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Schistosoma mansoni
cluster # 10281 cluster # 10281       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10281#0 length = 1105 sequences # 15  

consensusID : consensus_10281#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 1105
fasta sequence
                              [AATTCGGCACGAGGCGGCGGATCAATTGCACAGTCGACTTCCTGGTATATCAGAGACAGCAAAAATATTCGCAGGTGTTGATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAGTTATCCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATG-CAGCGAAC-AATG-CAAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGATGGTCCTACTCTCAAAGAGGGCTGTAAAAAAATGTATGATTTATATGCTTCTCGAATGAATGATTTAAAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA-GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT-CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAAATGTAAA----AAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD083932             [AATTCGGCACGAGGCGGCGGATCAATTGCACAGTCGACTTCCTGGTATATCAGAGACAGCAAAAATATTCGCAGGTGTTGATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD162196             [                                                                                ATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACCATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATATACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAGTTATCCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATG CAGCGAAC AATG CAAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD162226             [                                                                                ATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAGTTATCCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATG CAGCGAAC AATG CAAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD162156             [                                                                                ATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD162172             [                                                                                ATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGGTCCGGTTGCTAAGAAGGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD162162             [                                                                                ATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAAGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTTACGGGGCTTATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATCGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAAGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAGTTATTCAATTGCACAAATTCGGTTAGACATGTCAGCGAAC AATGCCAAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD162271             [                                                                                ATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAAGTTCAGAGTTAAAACCAAATACTGGAGAAGCCTTCATCGCTTACTATGAAAAACTTCCGACCGCAAATGGAAGGTATTCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATG CCACGAACAAATG  AAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD127506             [                                                                                               CCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAGTTATCCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATG CAGCGAAC AATG CAAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGATGGTCCTACTCTCAAAGAGGGCTGTAAAAAAATGTATGATTTATATGCTTCTCGAATGAATGATTTAAAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD142499             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAAAAAGATGTATGATTTATATGCTTCTCGAATGAATGATTTATAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AI976465             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATATGCTTCTCGAATGAATGATTTAAAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTAC                              ]
[+] EMBL AI111034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCT ATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACNCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAANAAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTTCCGATNTTACCTTTTTACACTATTTNCTTGTTGTTATAACTTATCTGT                                                                           ]
[+] EMBL AI110977             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCT ATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTANATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACA                                       ]
[-] EMBL AI395450             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAAATGTAAA    AAAAAAAAAAAAAA  ]
[-] EMBL AI976591             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAGCCTATTGATGGACAAAAACGCGAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAA                           ]
[-] EMBL AI394891             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTGGCG AAACCTACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAAATGTATACTTGAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_10281#0 AATTCGGCACGAGGCGGCGGATCAATTGCACAGTCGACTTCCTGGTATATCAGAGACAGC AAAAATATTCGCAGGTGTTGATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCA CTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGT TGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATC GGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCG TGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAA ACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAG TTATCCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATGCAGCGAACAATGCAAGAGTATGCTGCAGT ATTTCGTGATGGTCCTACTCTCAAAGAGGGCTGTAAAAAAATGTATGATTTATATGCTTC TCGAATGAATGATTTAAAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGA AGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGC CCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATT AGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAA ACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGT AATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTA TTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAAGAAC TTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTTCGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGT TATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACC AAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)