cluster # 10334

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10334 cluster # 10334 Sequences # 15 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10334#0 length = 548 sequences # 15
consensusID : consensus_10334#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 548
fasta sequence
                              [CTTNTTTNGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG--AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTGAAGTTAACCAAAAAGTCTACATTTCTACCATCGATTTCCTTCTTCTTATTCTTTGGTATAGTATATTTGTATTTAATAATAATAATAATAAT]

[-] EMBL CD185561             [CTTNTTTNGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG  AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[+] EMBL CD185190             [                 TAGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAGA AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTNCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTnt                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD131564             [                 TAGTCCTCGTATCCTGTCCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAAGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAGAAAAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTNTTTCCAGTTAAngt                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD185095             [                  AGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG  AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGATCCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[-] EMBL CD133823             [                  AGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG  AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[-] EMBL CD133720             [                  AGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG  AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[-] EMBL CD131569             [                  AGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAAGTAATGAACTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAGA AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTT  CACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[-] EMBL CD185192             [                  AGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG  AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTCTCCCCTTTCATATTGTTATTGCTCTTATCATCGAACCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD133894             [                  AGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG  AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD131387             [                  AGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATTCGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAAGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAGA AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATACTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[+] EMBL AI068243             [                                                                        ACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAACGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAG  AAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTTTCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTGAAGTTAACCAAAAAGTCTACATTTCTACCATCGATTTCCTTCTTCTTATTCTTTGGTATAGTATATTTGTATTTAATAATAATAATAATAAT]
[-] EMBL CD185388             [                                                                                                                                                        AAAATAATAATTCCCCCTGCGCTCACATATTTTGTGTCCC  CTCTCACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTCTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[-] EMBL CD131438             [                                                                                                                                                                                                                                      AATTATGTTTCTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[-] EMBL CD131403             [                                                                                                                                                                                                                                      AATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCTTTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTTATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCTAATTATTCG AAAAAAGGAACTTCTG                                                                                            ]
[-] EMBL CD133861             [                                                                                                                                                                                                                                      AATTATGTTTTTCCAGTTAAGTTTAATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTCATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCATCTTGATGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTATCATCGAACCT                                                                                                                      ]




>consensus_10334#0
CTTNTTTNGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGTTCTCTTTTCGTTTGTTTGTTCATATT
CGTAAAAAATCTACTTGTAAGTGAGGTAATGAATTCAGAAAAGCATTTTCAGAGTAAAAA
CGTAACTATTAGAGTGCTATTTGAAGAAAAAAAATTATAATTCCCTTTGCTTTCATATTT
TCTGTCTCCCTTCACACACACACACACACACTTTTTTTGTTCAATGTTAATTATGTTTTT
CCAGTTAAGTTTGATCTTGTTTCAATCGTTTTCATTTTATTATTGTTTAATCATACTTTC
ATTGTCCTATTTATTGTTGTAAAATGATTAATATTTGTATAGTTTTCTTTTATTGTTCAT
CTTGTTGGTTGAATGGTTCTAAATAATTCTTTTCCCCTTTCATATTGTTATTGTTCTTAT
CATCGAACCTAATTATTCGAAAAAAAGGAACTTCTGAAGTTAACCAAAAAGTCTACATTT
CTACCATCGATTTCCTTCTTCTTATTCTTTGGTATAGTATATTTGTATTTAATAATAATA
ATAATAAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case