10256#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 461 fasta sequence [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGNCNNCTTTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAAAAAAACGAAGACGTATTGGTGTTGGATCTACTGGATTTGTACGATTAGGAATGATGAGGCATTTATTCCTGATTATTGATCTATCACAAGCAATGAATGAACAAGATTTAAAACCGAATCGTTTAATATGTACTGTAAAAGCTGCTTGTACATTTGTTCGAGAATATTTCGATCAAAATCCTATCAGTCAATTAGGCATTATTGTCACTTCAGATCGAAGAGCTGA] [-] EMBL CD199818 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTAC TTTTTATCTTCACATTCATGTCCACT ] [-] EMBL CD199858 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGATAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGAC AGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGNCNNCTTTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAA ] [-] EMBL CD199912 [TCTTGTGATCTGTTGCATGGTTTTATGCTAATATATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCCTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ] [-] EMBL CD200005 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACCATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ] [-] EMBL CD199837 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ] [-] EMBL CD199877 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ] [-] EMBL CD071174 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ] [-] EMBL CD199926 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATATTCACATTCATGTCCACT ] [-] EMBL CD199892 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTCTATCTTCACATTCATGTCCAnt ] [-] EMBL CD199948 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ] [-] EMBL CD199954 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACT ] [-] EMBL CD199965 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ] [-] EMBL CD200009 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ] [+] EMBL AW017198 [ TGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGACAACACTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAAAAAAACGAAGACGTATTGGTGTTGGATCTACTGGATTTGTACGATTAGGAATGATGAGGCATTTATTCCTGATTATTGATCTATCACAAGCAATGAATGAACAAGATTTAAAACCGAATCGTTTAATATGTACTGTAAAAGCTGCTTGTACATTTGTTCGAGAATATTTCGATCAAAATCCTATCAGTCAATTAGGCATTATTGTCACTTCAGATCGAAGAGCTGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||