cluster # 10310

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Schistosoma mansoni
cluster # 10310 cluster # 10310 Sequences # 15 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_10310#0 length = 1188 sequences # 14

consensus_10310#1 length = 384 sequences # 1

consensusID : consensus_10310#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1188
fasta sequence

                              [TGAAACACAGATACGCTTGACTATCGAACGTATTCTGACCAACATTTCTAACGGAACCTATCGTCCTCACGAATATAGTCCGTGGGGTTTTCTCGAACGTCTTAATGCTTATTTGACACGCCAAAATATCTGCGCCACACCTTTTTACAAAAACTTGATCCAGTCTCCACTGCCGATAGCAAAAGCTGACGCGCCTCCTAAATTTAACTACCTAGATGTCCCTGGCATTGCTGTTTCATGGCCTCCAGCATCAAGTTTAAAGGTAGTTTTGGGGTCTCGTGGTAAATCTTGTGCAGATGTGTGTATGAATCTGGGAACTTCAGAACATACTTTAT-TACTGCCTTCCAATATTTCTGCTTACTCCATTCTTAACAAAACGCAACATCAACAAATACAGAATGGTTACATTTACTATCGTTCTATTCACTCTACGCCTTCGCCAAACCTGTCTTATCTTTATACGTTTCGCTGTTCTCCAGAACATTTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAATATTACCTACACAACTAGTCCAATGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGTTTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCCTTGGTGGATCTGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTGTGTGTTAGG-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCATGCAGCTGCATTACCGTAC]

[+] EMBL CD133040             [TGAAACACAGATACGCTTGACTATCGAACGTATTCTGACCAACATTTCTAACGGAACCTATCGTCCTCACGAATATAGTCCGTGGGGTTTTCTCGAACGTCTTAATGCTTATTTGACACGCCAAAATATCTGCGCCACACCTTTTTACAAAAACTTGATCCAGTCTCCACTGCCGATAGCAAAAGCTGACGCGCCTCCTAAATTTAACTACCTAGATGTCCCTGGCATTGCTGTTTCATGGCCTCCAGCATCAAGTTTAAAGGTAGTTTTGGGGTCTCGTGGTAAATCTTGTGCAGATGTGTGTATGAATCTGGGAACTTCAGAACATACTTTAT TACTGCCTTCCAATATTTCTGCTTACTCCATTCTTAACAAAACGCAACATCAACAAATACAGAATGGTTACATTTACTATCGTTCTATTCACTCTACGCCTTCGCCAAACCTGTCTTATCTTTATACGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD200606             [    ACACAGATACGCTTGACTATCGAACGTATTCTGACCAACATTTCTAACGGAACCTATCGTCCTCACGAATATAGTCCGTGGGGTTTTCTCGAACGTCTTAATGCTTATTTGACACGCCAAAATATCTGCGCCACACCTTTTTACAAAAACTTGATCCAGTCTCCACTGCCGATAGCAAAAGCTGACGCGCCTCCTAAATTTAACTACCTAGATGTCCCTGGCATTGCTGTTTCATGGCCTCCAGCATCAAGTTTAAAGATAGTTTTGGGGTCTCGTGGTAAATCTTGTGCAGATGTGTGTATGAATCTGGGAACTTCAGAACATACTTTAT TACTGCCTTCCAATATTTCTGGTTACTCCATTCTCAACAAAACGCAACATCTACAAATACAGAATGGTTTCATTTACTATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD078546             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACATACTTTATNTACTGCCTTCCAATATTTCTGCTTACTCCATTCTTAACAAAACGCAACATCAACAAATACAGAATGGTTACATTTACTATCGTTCTATTCACTCTACGCCTTCGCCAAACTTGTCTTATCTTTATACGTTTCGCTGTTCTCCAGAACATTTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAATATTACCTACACAACTAGTCCAATGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGTTTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCCTTGGTGGATCTGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACAATCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAANAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTT                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD073013             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGCAAGATCATGTG TTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCCTTGGTGGATCTGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACAATCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI067969             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGATCATGTGTTTTTCAAGCTCGTAATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCTTCGGTGAATCTGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI975999             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCCTTGGTGGATCTGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI067237             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCCTTGGTGGATCTGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL BF936641             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCCTTGGTGGATCTGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI067239             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCAGATTTCGATATGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTGTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGTTACATTCATACTTTCACCTTACCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTAGTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATGTAAATGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATCTACTATTAACTGCATTGTAATGATGTATTTGCTTCCTATAAATTCTAGGATACAATACTTTTGTTTGATAAAGATTTTGTTCATTCAGATTTTTGCATATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTACATATTTGTTCATATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATACTATTGTGTGTTAGG AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCATGCAGCTGCATTACCGTAC]
[-] EMBL AI975534             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI067434             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCTATTCGTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI976083             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAAGCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI067324             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTG                                                           ]
[-] EMBL AI067670             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATAAATCGTATTATGTACTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTGTGTGTTAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCATGCAGCTGCATTACCGTAC]




>consensus_10310#0
TGAAACACAGATACGCTTGACTATCGAACGTATTCTGACCAACATTTCTAACGGAACCTA
TCGTCCTCACGAATATAGTCCGTGGGGTTTTCTCGAACGTCTTAATGCTTATTTGACACG
CCAAAATATCTGCGCCACACCTTTTTACAAAAACTTGATCCAGTCTCCACTGCCGATAGC
AAAAGCTGACGCGCCTCCTAAATTTAACTACCTAGATGTCCCTGGCATTGCTGTTTCATG
GCCTCCAGCATCAAGTTTAAAGGTAGTTTTGGGGTCTCGTGGTAAATCTTGTGCAGATGT
GTGTATGAATCTGGGAACTTCAGAACATACTTTATTACTGCCTTCCAATATTTCTGCTTA
CTCCATTCTTAACAAAACGCAACATCAACAAATACAGAATGGTTACATTTACTATCGTTC
TATTCACTCTACGCCTTCGCCAAACCTGTCTTATCTTTATACGTTTCGCTGTTCTCCAGA
ACATTTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAA
TATTACCTACACAACTAGTCCAATGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGT
TTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTGTACTGCTTCAGGATCCCTTGGTGGATCTGA
TGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTATGTTC
TAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTATAAAA
GCTACATTCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTACTTTCT
TTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATCGAAAAG
CATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCATTTTAA
TTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGTTTTTGT
TCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTATTCTTAT
TTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTGTGTGTTAGGA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCATGCAGCTGCATTACCGTAC

consensusID : consensus_10310#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 384
fasta sequence

                              [TTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAATATTACCTACACAACTAGTCCAACGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGTTTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTCGTACTGCTTACGGGATGCCCCATGGTGGATCTCGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGAAGCTCTTCCTAACCCTGGCATTGATGTTTCATGGCCTGCAGCATCAAGTTTAAACATAGTTTTGGGGTCTAGTGGTAAATACAGCGCAGAGGTGTTGTACGAATACGGTAACCTAAGGACAATCATCAACTAAGCCTTCAGAATTTTGGGGTTTCTCCACTCATAACAAAACG]

[-] EMBL CD202244             [TTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAATATTACCTACACAACTAGTCCAACGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGTTTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTCGTACTGCTTACGGGATGCCCCATGGTGGATCTCGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGAAGCTCTTCCTAACCCTGGCATTGATGTTTCATGGCCTGCAGCATCAAGTTTAAACATAGTTTTGGGGTCTAGTGGTAAATACAGCGCAGAGGTGTTGTACGAATACGGTAACCTAAGGACAATCATCAACTAAGCCTTCAGAATTTTGGGGTTTCTCCACTCATAACAAAACG]




>consensus_10310#1
TTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAATATT
ACCTACACAACTAGTCCAACGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGTTTTT
CAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTCGTACTGCTTACGGGATGCCCCATGGTGGATCTCG
ATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGAAGCTCTTCCTAACCCTGGCATTGATGTTT
CATGGCCTGCAGCATCAAGTTTAAACATAGTTTTGGGGTCTAGTGGTAAATACAGCGCAG
AGGTGTTGTACGAATACGGTAACCTAAGGACAATCATCAACTAAGCCTTCAGAATTTTGG
GGTTTCTCCACTCATAACAAAACG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10310#0      TGAAACACAGATACGCTTGACTATCGAACGTATTCTGACCAACATTTCTAACGGAACCTA 60
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      TCGTCCTCACGAATATAGTCCGTGGGGTTTTCTCGAACGTCTTAATGCTTATTTGACACG 120
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      CCAAAATATCTGCGCCACACCTTTTTACAAAAACTTGATCCAGTCTCCACTGCCGATAGC 180
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      AAAAGCTGACGCGCCTCCTAAATTTAACTACCTAGATGTCCCTGGCATTGCTGTTTCATG 240
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      GCCTCCAGCATCAAGTTTAAAGGTAGTTTTGGGGTCTCGTGGTAAATCTTGTGCAGATGT 300
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      GTGTATGAATCTGGGAACTTCAGAACATACTTTATTACTGCCTTCCAATATTTCTGCTTA 360
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      CTCCATTCTTAACAAAACGCAACATCAACAAATACAGAATGGTTACATTTACTATCGTTC 420
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      TATTCACTCTACGCCTTCGCCAAACCTGTCTTATCTTTATACGTTTCGCTGTTCTCCAGA 480
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      ACATTTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAA 540
consensus_10310#1      ----TTTCCAAGTGTTAATCATCGACTAAACCTTCAGTATCTGGGTGTTTCTTGTCCTAA 56
                           ********************************************************

consensus_10310#0      TATTACCTACACAACTAGTCCAATGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGT 600
consensus_10310#1      TATTACCTACACAACTAGTCCAACGGCACCATATTGGGACGACGCAGCAAGATCATGTGT 116
                       *********************** ************************************

consensus_10310#0      TTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACT-GTACTGCTT-CAGGAT--CCCTTGGTGGAT 656
consensus_10310#1      TTTTCAAGCTAGTAATGAATGGTTTGACTCGTACTGCTTACGGGATGCCCCATGGTGGAT 176
                       ***************************** ********* * ****  *** ********

consensus_10310#0      CT-GATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGATGCTCTTCCTAACCAGATTTCTTTA 715
consensus_10310#1      CTCGATGGATTTTCTCGTTTTTGTCCTTGTCGTGAAGCTCTTCCTAACCCTGGCA-TTGA 235
                       ** ******************************** *************       ** *

consensus_10310#0      TGTTCTAACTGTTTGTGACAAAATATTCTATTCCTTAATGATAACATGTGTAGGAAATTA 775
consensus_10310#1      TGTT-TCATGGCCTGCAGCATCAAGTTTAAA--CATAGTTTTGGGGTCTAGTGGTAAATA 292
                       **** * *  *  **   **  *  **  *   * ** *  *    * *   ** ** **

consensus_10310#0      TAAAAGCTACAT-TCATACTTTCACCTTTCCGTACGGTTGTATATAAATCGTATTATGTA 834
consensus_10310#1      CAGCGCAGAGGTGTTGTACGAATACGGTAACCTAAGGACAATCATCAACTAAGCCTT-CA 351
                        *      *  * *  ***    **  *  * ** **      ** **        *  *

consensus_10310#0      CTTTCTTTAACATTTTAAGTGTACGGTGAATTACTGAATATTTAATTGTTATTTTCTATC 894
consensus_10310#1      GAATTTTGGGGTTTCTCCACTCATAACAAAACG--------------------------- 384
                          * **     ** *      *     **                              

consensus_10310#0      GAAAAGCATTTTACCCACTTCAGTCTATAAGATTGATTAATATATTTACTATTAACTGCA 954
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      TTTTAATTTTGTATTTACTTCCTATAAATTCTAGTTTACAATATTTTTCTTTTCTAAAGT 1014
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      TTTTGTTCCTTCAGATTTTTGCTTATAAGAATTTAATTTAAAATTTCTTTCTATATTTAT 1074
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      TCTTATTTTCATGCTTGTACAACGTATTTTCGAAAGGTATGAAAATAATATTATTGTGTG 1134
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10310#0      TTAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCATGCAGCTGCATTACCGTAC 1188
consensus_10310#1      ------------------------------------------------------