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Schistosoma mansoni
cluster # 10349 cluster # 10349       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10349#0 length = 1783 sequences # 15  

consensusID : consensus_10349#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 1783
fasta sequence
                              [CTCAACTTCGGTGTAGACAGTTCAATGCAAATAAATATTTCTGTTTTTGTCCTATTCCATGAACTGTTTGCAAACACTGCGACTTTTTCTAATTTGCAGTATCCATCTAAAGAAGCATCAACAATCCCAGTGGATCGAGACGGAATATTATCGACACAGGACTTTATCACAGCTTTGCATAAAATGGACCTAGAACTTTCCGTGGAGGAAGCACATTTTATTTTCCAGACTAACCATCTTCCATTGTCACTTTTCAGATCGGTACACACTGGAGCATCTACAAAATCGGTAAGTTACGTTTTTCCAAACCTAGTATTTTAGAATCCACTGGTTCACTGTAAACCTGGGACTTCGTCGTCTGTTGAGACTCGTGAAGTCGAAGTGAGTGCGAATCCGGATATATCGGTCAACGGTTTCCCCTGTCCTTCACCAACGTTTGCTACGGGGTTTCCGCCTATTTCCCCTACGGACTCATGGGTTGAGCAAAACAACCGATA-TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTT-AATCTAGATTCA-GATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG-TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAATTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGTTTAAATGATCTTCATCGTCGCGGGTCGCTCGATGATAACAAAGAGTTAATTAATATTGTACAATGTAATTCAAGCTCTGATTCTGAACTTGACTATAAGTTTGATCAAGAATATTCTATTCACTACAATAATCTTCAGAATTCAAGAAGTTTGAAGTTAGTCGACACANATAGCGTTATTCACACGTCTGGTAATTGGTCACTAGATTATAGTAAACTTTCAAGATTAGAACACATAAGAGTCCACTCAGAACCCATTGATAAGTCTCTAGACACAGAATCACAGATTCTTTATGATCAAAACTCGTTCAGCTTTTCTAATCCTAGAGACAATGTCTACGAAAAAAGTTCGTCTTCAACATGTTCCAATTCAGCAGTCAGCAAGCGATCTGATCGTTATATTCGCGATATTGATGTGCTTGAGGTTGCCGGAGTCCCATTTTCATATGAAGATGTCGTATACTCGACAAACGAAGAGTTTCGCCATCTGAGAGCCACTCGTGGTTTAAC-AGAGG--AACAACTAACAGCTATGTCGGATGCACGTAGACGAGCTACTAACCGTCAAGCGGCCGAACGATGTCGTCGTTCTAAGGTTGCTGCTCGTGATGAATTAGCAGAACGTCTGGCTGACCTTCGCTTACAAAGGCAGGCATTGAATAAGCGTCTCGTTAAGGCTCGTCAACGCAAACGTGATGCAAGAGATAACCTTACTGAAGAACAAAACCGTCTGTTGCACATGTTACATGACTCGAATGGTTGCACATTGAAACCTTCCGATTGGCGCATCCACTTAACTACAGAAGATGAAATTGTGGTTGTATCAGTTGGACATTAACTCTATAAAACCTTGCTTCTCAACTCCCAAAACAGTCTTTCACTTAACTTTCGCTATGTTTGCACACCTACTGTAGATATATTTT]

[-] EMBL CD062398             [CTCAACTTCGGTGTAGACAGTTCAATGCAAATAAATATTTCTGTTTTTGTCCTATTCCATGAACTGTTTGCAAACACTGCGACTTTTTCTAATTTGCAGTATCCATCTAAAGAAGCATCAACAATCCCAGTGGATCGAGACGGAATATTATCGACACAGGACTTTATCACAGCTTTGCATAAAATGGACCTAGAACTTTCCGTGGAGGAAGCACATTTTATTTTCCAGACTAACCATCTTCCATTGTCACTTTTCAGATCGGTACACACTGGAGCATCTACAAAATCGGTAAGTTACGTTTTTCCAAACCTAGTATTTTAGAATCCACTGGTTCACTGTAAACCTGGGACTTCGTCGTCTGTTGAGACTCGTGAAGTCGAAGTGAGTGCGAATCCGGATATATCGGTCAACGGTTTCCCCTGTCCTTCACCAACGTTTGCTACGGGGTTTCCGCCTATTTCCCCTACGGACTCATGGGTTGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD202589             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGTCCTTCACCAACGTTTGCTACGGGGTTTCCGCCTATTNNCCCTACGGACTCATGGGTTGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTGGATGCA CATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCACGTTTTAGTGAAAATACCAACAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD095085             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTGAGCAAAACACCCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTAGATTCAGGATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGCGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGGCGCGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAATTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGCTTAAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD095036             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTAGATTCA GATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAGCAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAATTAAGGAGAGAAAGTTCAAACAGTTTAAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD095252             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTAGATTCA GATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAATTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGTTTAAATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD094834             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTAGATTCA GATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAATTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGTTTAAATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD201394             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGCCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTAGATTCA GATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAATTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGTTTAAATGATCTTCATCGTCGCGGGTCGCTCGATGATAACAAAGAGTTAATTAATATTGTACAATGTAATTCAAGCTCTGATTCTGAACTTGACTATAAGTTTGATCAAGAATATTCTATTCACTACAATAATCTTCAGAATTCAAGAAGTTTGAAGTTAGTCGACACANATAGCGTTATTCACACGTCTGGTAATTGGTCACTAGATTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD201640             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGCCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTAGATTCA GATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAANAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD095184             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAGCAAAACAACCGATA TTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTT AATCTAGATTCA GATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTGTTGAGTCAG TTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAGAAACAGATCCTCAATTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGTTTAAATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD138279             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCAAAAACACCGATATTTCAGTTGACGCNCAATCTGTCTCCTNG TGTCTCTTNAATCTAGATTCA GATGAAGAAANAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCTTCTG TGAGTCAGTTTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCTTCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCATCATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCATGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAATTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGTTTAAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD123241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATAATCTTCAGAATCCAAGAAGTTTGAAGTTAGTCGACACAAATAGCGTTATTCACACGTCTGGTAATTGGTCACTAGATTATAGTAAACTTTCAAGATTAGAACACATAAGAGTCCACTCAGAACCCATTGATAAGTCTCTAGACACAGAATCACAGATTCTTTATGATCAAAACTCGTTCAGCTTTTCTAATCCTAGAGACAATGTCTACGAAAAAAGTTCGTCTTCAACATGTTCCAATTCAGCAGTCAGCAAGCGATCTGATCGTTATATTCGCGATATTGATGTGCTTGAGGTTGCCGGAGTCCCATTTTCATATGAAGATGTCGTATACTCGACAAACGAAGAGTTTCGCCATCTGAGAGCCACTCGTGGTTTAAC AGAGG  AACAACTAACAGCTATGTCGGATGCACGTAGACGAGCTACTAACCGTCAAGCGGCCGAACGATGTCGTCGTTCTAAGGTTGCTGCTCGTGATGAATTAGCAGAACGTCTGGCTGACCTTCGCTTACAAAGGCAGGCATTGAATAAGCGTCTCGTTAAGGCTCGTCAACGCAAACGTGATGCAAGAGA                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD139300             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTATAGTAAACTTTCAAGATTAGAACACATAAGAGTCCACTCAGAACCCATTGATAAGTCTCTAGACACAGAATCACAGATTCTTTATGATCAAAACTCGTTCAGCTTTTCTAATCCTAGAGACAATGTCTACGAAAAAAGTTCGTCTTCAACATGTTCCAATTCAGCAGTCAGCAAGCGATCTGATCGTTATATTCGCGATATTGATGTGCTTGAGGTTGCCGGAGTCCCATTTTCATATGAAGATGTCGTATACTCGACAAACGAAGAGTTTCGCCATCTGAGAGCCACTCGTGGTTTAACAAGAGGGAAACAACTAACAGCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD139343             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTATAGTAAACTTTCAAGATTAGAACACATAAGAGTCCACTCAGAACCCATTGATAAGTCTCTAGACACAGAATCACAGATTCTTTATGATCAAAACTCGTTCAGCTTTTCTAATCCTAGAGACAATGTCTACGAAAAAAGTTCGTCTTCAACATGTTCCAATTCAGCAGTCAGCAAGCGATCTGATCGTTATATTCGCGATATTGATGTGCTTGAGGTTGCCGGAGTCCCATTTTCATATGAAGATGTCGTATACTCGACAAACGAAGAGTTTCGCCATCTGAGAGCCACTCGTGGTTTAAC AGAGG  AACAACTAACAGCTATGTCGGATGCACGTAGACGAGCTACTAACCGTCAAGCGGCCGAACGATGTCGTCGTTCTAAGGTTGCTGCTCGTGATGAATTAGCAGAACGTCTGGCTGACCTTCGCTTACca                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD121066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAGTCCCATTTTCATATGAAGATGTCGTATACTCGACAAACGAAGAGTTTCGCCATCTGAGAGCCACTCGTGGTTTAAC AGAGG  AACca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD075041             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATGTCGGATGCACGTAGACGAGCTACTAACCGTCAAGCGGCCGAACGATGTCGTCGTTCTAAGGTTGCTGCTCGTGATGAATTAGCAGAACGTCTGGCTGACCTTCGCTTACAAAGGCAGACATTGAATAAGCGTCTCGTTAAGGCTCGTCAACGCAAACGTGATGCAAGAGATAACCTTACTGAAGAACAAAACCGTCTGTTGCACATGTTACATGACTCGAATGGTTGCACATTGAAACCTTCCGATTGGCGCATCCACTTAACTACAGAAGATGAAATTGTGGTTGTATCAGTTGGACATTAACTCTATAAAACCTTGCTTCTCAACTCCCAAAACAGTCTTTCACTTAACTTTCGCTATGTTTGCACACCTACTGTAGATATATTTT]


>consensus_10349#0 CTCAACTTCGGTGTAGACAGTTCAATGCAAATAAATATTTCTGTTTTTGTCCTATTCCAT GAACTGTTTGCAAACACTGCGACTTTTTCTAATTTGCAGTATCCATCTAAAGAAGCATCA ACAATCCCAGTGGATCGAGACGGAATATTATCGACACAGGACTTTATCACAGCTTTGCAT AAAATGGACCTAGAACTTTCCGTGGAGGAAGCACATTTTATTTTCCAGACTAACCATCTT CCATTGTCACTTTTCAGATCGGTACACACTGGAGCATCTACAAAATCGGTAAGTTACGTT TTTCCAAACCTAGTATTTTAGAATCCACTGGTTCACTGTAAACCTGGGACTTCGTCGTCT GTTGAGACTCGTGAAGTCGAAGTGAGTGCGAATCCGGATATATCGGTCAACGGTTTCCCC TGTCCTTCACCAACGTTTGCTACGGGGTTTCCGCCTATTTCCCCTACGGACTCATGGGTT GAGCAAAACAACCGATATTCAGTTGACGCCCAATCTGTCTCCTTGTTGTCTCTTAATCTA GATTCAGATGAAGAAAAAGCGACCTCCAGTTTACCAACAGCGTCCGGTCATAAAGTTTCT TCTGTTGAGTCAGTTAACAGTGAGGAAGTTTCTGTTCAAGAGACAAAAGTTGATCTACCT TCACATTCTACTGAACGTTCAAGAAATTGTTCAGGTTTTAGTGAAAATACAAACAATCAT CATCAGGTCTTAAAACCTTCGGGAAGCACTTTTACTATGCCGTTATCAGACAATAATTCA TGGATTTCAGATGTCGTGACACAGTCGGTGAACTATGTACATCGAAAAACAGATCCTCAA TTAAGGAGTGAAAGTTCAAACAGTTTAAATGATCTTCATCGTCGCGGGTCGCTCGATGAT AACAAAGAGTTAATTAATATTGTACAATGTAATTCAAGCTCTGATTCTGAACTTGACTAT AAGTTTGATCAAGAATATTCTATTCACTACAATAATCTTCAGAATTCAAGAAGTTTGAAG TTAGTCGACACANATAGCGTTATTCACACGTCTGGTAATTGGTCACTAGATTATAGTAAA CTTTCAAGATTAGAACACATAAGAGTCCACTCAGAACCCATTGATAAGTCTCTAGACACA GAATCACAGATTCTTTATGATCAAAACTCGTTCAGCTTTTCTAATCCTAGAGACAATGTC TACGAAAAAAGTTCGTCTTCAACATGTTCCAATTCAGCAGTCAGCAAGCGATCTGATCGT TATATTCGCGATATTGATGTGCTTGAGGTTGCCGGAGTCCCATTTTCATATGAAGATGTC GTATACTCGACAAACGAAGAGTTTCGCCATCTGAGAGCCACTCGTGGTTTAACAGAGGAA CAACTAACAGCTATGTCGGATGCACGTAGACGAGCTACTAACCGTCAAGCGGCCGAACGA TGTCGTCGTTCTAAGGTTGCTGCTCGTGATGAATTAGCAGAACGTCTGGCTGACCTTCGC TTACAAAGGCAGGCATTGAATAAGCGTCTCGTTAAGGCTCGTCAACGCAAACGTGATGCA AGAGATAACCTTACTGAAGAACAAAACCGTCTGTTGCACATGTTACATGACTCGAATGGT TGCACATTGAAACCTTCCGATTGGCGCATCCACTTAACTACAGAAGATGAAATTGTGGTT GTATCAGTTGGACATTAACTCTATAAAACCTTGCTTCTCAACTCCCAAAACAGTCTTTCA CTTAACTTTCGCTATGTTTGCACACCTACTGTAGATATATTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)