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Schistosoma mansoni
cluster # 10340 cluster # 10340       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10340#0 length = 783 sequences # 15  

consensusID : consensus_10340#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 783
fasta sequence
                              [GGCCANAATTTGGCACGAGGCCGGGCGTAAATAGTGTA-GCTGCTA-ACG-TATTCAACCAAATTGACAGG-AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC-GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC-AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC-AACAACANCNNAC-AC-AAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA-AAAA--CCG-AA-GTAT-G--AACATTATGT-ATACCT-AATAT-AATGATTGTGAATTG-TTTTGTATGAATACA--TNTTCTGTAAT]

[+] EMBL CD079632             [GGCCANAATTTGGCACGAGGCCGGGCGTGAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC AACAACANCNNAC AC AAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA ANNA  CCG AA GTAT G  AACATTATGT ATACCT  ATAT AATGANTGTGAAATG  TTTGTATG ATACA  TNTTCTGT   ]
[+] EMBL CD082377             [                        GCGTGAATATTGTANGCTGCTA ACGATTTTCAACCAAATTGACAGGCAACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAACNNAC ACANCNNAC AC AAGTCTTTTTCTGTCTAGAG AAACANAAAC  CCG AANGTAT GGAAACA TATGT ATACCTAAATAT AATGA TGNGAATNG TTTTGTATGAATACA             ]
[+] EMBL CD161683             [                            AAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC GACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD161653             [                            AAATAGTGTA GCTGGTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAACATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD161674             [                            AAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD161689             [                            AAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD161708             [                            AAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD161719             [                            AAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD161754             [                            AAATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD161707             [                             AATAGTGTA GCTGGTATACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTCGAACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD161768             [                             AATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD161729             [                             AATAGTGTA GCTGCTA ACG TATTCAACCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGC GAATTACAACAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAGATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD179563             [                             AATAGTGTA GCTGTTA ATG TATTCAATCAAATTGACAGG AACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGCAGAATTACAGCAGGCACTATCCAACGGATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACTATTGAAATGATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD073895             [                                                                                                                                                                                                              TCTGTGAATTCTCTC AACTATTTGAGTACGTACAACAGTGGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC AACAACAAC AACAACAAAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA AAAAACCCGAAA GTATGG  AACATTATGTAATACCT AATATAAATGATTGTGAATTGTTTTTGTATGAATACAATTTTTCTGTAAT]
[-] EMBL CD075978             [                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGTTTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAGTTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCATGCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAATGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAGTTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAAGATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATTATCAAC AACAACAAC AACAACAAAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACA AAAAACCCGAAA GTATGG  AACATTATGTAATACCT AATATAAATGATTGTGAATTGTTTTTGTATGAATACAa            ]


>consensus_10340#0 GGCCANAATTTGGCACGAGGCCGGGCGTAAATAGTGTAGCTGCTAACGTATTCAACCAAA TTGACAGGAACAGAAGTGGATCCATATGTGCAAGCGAATTACAACAGGCACTATCCAACG GATTGGGTACATCATTCAATATTAAAACGATTGAACTGATGATATGTATGTTTGACAAAG ATATGAATGGCACTATAAATATCTGTGAATTCTCTCAACTATTTGAGTACGTACAACAGT GGCAACAATGTTTTCGATCATATGACAGAGATAGGTCTGGTACAATTGACTGTCGAGAGT TTCATACTGCTTTAACAAGCTTTGGTTATCGATTGTCTCCAGATTTTTCACAATTTTTAG TTAGAAAATTCGACAAACAACGTCGCGGATCAGTAGGATTTGATAATTTCATCTTGGCAT GCGTCTGTTTAAAGAATTTAACTGATGTATTCAGACCATATGATTATCAAAGAAATGGAA TGGCACAACTTAGTTATGAACAATTTTTAACTGCTGCTTTCAGTGTAGTTAGTTAATTAG TTAATTCAATATATTACAATGTTGACTATTATCCATATCTCTTCTTATTTAAGATTATAA GATATTAATTATTAACTTAATCTGTACCTGATAAGCATTAACTTCTATATGACCCATATT ATCAACAACAACANCNNACACAAGTCTTTTCTTGTCTAGAGAAAACAAAAACCGAAGTAT GAACATTATGTATACCTAATATAATGATTGTGAATTGTTTTGTATGAATACATNTTCTGT AAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)