cluster # 10306

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Schistosoma mansoni
cluster # 10306 cluster # 10306 Sequences # 15 consensus # 3

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consensus_10306#0 length = 799 sequences # 13

consensus_10306#1 length = 534 sequences # 1
consensus_10306#2 length = 240 sequences # 1

consensusID : consensus_10306#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 799
fasta sequence

                              [AAGNAATTTCGGCACGAGGACGCG-TAATAGAGGTTGGATAAGGTTCCTGGGATGTTTGGCGTTCTCGTTCGACGGCTAAGTACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC-GTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAACAACCAATTTAAAAAGTCATATA-GGTCGAATTTTGAAAGAT-AAAAAAAAATATATATATATATAGTTATATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACTATGTAATTAATAATAATAACCTTTGAAAAAACGT]

[+] EMBL CD080705             [AAGNAATTTCGGCACGAGGACCCG TAATAGAGGTTGGATAAGGTTCCTGGGATGTTTGGCGTTCTCGTTCGACGGCTAAGTACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC GTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAA                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD083642             [              CGAGG CGCGCTAATAGAGGTTGGATAAGGT  CTGGGATGTTTGGCGTTCTCGTTCGACGGCTAAGTACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAAACTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD079657             [                    gGCG TAATAGAGGTTGGATAAGGTTCCTGGGATGTTTGGCGTTCTCGTTCGACGGCTAAGTACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC GTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAAACACCAATTTAAAAAGTCATATA GGTCGAATTnt                                                                                                             ]
[+] EMBL AW017297             [                          gcacGAGGTTGGATAAGGTTCCTGGGATGTTTGGCGTTCTCGTTCGACGGCTAAGTACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATCGGTTTNGNTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAACAACCAATTTTAAAAGTCATATA GG                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD082404             [                              aaacTTGGATAAGGTTCCTGGGATGTTTGGCGTTTTCGTTCGACGGCTAAGTCCTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC GTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAAACACCAATNNTAAAAGTCATATANGGTCGAATTNTGAAAGATNAAANAAAAATATATATATATATAGTTATATATGAATATACATGGNATCATTTGACTTGGAGNCTACTATGTAATTAATAta                    ]
[-] EMBL CD132334             [                                                                                  ACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAGGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD132367             [                                                                                  ACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTTCAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAGGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD073917             [                                                                                                                                            GACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAAAAAGCATTAGATANAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC GTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAACAACCAATTTAAAAAGTCATATA GGTCGAATTTTGAAAGAT AAAAAAAAATATATATATATATAGTTATATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACGATGTAATTAATAATAATAACCTTTGAAAAAACGT]
[-] EMBL CD074630             [                                                                                                                                                                                                               TATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC GTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAACAACCAATTTAAAAAGTCATATA GGTCGAATTTTGAAAGAT AAAAAAAAATATATATATATATAGTTATATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACTATGTAATTAATAATAATTACCTTTGAAAAAACGT]
[+] EMBL AA559645             [                                                                                                                                                                                                                  TCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AA883028             [                                                                                                                                                                                                                    AATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGATGTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAG TATTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD076005             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGAATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTTTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTTTAGATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC GTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAACAACCAATTTAAAAAGTCATATA GGTCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAAAATATATATATATATAGTTATATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACTATGTAATTAATAATAA                  ]
[-] EMBL CD077297             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGTGAATGAAGCTCCGAAAAATTTATTTGTTATACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTTTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACCAATTATGACTGCCTATCCAGGTGAAGTTAACTGTACTGTCCGAACTGCAAAACCTTTAGATCAAACATTATAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTACAGTTAACTTTAAAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATC GTTTTGGTTATATGTCCATTGCTCGAAAGGTTCGCTCCCTTCGCGGAAAAATGGAACAACCCATTTTAAAAGTCATATA GGTCGAATTTTGAAAGAT AAAAAAAAATATATATATATATAGTTATATATGAATATACATTGGATCCTTTGACTTGTAGTCTACTATGTAATTAAGGATA                   ]




>consensus_10306#0
AAGNAATTTCGGCACGAGGACGCGTAATAGAGGTTGGATAAGGTTCCTGGGATGTTTGGC
GTTCTCGTTCGACGGCTAAGTACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTT
CAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAA
AAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGAT
GTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGA
ATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAAGCTACGAAAAATCTATTTGTTATA
CTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAAATT
ATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAGATAAA
ACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAAAATTA
CAGTTAACTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGAT
CGTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGAACAA
CCAATTTAAAAAGTCATATAGGTCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAAATATATATATATAT
AGTTATATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACTATGTAATTAATAATA
ATAACCTTTGAAAAAACGT

consensusID : consensus_10306#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 534
fasta sequence

                              [CTTCTTAAACTGTTTGGCCATGGGGGAAGCAGATTTCTCCCTGCGAGCTCGTCTACTTCTACGAGGGGGAAAGCTATAGATGGGGAAGATGAGGGACGGTCCATTTTCACAATACCTTCATCGCTGGGCCGAACGTTCAGATACATTTTCCGTAACTGCGGGATCTGCGGTTTAACCTTTTCATCGAACAGCCCCACCAGCGCATTTTTCCTAGCATTAGATGGGAAATCGACATTATTTTCTACCAATATCCTCCTCAAAGTCGCAACTTTCATTGAATTCGGATCAAAACCGTCCTCGTGCCGAATTCGGCAAGCCTTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATCGTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGACAACCAATTTAAAAGTCATATAGGTCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAATATATATATATATAGTTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACTA]

[+] EMBL BE431280             [CTTCTTAAACTGTTTGGCCATGGGGGAAGCAGATTTCTCCCTGCGAGCTCGTCTACTTCTACGAGGGGGAAAGCTATAGATGGGGAAGATGAGGGACGGTCCATTTTCACAATACCTTCATCGCTGGGCCGAACGTTCAGATACATTTTCCGTAACTGCGGGATCTGCGGTTTAACCTTTTCATCGAACAGCCCCACCAGCGCATTTTTCCTAGCATTAGATGGGAAATCGACATTATTTTCTACCAATATCCTCCTCAAAGTCGCAACTTTCATTGAATTCGGATCAAAACCGTCCTCGTGCCGAATTCGGCAAGCCTTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTATCGGTGATCGTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAATGGACAACCAATTTAAAAGTCATATAGGTCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAATATATATATATATAGTTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACTA]




>consensus_10306#1
CTTCTTAAACTGTTTGGCCATGGGGGAAGCAGATTTCTCCCTGCGAGCTCGTCTACTTCT
ACGAGGGGGAAAGCTATAGATGGGGAAGATGAGGGACGGTCCATTTTCACAATACCTTCA
TCGCTGGGCCGAACGTTCAGATACATTTTCCGTAACTGCGGGATCTGCGGTTTAACCTTT
TCATCGAACAGCCCCACCAGCGCATTTTTCCTAGCATTAGATGGGAAATCGACATTATTT
TCTACCAATATCCTCCTCAAAGTCGCAACTTTCATTGAATTCGGATCAAAACCGTCCTCG
TGCCGAATTCGGCAAGCCTTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTA
GTATCGGTGATCGTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAA
TAATGGACAACCAATTTAAAAGTCATATAGGTCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAATATAT
ATATATATAGTTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTCTACTA

consensusID : consensus_10306#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 240
fasta sequence

                              [TCCGTGTTATTTTGTGAGAGAACCCTCCGTTTTCGGGGGTATGGAGTTAATACGGGAACGTTTGTTGATTGGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGGATAGTGGGACAACCAATTTAAAAAGTCATTATAGGCCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAAATATATATATATATAGTTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTTCTACTATGTAATTAATAATAA]

[-] EMBL AI820445             [TCCGTGTTATTTTGTGAGAGAACCCTCCGTTTTCGGGGGTATGGAGTTAATACGGGAACGTTTGTTGATTGGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGGATAGTGGGACAACCAATTTAAAAAGTCATTATAGGCCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAAATATATATATATATAGTTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTTCTACTATGTAATTAATAATAA]




>consensus_10306#2
TCCGTGTTATTTTGTGAGAGAACCCTCCGTTTTCGGGGGTATGGAGTTAATACGGGAACG
TTTGTTGATTGGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGGATAGTGGGACAACCA
ATTTAAAAAGTCATTATAGGCCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAAATATATATATATATAG
TTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTTCTACTATGTAATTAATAATAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10306#0      AAGNAATTTCGGCACGAGGACGCGTAATAGAGGTTGGATAAGGTTCCTGGGATGTTTGGC 60
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10306#0      GTTCTCGTTCGACGGCTAAGTACTTCTACTCCGGTGTTGGCACTTATACAGCCTCCTGTT 120
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10306#0      CAAGTGTTCGGTCTAGAAGGACGTTATGCTTCTGCTTTATATTCAGCTGCTACAAAACAA 180
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10306#0      AAAGCATTAGATAAAATCGAAAAAGATATTCAATTAATTAAGAATACACTTAAAAAAGAT 240
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      --------------------------------CTTCTTAAACTGTTTGGCCATGGGGGAA 28
                                                                                   

consensus_10306#0      GTGAAATTACATGAATTTTGTCTTGATCCAAGTTTACAAAGAGCAACTAAAATTAATGGA 300
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      GCAGATTTCTCC---CTGCGAGCTCGTCTACTTCTACGAGGGGGAAA-GCTATAGATGGG 84
                                                                                   

consensus_10306#0      ATTGGTCAAGCATTAGACAAATTAAAAGTGAATGAA--GCTACGAAAAATCTATTTGTTA 358
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      GAAGATGAGGGACGGTCCATTTTCACAATACCTTCATCGCTGGGCCGAACGT-TCAGATA 143
                                                                                   

consensus_10306#0      TACTTGCTGAAAACGGTCGTTTGTCTAAAATTAATTCAGTTATTGACAAATTTGAACAA- 417
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      CATTTTCCGTAACTGCGGGATCTGC--GGTTTAACCTTTTCATCGAACAGCCCCACCAGC 201
                                                                                   

consensus_10306#0      --ATTATGACTGCCTATCGAGGTGAAGTTAACTGTACTGTACGAACTGCAAAACCTCTAG 475
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      GCATTTTTCCTAGCATTAGATGGGAAATCGACATTATTTT-----CTACCAATATCCTCC 256
                                                                                   

consensus_10306#0      ATAAAACATTAGAAAATGAATTACGGAATGCCCTTAATGGATTTTTAAAACCTGGCGAAA 535
consensus_10306#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10306#1      TCAAAG---TCGCAACTT--TCATTGAATTCGGATCAAAACCGT------CCTCGTGCCG 305
                                                                                   

consensus_10306#0      AATTACAGTTAAC--TTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTAT 593
consensus_10306#2      --TCCGTGTTATT--TTGTGAGA--GAACCCTCCGTTTTCGGGGGTATGG-AGTTAATAC 53
consensus_10306#1      AATT-CGGCAAGCCTTTTAGAGATCGATCCATCGATTATTGGTGGTATGGTAGTTAGTAT 364
                         *    *  *    **  ****  ** ** **  ** * ** ******* ***** ** 

consensus_10306#0      CGGTGATCGTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAAT 653
consensus_10306#2      GG--GAACGTTT-GTTGATTGGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGGATAGT 110
consensus_10306#1      CGGTGATCGTTTTGTTGATATGTCAATTGCTCGAAAGGTTCGCTCACTTCGCGGAATAAT 424
                        *  ** ***** ******  ********************************* *** *

consensus_10306#0      GGAACAACCAATTTAAAAAGTCAT-ATAGGTCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAAATATAT 712
consensus_10306#2      GGGACAACCAATTTAAAAAGTCATTATAGGCCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAAATATAT 170
consensus_10306#1      GG-ACAACCAATTTAAAA-GTCAT-ATAGGTCGAATTTTGAAAGATAAAAAAAA-TATAT 480
                       ** *************** ***** ***** *********************** *****

consensus_10306#0      ATATATATAGTTATATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGT-CTACTATGTAA 771
consensus_10306#2      ATATATATAGTTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGTTCTACTATGTAA 230
consensus_10306#1      ATATATATAGTTACATATGAATATACATTGGATCATTTGACTTGTAGT-CTACTA----- 534
                       ************* ********************************** ******     

consensus_10306#0      TTAATAATAATAACCTTTGAAAAAACGT 799
consensus_10306#2      TTAATAATAA------------------ 240
consensus_10306#1      ----------------------------