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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10256#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 461 fasta sequence
[TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGNCNNCTTTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAAAAAAACGAAGACGTATTGGTGTTGGATCTACTGGATTTGTACGATTAGGAATGATGAGGCATTTATTCCTGATTATTGATCTATCACAAGCAATGAATGAACAAGATTTAAAACCGAATCGTTTAATATGTACTGTAAAAGCTGCTTGTACATTTGTTCGAGAATATTTCGATCAAAATCCTATCAGTCAATTAGGCATTATTGTCACTTCAGATCGAAGAGCTGA]
[-] EMBL CD199818 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTAC TTTTTATCTTCACATTCATGTCCACT ]
[-] EMBL CD199858 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGATAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGAC AGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGNCNNCTTTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAA ]
[-] EMBL CD199912 [TCTTGTGATCTGTTGCATGGTTTTATGCTAATATATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCCTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ]
[-] EMBL CD200005 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACCATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ]
[-] EMBL CD199837 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ]
[-] EMBL CD199877 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAG ]
[-] EMBL CD071174 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ]
[-] EMBL CD199926 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATATTCACATTCATGTCCACT ]
[-] EMBL CD199892 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTCTATCTTCACATTCATGTCCAnt ]
[-] EMBL CD199948 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ]
[-] EMBL CD199954 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACT ]
[-] EMBL CD199965 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ]
[-] EMBL CD200009 [TCTTGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCAnt ]
[+] EMBL AW017198 [ TGTGATTTGTTGCATGGTTTTATGCTAATAAATTAGCAGCGATTCTACATATACTACTTTTTTATCTTCACATTCATGTCCACTATGCTACATGACGGTGGTGGTGGTAAACGAGAATTCCGATGGGAATCAGGTTACGAAAAAACATGGAGTGCTATTCGTGAAGATGAATCAGGACGTTTGGTGACAACACTGGAACAGTTAATACACGATGCACATACACAAATAAGAAAAAAACGAAGACGTATTGGTGTTGGATCTACTGGATTTGTACGATTAGGAATGATGAGGCATTTATTCCTGATTATTGATCTATCACAAGCAATGAATGAACAAGATTTAAAACCGAATCGTTTAATATGTACTGTAAAAGCTGCTTGTACATTTGTTCGAGAATATTTCGATCAAAATCCTATCAGTCAATTAGGCATTATTGTCACTTCAGATCGAAGAGCTGA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||