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consensusID : consensus_10354#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 918 fasta sequence
[CCTCCAGGCCAGAATTTGGCACGAGGCCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGGTTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAG-TCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA-CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA-ATGTTTTCTATCTTATAACATACTCTTATATATTTGACATGGTTTCGTGAAAAACTGAAAGTGCTATATTGTGTTATCTAATCTATAAATTTCAGTAATGG-ATTTTTATTAAGGCACACAGAAAATATATATGAACCTTGTTTAGT]
[+] EMBL CD080537 [CCTCCAGGCCAGAATTTGGCACGAGGCCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGGTTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAG TCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTANCTTTGAG TGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGNTACTACAAAAAGCATAGAATAAAT ATATTTGTCTAGATAAACG AATATGATAGACAGTTTTTAACTAACTCATTCACAANNTG TTTCTATCTTATAACATACTCTNATATATTTGACATGGTTNCGTGAAAAACTGAAAGNGCTATNATGNGGTATCTAATCTATAAANTTCAGNNATGGNATTTTTATTAAGGC CCCCG AAATTTTTATGAACCTTGTTTAGT]
[+] EMBL CD060159 [ ATCTCAGCTCATTAAGAGAACTGGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATGTTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCACATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCATCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTG ATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGA ]
[-] EMBL CD073119 [ CGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA ATGTTTTCTATCTTATAACATACTCTTATATATTTGACATGGTTTCGTGAAAAACTGAAAGTGCTATATTGTGTTATCTAATCTATAAATTTCAGTAATGG ATTTTTATTAAGGCACACAGAAAATATATATG ]
[-] EMBL CD196362 [ ATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA ATGTTTTCTATCT ]
[+] EMBL CD195018 [ ACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCACATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTG ATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTA ]
[+] EMBL AI764802 [ AGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTT ATGGAAATACAGCACATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTTTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGGATGGAAATTCCACAGAACAACTGGGATAC TACT TTTTAGGC GGTATTAAA ]
[+] EMBL BF936920 [ ATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTG ATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA ATGTTTTCTATCTTATAACATACTCTTATATATTTGACATGGTTTCGTGAAAAACTGAAAGTGCTATATTGTGTTATCTAATCTATAAATTTCAGTAATGG ATTTTTATTAAGGCACACAGAAAATATATATG ATCTTGTTTAGT]
consensusID : consensus_10354#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 767 fasta sequence
[GCGTCAACAGATCGAAGAGGATCGTAAAGTAAGGGAAGAAAAATGGTCACGACTGTATGGTTCACAACTTAAAACATCTGGTACTCCAGTTCATCCTCCACAAGAGTCTCTTCAGAGTTCGTCTTCCTCAGATGAGGTTCGGTTACAGTTAAAATCACTAGAAGGTGGTCGTATAATTCATCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGG-TTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAGTCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAANAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACA]
[+] EMBL CD183442 [GCGTCAACAGATCGAAGAGGATCGTAAAGTAAGGGAAGAAAAATGGTCACGACTGTATGGTTCACAACTTAAAACATCTGGTACTCCAGTTCATCCTCCACAAGAGTCTCTTCAGAGTTCGTCTTCCTCAGATGAGGTTCGGTTACAGTTAAAATCACTAGAAGGTGGTCGTATAATTCATCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGG TTTTTGCAGTTATATCCTAAAAG ]
[-] EMBL CD168177 [ TAA GGAAGAAAAATGGTCACGACTGTATGGTTCACAACTTAAAACATCTGGTACTCCAGTTCATCCTCCACAAGAGTCTCTTCAGAGTTCGTCTTCCTCAGATGAGGTTCGGTTACAGTTAAAATCACTAGAAGGTGGTCGTATAATTCATCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAA ]
[+] EMBL CD078656 [ TCAGATGAGGTTCGGTTACAGTTAAAATCACTAGAAGGTGGTCGTATAATTCATCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGG TTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAGTCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAANAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACA]
[-] EMBL CD183402 [ CACCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGG TTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAGTCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGA ]
[+] EMBL CD181274 [ TTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGG TTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAGTCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGNGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAG ]
[-] EMBL CD181784 [ TTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGG TTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAGTCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATGTTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGG ]
[-] EMBL CD181682 [ TTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGG TTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAGTCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCCCTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCttct ]
[-] EMBL CD181298 [ TTAAANATTTATTCTGNCAAGGA TCCGGTTTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAGTCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTC ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_10354#0 ------------------------------------------------------------
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consensus_10354#0 ------------------------------------------------------------
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consensus_10354#0 ----------------------------------CCTCCAGGCCAGAATTTGGCACGAGG 26
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* * ** * *
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***********************************************************
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consensus_10354#1 CTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTT 300
************************************************************
consensus_10354#0 TAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGGTTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGG 206
consensus_10354#1 TAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGGTTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGG 360
************************************************************
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************************************************************
consensus_10354#0 GTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGT 386
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************************************************************
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************************************************************
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*************************************************** ********
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***********************************************
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consensus_10354#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10354#0 ATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAG 746
consensus_10354#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_10354#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_10354#1 ----------------------------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||