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Schistosoma mansoni
cluster # 10323 cluster # 10323       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10323#0 length = 1058 sequences # 15  

consensusID : consensus_10323#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 1058
fasta sequence
                              [TAGTGGTAACGATGGGGCGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTGTCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATTATTCAGTCGGTGCCTCTGTAGGTTTCACCAAAAAGGAGTTCGCTTGGTTCGTAAATACATCTGTCAAATACAGT]

[+] EMBL CD095019             [TAGTGGTAACGATGGGGCGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD179034             [TAGTTGTAACGATGGGGCGTGTTGGCGTCTCTATTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTATTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAATAGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTTATTAAAAATCTAAACGTCGTACGGCTTACCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATTGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTCTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTTCTAGCCCTTTGGATGCTGTATCTAAGCGCCTTANAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTNTATAGCAATTCTTTTGTCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGACAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD114275             [                 CGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCANGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD114235             [                 CGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCGATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD094663             [                                                                                                                                                          ATTAATAGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTTATTAAAAATCTAAACGTCGTACGGCTTACCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATTGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTCTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTTCTAGCCCTTTGGATGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTGTCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGACAAAATAGGAATGTGGTTGTTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD068728             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCC CAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTATACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD178910             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTCATTCCTGTCGAGTTTTCCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD095317             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCCCTACTGAAAGATGATGACTTC                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD200958             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatTTTATCATATTATCTTAGGGATATCTTACTTGTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTGGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCTTATTCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCCAACTGCACCCCTTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD114283             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD125133             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCCCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTATCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATT                                                                          ]
[-] EMBL CD114092             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAAGTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCAATACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD095049             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTACACTGGCACTATCAGTCNCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTACATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCACAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTGCAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTC                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD119036             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTACATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCACAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTGTCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATTATTCAGTCGGTGCCTCTGTAGGTTTCACCAAAAAGGAGTTCGCTTGGTTCGTAAATACATCTGTCAAATACAGT]
[-] EMBL CD119285             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCACAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTGTCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATTATTCAGTCGGTGCCTCTGTAGGTTTCACCAAAAAGGAGTTCGCTTGGTTCGTAAATACATCTGTCAAATACAGT]


>consensus_10323#0 TAGTGGTAACGATGGGGCGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCT TAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATA GTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAG ACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACA AATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCA CAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAA AGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTA TAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTG ATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTG TAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACT ATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGA TTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTT TCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGT CGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATT CTCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTGTCTGGAT TATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATC TGCTCAATTTTTCTATTTCCAATTATTCAGTCGGTGCCTCTGTAGGTTTCACCAAAAAGG AGTTCGCTTGGTTCGTAAATACATCTGTCAAATACAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)