cluster # 10345

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Schistosoma mansoni
cluster # 10345 cluster # 10345 Sequences # 15 consensus # 2

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consensus_10345#0 length = 855 sequences # 9

consensus_10345#1 length = 588 sequences # 6

consensusID : consensus_10345#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 855
fasta sequence

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[+] EMBL CD080100             [GCGGAACACTGAAAATACGAAGTCATGGTTGTGGATGTTTATATATCATCAACCTCAGGAAATACAAAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGCGCAGCCAAGATACCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCTCTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACC TCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTATAATCTTGTACGTTCACTTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTAACTTGGCNATATCTTCTCTTGCTT ATTATCTCAGTATTTTAATC ATGGTACTACTTG GGTTGCCTAACTGGTTTT NTTTCCG TTCT AACAGC TTCT ACTAT AAC GACT AT GGTG TCAC ATAG TATTAATTGGGGAAGTGATCTTTTGGTAAAATATCTTTTATTATCNAACTGGTTATATTATTCGTAT]
[+] EMBL CD078372             [         TGAAAATACGAAGTCATGGTTGTGGATGTTTATATATCATCAACCTCAGGAAATACAAAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGCGCAGCCAAGATACCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCTCTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATT  TATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTC CCCACTAAATCTATAAAGGGAAATGTAACCCCCCCTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTTCTTTTGTATCCCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD078602             [         TGAAAATACGAAGTCATGGTTGTGGATGTTTATATATCATCAACCTCAGGAAATACAAAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGTGCAGCCAAGATACCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCTCTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACC TCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGGTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTNTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTATAATCTTGTACGTTCACTTGATA                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD078286             [         TGAAAATACGAAGTCATGGTTGTGGATGTTTATATATCATCAACCTCAGGAAATACAAAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGCGCAGCCAAGATACCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCTCTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATT  TATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACC TCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGGTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTNTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTATAATCTT                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD078069             [                        ggGGATGTGGATGTTTATATATCATCAACCTCAGGAAATACACAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGCGCAGCCAAGATACCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCTCTCGAAGAAAACGGG AAACAGTAATAGCTCCTCAGCTNTTTCTTGGATCGG ATACCTA GGGATTATGATG ATTTATTC AGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD066229             [                                                                CAAAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGCGCAGCCAAGATACCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCTCTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACC TCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCCTTGTTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCGGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTATAATCTTGTACGTTCACTTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTAACTTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTATCTCAGNATTTTAATCAATGTAACTACTTGNGTTTGCCTACTTGNTTTTGNTTTCCGTTTCTAAACAGCTTTCTAACTATAAACGGACTAATGGGTGATCACAATAGTTATTTATa                                                           ]
[-] EMBL CD069596             [                                                                                                                                                                  CAATTTATGTTCAAGGCTCTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACC TCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCCTTTGCTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD069352             [                                                                                                                                                                                                                  atgcccCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACC TCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD134643             [                                                                                                                                                                                                                               TTGGATCGGAATACCTAGGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAACTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACC TCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTATAATCTTGTACGTTCACTTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTAACTTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTATCTCAGTATTTTAATCAATGTAACTACTTGTGTTTGCCTACTTGTTTTTGTTTTCCGTTTCTAAACAGC TTt                                                                                                      ]




>consensus_10345#0
GCGGAACACTGAAAATACGAAGTCATGGTTGTGGATGTTTATATATCATCAACCTCAGGA
AATACAAAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGCGCAGCCAAGATA
CCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCT
CTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTA
GGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAA
CTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATAT
GATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTT
GTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCAT
TTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGTTATT
CTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTAT
AATCTTGTACGTTCACTTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTA
ACTTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTATCTCAGTATTTTAATCAATGTAACTACTTGN
GTTTGCCTACTTGGTTTTGNTTTCCGTTTCTAAACAGCTTCTACTATAACGACTATGGTG
TCACATAGTATTAATTGGGGAAGTGATCTTTTGGTAAAATATCTTTTATTATCNAACTGG
TTATATTATTCGTAT

consensusID : consensus_10345#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 588
fasta sequence

                              [TTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTAT-GTGTATATTT-CTC-TCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGAC-AGTATTATAATCTTGTACGTTCAC-TTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTAAC-TTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTA-TCTCAGTATTT-TAATCAATGTAACTACTTGTGTTTGCCTACTTGTTTTTGTTTTCCGTTTCTAAACAGCTTTCTAACTATAAACGTACTAATGGTGTTCACAATAGTTATTTATATTGGGGATAGGTGATCTTTTTGTGTTAAAAATAATCTTTTTTTATTTATTCAGAATCATGTGTATATTAATTTATATCAGTAAATAAAATGA]

[-] EMBL CD073066             [TTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTAT GTGTATATTT CTC TCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGAC AGTATTATAATCTTGTACGTTCAC TTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTAAC TTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTA TCTCAGTATTT TAATCAATGTAACTACTTGTGTTTGCCTACTTGTTTTTGTTTTCCGTTTCTAAACAGCTTTCTAACTATAAACGTACTAATGGTGTTCACAATAGTTATTTATATTGGGGATAGGTGATCTTTTTGTGTTAAAAATAATCTTTTTTTATTTATTCAGAATCATGTGTATATTAATTTATATCAGTAAATAAAATGA]
[+] EMBL BF440120             [                                                                                                      AACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTATNGTGTATATTT CTCNTCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACCGNATNCTTTTATTnc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BF440123             [                                                                                                      AACATCCCTTGTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTAT GTGTATATTTCCTC TCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD072932             [                                                                                                                                           AATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCATTTATATGTAATAGGATATGTGTGTAT GTGTATATTT CTC TCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGAC AGTATTATAATCTTGTACGTTCAC TTGATAATATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTAAC TTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTA TCTCAGTATTT TAATCAATGTAACTACTTGTGTTTGCCTACTTGTTTTTGTTTTCCGTTTCTAAACAGCTTTCTAACTATAAACGTACTAATGGTGTTCACAATAGTTATTTATATTGGGGATAGGTGATCTTTTTGTGTTAAAAATAATCTTTTTTTATTTATTCAGAATCATGTGTATATTAATTTATATCAGTAAATAAAATGA]
[+] EMBL AA883029             [                                                                                                                                                                                                                                                GCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACTAGTATTATAATCTTGTACGTTCACTTTGATATTATTATTA TTTTTCTTTATGCAATATGAATATA TAACATTGGGAATA CTTCTCTTGCTTAATTACTCT AGTATTTGTAATCtaag                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AA999401             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTCAGTATTT TAATCAATGTAACTACTTGTGTTTGCCTACTTGTTTTTGTTTTCCGTTTCTAAACAGCTTTCTAACTATAAACGTACTAATGGTGTTCACAATAGTTATTTATATTGGGGATAGGTGATCTTTTTGTGTTAAAAATAATCTTTTTTTATTTATTCAGAATCATGTGTATATTAATTTATATCAGTAAATAAAATGA]




>consensus_10345#1
TTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATATGATCTTTC
CTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTTGTTGTTGT
TGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCATTTATATGT
AATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGTTATTCTACCGCA
TCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTATAATCTTGT
ACGTTCACTTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTAACTTGGCA
ATATCTTCTCTTGCTTAATTATCTCAGTATTTTAATCAATGTAACTACTTGTGTTTGCCT
ACTTGTTTTTGTTTTCCGTTTCTAAACAGCTTTCTAACTATAAACGTACTAATGGTGTTC
ACAATAGTTATTTATATTGGGGATAGGTGATCTTTTTGTGTTAAAAATAATCTTTTTTTA
TTTATTCAGAATCATGTGTATATTAATTTATATCAGTAAATAAAATGA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10345#0      GCGGAACACTGAAAATACGAAGTCATGGTTGTGGATGTTTATATATCATCAACCTCAGGA 60
consensus_10345#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10345#0      AATACAAAAGTCAAAAGTAGACAACAATATATTATAAACATACTTAGCGCAGCCAAGATA 120
consensus_10345#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10345#0      CCCTTTGAAGTAAAAGATATATCATCCTCAGAGACTGACAAACAATTTATGTTCAAGGCT 180
consensus_10345#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10345#0      CTCGAAGAAAACGGGAAAACAGTAATAGCTCCTCAGCTTTTTCTTGGATCGGAATACCTA 240
consensus_10345#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10345#0      GGGGATTATGATGAATTTATTCAAGCTAATGAAAATGAAATGTTATTAGAATTTCTAAAA 300
consensus_10345#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10345#0      CTTAATGATTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATAT 360
consensus_10345#1      --------TTCATCACGTGCATCAAGTTTAGAAACTGAATCATAATTTATATATATATAT 52
                               ****************************************************

consensus_10345#0      GATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTT 420
consensus_10345#1      GATCTTTCCTTACTACTTTATTCAATAAATAAATCTATAAAGGGAAATGTAACATCCCTT 112
                       ************************************************************

consensus_10345#0      GTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCAT 480
consensus_10345#1      GTTGTTGTTGTTGTCATCGTTAACTAAAATTTTTTAAAAAAAACCTCTTTTGTATCCCAT 172
                       ************************************************************

consensus_10345#0      TTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGTTATT 540
consensus_10345#1      TTATATGTAATAGGATATGTGTGTATGTGTATATTTCTCTCTTTTGCTTTCTTTGTTATT 232
                       ************************************************************

consensus_10345#0      CTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTAT 600
consensus_10345#1      CTACCGCATCCTTTCATTGCCAGTTTTGGTGTTTATTATAACTTATCTTGACAGTATTAT 292
                       ************************************************************

consensus_10345#0      AATCTTGTACGTTCACTTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTA 660
consensus_10345#1      AATCTTGTACGTTCACTTGATATTATTATTATTTTTTCTTTATGCAATATGAATATATTA 352
                       ************************************************************

consensus_10345#0      ACTTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTATCTCAGTATTTTAATCAATGTAACTACTTGN 720
consensus_10345#1      ACTTGGCAATATCTTCTCTTGCTTAATTATCTCAGTATTTTAATCAATGTAACTACTTGT 412
                       *********************************************************** 

consensus_10345#0      GTTTGCCTACTTGGTTTTGNTTTCCGTTTCTAAACAGCTTCT--ACTATAA-CG-ACTA- 775
consensus_10345#1      GTTTGCCTACTTGTTTTTGTTTTCCGTTTCTAAACAGCTTTCTAACTATAAACGTACTAA 472
                       ************* ***** ********************    ******* ** **** 

consensus_10345#0      TGGTGT-CACA-TAGT-ATTAAT--TGGGGA--AGTGATCTTTTGGT----AAAATA-TC 823
consensus_10345#1      TGGTGTTCACAATAGTTATTTATATTGGGGATAGGTGATCTTTTTGTGTTAAAAATAATC 532
                       ****** **** **** *** **  ******   ********** **    ****** **

consensus_10345#0      TTTTATTATCNAACTGGT--------TATATTA-TTCGTAT--------------- 855
consensus_10345#1      TTTTTTTATTTATTCAGAATCATGTGTATATTAATTTATATCAGTAAATAAAATGA 588
                       **** ****  *    *         ******* **  ***