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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10271#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 880 fasta sequence
[TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATGAAAATACTTTATTTGGTTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTTCTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGTTACATCACAACCATTATTGTTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGGAAGTCTTATAAGAAAGGAATGAGGGCGAAGAAATAAACTTTTCAATTTAGTCCTCGAAACTGAATCCGTG]
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[+] EMBL CD072964 [ AATACTTTATTGGGGTTATAAGTAAACACAGTTCTAAACTTTCTTCTAGAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGGTACATCACAACCATTATTGCTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATTAGTTAATCATAGTTTGGATTGAACTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTGGTCCATAATAACTTTCAACTGGAACAACATTTGGTTCAATTTTTCTATTACAATCTT ]
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[-] EMBL CD082399 [ GATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATCAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCGTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGGAAGTCTTATAAGAAAAGAATGAGGGCGAAGAAATAAACTTTTCAATTTA ]
[-] EMBL SM960 [ TCCAT ATG NTNCGA CCAAATGNCGTTTGTGTGCCCA AGATGCC AAATTGTCGTCCATAATAACCTCCAGCTGG ACCACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACCATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACCACACCATCCTGGTAGNCAATCATAATCAGCTACACATANATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCNTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCCAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTA TTCTCCT AAAACCACAGATCACAGTACTAGATACT AAATCTTAATTT ]
[-] EMBL CD078492 [ TAGTTTGCATTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCGTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGATGCATTCATACTCTTCTCAGCAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTAACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCCAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCTCAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAAGTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCG ]
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[-] EMBL CD077951 [ CACAGTCTTGTTACTGCTTGTACGCCCAAATTTNTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGTAAGTCTTATAAGAAAGGAATGAGGGCGAAGAAATAAACTTTTCAATTTATACCTCGAAACTGAATCCGTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||