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Schistosoma mansoni
cluster # 10285 cluster # 10285       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10285#0 length = 458 sequences # 15  

consensusID : consensus_10285#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 458
fasta sequence
                              [CCTCCTCGAAAAGAAACCAGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT-GTTTC-ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGGAACAAATGAAGTAAAAAGTTAAAATGAGATGGAAGTAGATCTCACATATTAAAACAGAAAGAAAAATTGATAAAACGATAACTNTACTACTCA]

[-] EMBL CD143972             [CCTCCTCGAAAAGAAACCAGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[+] EMBL CD144030             [                 CAGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATG                                                                                              ]
[-] EMBL CD143958             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGGAAATAAACATGGTTTCAATAAGAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD144036             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCACATATAGAAACTGAAAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACATGGTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATCTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD144033             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAACAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD143996             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAGTAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD143991             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD143993             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD143997             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD144007             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD144014             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD143979             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAAT AACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[-] EMBL CD144006             [                  AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAACATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAA                                                                                                                ]
[-] EMBL CD144008             [                                         GGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG                                                                                             ]
[+] EMBL CD077167             [                                                          AGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGGAACAAATGAAGTAAAAAGTTAAAATGAGATGGAAGTAGATCTCACATATTAAAACAGAAAGAAAAATTGATAAAACGATAACTNTACTACTCA]


>consensus_10285#0 CCTCCTCGAAAAGAAACCAGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAG AAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGT AGTAACAATATTATCATGTATATAAACATGTTTCATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGT CTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGG TAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTAT ACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAA AATGGAACAAATGAAGTAAAAAGTTAAAATGAGATGGAAGTAGATCTCACATATTAAAAC AGAAAGAAAAATTGATAAAACGATAACTNTACTACTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)